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HNF4A

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HNF4A
PDBに登録とうろくされている構造こうぞう
PDBオルソログ検索けんさく: RCSB PDBe PDBj
PDBのIDコード一覧いちらん

1PZL, 3CBB, 3FS1, 4B7W, 4IQR

識別子しきべつし
記号きごうHNF4A, HNF4, HNF4a7, HNF4a8, HNF4a9, HNF4alpha, MODY, MODY1, NR2A1, NR2A21, TCF, TCF14, FRTS4, Hepatocyte nuclear factor 4 alpha, TCF-14
外部がいぶIDOMIM: 600281 MGI: 109128 HomoloGene: 395 GeneCards: HNF4A
遺伝子いでんし位置いち (ヒト)
20番染色体 (ヒト)
染色せんしょくたい20ばん染色せんしょくたい (ヒト)[1]
20番染色体 (ヒト)
HNF4A遺伝子の位置
HNF4A遺伝子の位置
バンドデータ開始かいしてん44,355,700 bp[1]
終点しゅうてん44,432,845 bp[1]
遺伝子いでんし位置いち (マウス)
2番染色体 (マウス)
染色せんしょくたい2ばん染色せんしょくたい (マウス)[2]
2番染色体 (マウス)
HNF4A遺伝子の位置
HNF4A遺伝子の位置
バンドデータ開始かいしてん163,348,728 bp[2]
終点しゅうてん163,414,830 bp[2]
RNA発現はつげんパターン




さらなる参照さんしょう発現はつげんデータ
遺伝子いでんしオントロジー
分子ぶんし機能きのう DNA結合けつごう
sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity
DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
zinc ion binding
金属きんぞくイオン結合けつごう
steroid hormone receptor activity
nuclear receptor activity
血漿けっしょうタンパク結合けつごう
transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding
受容じゅようたい結合けつごう
fatty acid binding
protein homodimerization activity
RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
細胞さいぼう構成こうせい要素ようそ 細胞さいぼうかく
細胞さいぼうしつ
核質かくしつ
生物せいぶつがくてきプロセス triglyceride homeostasis
ornithine metabolic process
phospholipid homeostasis
regulation of transcription, DNA-templated
SMAD protein signal transduction
glucose homeostasis
regulation of insulin secretion
脂質ししつ代謝たいしゃ
regulation of transcription by RNA polymerase II
signal transduction involved in regulation of gene expression
sex differentiation
凝固ぎょうこせん溶系
response to glucose
transcription, DNA-templated
positive regulation of transcription, DNA-templated
regulation of lipid metabolic process
intracellular receptor signaling pathway
regulation of growth hormone receptor signaling pathway
negative regulation of cell growth
lipid homeostasis
生体せいたい異物いぶつ代謝たいしゃプロセス
transcription initiation from RNA polymerase II promoter
regulation of gastrulation
steroid hormone mediated signaling pathway
positive regulation of transcription by RNA polymerase II
negative regulation of cell population proliferation
cholesterol homeostasis
type B pancreatic cell development
hepatocyte differentiation
regulation of circadian rhythm
negative regulation of transcription, DNA-templated
周期しゅうきてきプロセス
出典しゅってん:Amigo / QuickGO
オルソログ
たねヒトマウス
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq
(mRNA)
NM_000457
NM_001030003
NM_001030004
NM_001258355
NM_001287182

NM_001287183
NM_001287184
NM_175914
NM_178849
NM_178850

NM_008261
NM_001312906
NM_001312907

RefSeq
(タンパク質たんぱくしつ)
NP_000448
NP_001025174
NP_001025175
NP_001245284
NP_001274111

NP_001274112
NP_001274113
NP_787110
NP_849180
NP_849181

NP_001299835
NP_001299836
NP_032287

場所ばしょ
(UCSC)
Chr 20: 44.36 – 44.43 MbChr 20: 163.35 – 163.41 Mb
PubMed検索けんさく[3][4]
ウィキデータ
閲覧えつらん/編集へんしゅう ヒト閲覧えつらん/編集へんしゅう マウス

HNF4AまたはHNF4αあるふぁ(hepatocyte nuclear factor 4 alpha)、NR2A1(nuclear receptor subfamily 2, group A, member 1)は、ヒトではHNF4A遺伝子いでんしにコードされるかくない受容じゅようたいである[5][6]

機能きのう

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HNF4αあるふぁはホモりょうたいとしてDNAに結合けつごうする転写てんしゃ因子いんしであり、肝臓かんぞう遺伝子いでんし発現はつげん調節ちょうせつする転写てんしゃ因子いんしであるHNF1αあるふぁなど、いくつかの遺伝子いでんし発現はつげん制御せいぎょする。HNF4αあるふぁ肝臓かんぞう腎臓じんぞうちょう発生はっせい関与かんよしている。HNF4A遺伝子いでんしからは選択せんたくてきスプライシングにより、複数ふくすう転写てんしゃバリアントがしょうじる[7]

HNF4AはPXRCAR英語えいごばんかいしたCYP3A4転写てんしゃ活性かっせい必要ひつようである[8]HNF4A遺伝子いでんし変異へんいは、CYP2D6などHNF4αあるふぁ下流かりゅうタンパク質たんぱくしつ活性かっせい影響えいきょうあたえる[9][10]

アルカロイドの1しゅであるベルベリンは、HNF4Aの発現はつげんをアップレギュレーションする。

臨床りんしょうてき意義いぎ

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HNF4A遺伝子いでんし変異へんいは、若年じゃくねん発症はっしょう成人せいじんがた糖尿とうにょうびょう英語えいごばん(MODY)[11]とくMODY 1英語えいごばん関係かんけいしている。すくなくとも56種類しゅるい疾患しっかん原因げんいん変異へんいがこの遺伝子いでんしには発見はっけんされている[12]

大腸だいちょうがんではHNF4αあるふぁ増幅ぞうふく観察かんさつされる[13]

HNF4A遺伝子いでんしのミスセンス変異へんいは、ファンコーニ症候群しょうこうぐん表現ひょうげんがた出現しゅつげんとも関係かんけいしている[14]

相互そうご作用さよう

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HNF4αあるふぁつぎげる因子いんし相互そうご作用さようすることがしめされている。

出典しゅってん

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  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000101076 - Ensembl, May 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000017950 - Ensembl, May 2017
  3. ^ Human PubMed Reference:
  4. ^ Mouse PubMed Reference:
  5. ^ “Cloning and sequencing of cDNAs encoding the human hepatocyte nuclear factor 4 indicate the presence of two isoforms in human liver”. Gene 147 (2): 269–72. (Sep 1994). doi:10.1016/0378-1119(94)90079-5. PMID 7926813. 
  6. ^ “Human hepatocyte nuclear factor-4 (hHNF-4) gene maps to 20q12-q13.1 between PLCG1 and D20S17”. Human Genetics 99 (2): 233–6. (Feb 1997). doi:10.1007/s004390050345. PMID 9048927. 
  7. ^ Entrez Gene: HNF4A hepatocyte nuclear factor 4, alpha”. 2023ねん6がつ7にち閲覧えつらん
  8. ^ “The orphan nuclear receptor HNF4alpha determines PXR- and CAR-mediated xenobiotic induction of CYP3A4”. Nature Medicine 9 (2): 220–4. (Feb 2003). doi:10.1038/nm815. PMID 12514743. 
  9. ^ “Genetic polymorphism of hepatocyte nuclear factor-4alpha influences human cytochrome P450 2D6 activity”. Hepatology 48 (2): 635–45. (2008). doi:10.1002/hep.22396. PMID 18666237. 
  10. ^ “Effect of HNF4αあるふぁ genetic polymorphism G60D on the pharmacokinetics of CYP2D6 substrate tolterodine in healthy Korean individuals”. Pharmacogenetics and Genomics 23 (3): 175–9. (2013). doi:10.1097/FPC.0b013e32835de25e. PMID 23292115. 
  11. ^ “Roles of HNF1αあるふぁ and HNF4αあるふぁ in pancreatic βべーた-cells: lessons from a monogenic form of diabetes (MODY)”. Vitamins and Hormones 95: 407–23. (2014). doi:10.1016/B978-0-12-800174-5.00016-8. PMID 24559927. 
  12. ^ “Refinement of evolutionary medicine predictions based on clinical evidence for the manifestations of Mendelian diseases”. Scientific Reports 9 (1): 18577. (December 2019). Bibcode2019NatSR...918577S. doi:10.1038/s41598-019-54976-4. PMC 6901466. PMID 31819097. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6901466/. 
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  14. ^ “Proximal renal tubular acidosis with and without Fanconi syndrome”. Kidney Research and Clinical Practice 38 (3): 267–281. (September 2019). doi:10.23876/j.krcp.19.056. PMC 6727890. PMID 31474092. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6727890/. 
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関連かんれん文献ぶんけん

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関連かんれん項目こうもく

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外部がいぶリンク

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