Pfamデータベース
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Pfamデータベースは、 | |
キャプチャデータ |
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コンタクト | |
EBI | |
PMID 19920124 | |
アクセス | |
データフォーマット | ストックホルムフォーマット |
ウェブサイト |
pfam |
ダウンロードURL | FTP 1 FTP 2 |
ツール | |
その | |
ライセンス | GNU Lesser General Public License |
バージョン | 34.0 |
ブックマーク エンティティ | yes |
Pfamは、
用途
[Pfamデータベースの
Pfamウェブサイトでは、ユーザーが
Pfamはまた、
特徴
[Pfam
- ファミリーの
説明 を表示 する - マルチプルアラインメントを
表示 する タンパク質 ドメインの構造 を表示 する種 の分布 を調 べる他 のデータベースへのリンクをたどる既知 のタンパク質 の構造 を表示 する
エントリーには、ファミリー、ドメイン、リピート、モチーフなどの
Pfamファミリーの
リリース29.0の
新規 エントリーの作成
[ファミリーごとに、
ファミリーごとに、
機能 未知 ドメイン
[クラン
[クラン
歴史
[Pfamは、
Pfamが
Pfam-Aのエントリーはすべての
Pfamは
Pfamは、キュレーションにかかる
コミュニティキュレーション
[このような
エントリーの
Pfamは、3つのグループからなる
参照 項目
[生物 学 的 データベースの一覧 - Rfam
保存 された非 コードRNAファミリーのデータベース - TreeFam
動物 遺伝子 の系統 樹 のデータベース - TrEMBL
タンパク質 配列 の自動 アノテーションを行 うデータベース - InterPro
タンパク質 ドメインとタンパク質 ファミリーのデータベースの統合 - PDBfam
タンパク質 データバンク(PDB)の配列 へのPfamドメインの徹底的 な割 り当 て[24][25]
脚注
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