В 1744—1745 годах камчатские сборщики ясака столкнулись на Онекотане с представителем Японии Юсонти, который интересовался торговлей и разработкой рудников на [[Симушир]]е.
ВоВ 1760-х посланник камчатской администрации сотник [[Иван Чёрный (сотник)|Иван Чёрный]] заложил традицию порядкового исчисления островов и кучно расположенных субархипелагов Курильской гряды от Камчатки до Японии<ref name="fed">{{книга |автор= |часть= Журнал, или записка, учиненная казацким сотником Иваном Черным, бывшему на Курильских островах, даже до 19-го острова, путеследованию и усмотренным на оных примечаниях в разстоянии тех островов и живущих на оных народах и о прочем |ссылка часть= http://www.vostlit.info/Texts/Dokumenty/Reisen/XVIII/1740-1760/Issl_russ_tich_ok_XVIII/41-60/46.phtml?id=3846 |заглавие= Русские экспедиции по изучению северной части Тихого океана во второй половине XVIII в. |ссылка= |ответственный= Федорова Т. С., Глазунова Л. В., Федорова Г. Н. |место= М |издательство= Наука |год= 1989 |том= |страниц= |страницы= |серия= Исследования русских на Тихом океане в XVIII — первой половине XIX в. Том 2 |isbn= |ref= }}</ref>. Поэтому во времена гидрографических описаний конца XVIII—начала XIX веков остров также имел номерное обозначение в составе [[Курильские острова|Курильской гряды]] — '''Пятый'''<ref>{{cite web |author = |lang = ru |url = https://statehistory.ru/2796/Zamechaniya-o-Kurilskikh-ostrovakh-V--M--Golovnina--1811-god/ |deadlink = no |archive-url = https://web.archive.org/web/20170615065541/https://statehistory.ru/2796/Zamechaniya-o-Kurilskikh-ostrovakh-V--M--Golovnina--1811-god |archive-date = 2017-06-15 |title = «Замечания о Курильских островах» В. М. Головнина, 1811 год. История России. |publisher = statehistory.ru |access-date = 2017-06-02 }}</ref><ref>{{cite web |url = http://elcocheingles.com/Memories/Texts/Golovnin/Golovnin.htm |deadlink = no |archive-url = https://web.archive.org/web/20121121093438/http://elcocheingles.com/Memories/Texts/Golovnin/Golovnin.htm |archive-date = 2012-11-21 |title = Василий Михайлович Головнин (1776—1831) Записки флота капитана Головнина о приключениях его в плену у японцев |author = |lang = ru |website = «Российский мемуарий» |date = 2004 |publisher = elcocheingles.com |access-date = 2017-06-02 }}</ref>.
К концу XVIII века Онекотан рассматривался как российская территория, что и закрепил [[Симодский трактат]] 1855 года. Однако по [[Петербургский договор (1875)|договору]] 1875 года Онекотан вместе со всеми Курилами был передан во владение Японии в обмен на признание [[Сахалин]]а Российской территорией.
