ويتكون من ثلاث شعب:
1. شعبة الإعداد العلمي للبيانات ومهام هذه الشعبة:
o إدخال البيانات كما هي - دون تصرف - من الكتب الشرعية وقد تم إدخال (164) كتاباً عدد مجلداتها (400) مجلد.
o مقابلة ما أدخل في الحاسب مع المطبوع.
o التصحيح والمراجعة لهذه البيانات.
o الترميز والعنصرة الآلية وقد تم عنصرة وترميز (152) كتاباً عدد مجلداتها (364) كتاباً بعد تصحيحها.

2. شعبة الحاسب الآلي:
قام المهندسون المختصون في البرمجة بتحليل النظم وتصميم البرامج التي تخدم الباحثين.وقد تم تصميم وتنفيذ البرامج التالية:
1. برامج موسوعة الرواة والتقسيم الموضوعي، تم فصل موسوعة الرواة ليتم وضعها على قرص مدمج CD وتم تطوير البرامج وإضافة خدمات إلى موسوعة الرواة مثل: (البحث بكلمة من خلال النص - والقراءة من المصنفات بالكتاب والجزء والصفحة - وعرض معلومات الراوي من خلال الاختيار من بطاقة الراوي - وعرض معلومات الراوي من خلال الاختيار من الفهارس...) وتم عمل Setup لموسوعة الرواة.
2. برامج بناء قواعد بيانات موسوعة المتون تحت بيئة النوافذ 98.
3. نظام العرض النهائي والربط بين الموسوعات وتشمل:
- برامج الاستعلام اللفظي تحت بيئة النوافذ 98.
- برامج الاستعلام بالطرف تحت بيئة النوافذ 98.
- برامج الاستعلام بدلالة الموضوع من خلال قاعدة بيانات التقسيم الموضوعي
- برامج استخلاص الأحاديث المرتبط بموضوعمعين.
- برامج البحث في الشجرة الموضوعية بدلالة رقمالموضوع.
- برامج الاستعلام عن الموضوعات المرتبطة بحديثمعين
- برامج الاستعلام بعناصر اسم الراوي.
- برنامج عرض تراجم الرواة.
- برامج عرض مرويات راوٍ معين
- برامج عرض المصادر الخاصة بموضوع معين .
4. برامج الإخراج الطباعي الخاصة بالتقسيم الموضوعي.
5. نظام الاستعلام بالجذر:
o تنفيذ برنامج لطباعة الكلمات بالتشكيل وجذورها.
o تنفيذ برنامج لإدخال جذور كلمات الكتب التسعة.
o تنفيذ برنامج لاستعراض كلمات الكتب التسعة وجذورها.
6. برامج خدمية متفرّقة.
7. تم تعديل مجموعة من البرامج لتتوافق مع متطلبات الموسوعات المتجددة.
8. برنامج التمييز الآلي المساعد في تمييز الرواة.
9. برنامج إدخال الآية والسورة إلى قواعد بيانات التقسيم الموضوعي.
10. برامج التقسيم الموضوعي لموسوعة المتون.
كما تم إضافة برامج أخرى إلى برنامج موسوعة المتون وهي:
- تحويل لغة المصدر لبرنامج موسوعة المتون من لغة C إلى لغة ++ وذلك للاستفادة من الإمكانيات الهائلة للغة ++ C في تصميمالبرامج
- برنامج تنفيذ خدمة البحث في الخلفية وبذلك لايشعر المستخدم بعملية البحث ويستطيع الاستفادة من خدمات البرنامج أثناء إجراء عمليةالبحث
- تسريع عملية البحث جداً -بحيث لا تستغرق أطولعملية بحث أكثر من عدة ثوان- خلال كتب الموسوعة
- توسيع إمكانية البحث خلال أطراف الأحاديث بحيثيمكن أن يكون البحث بمطابقة بداية الطرف أو بعدة كلمات متتالية خلال الطرف أو بعدةكلمات متباعدة خلال أي جزء من الطرف
- برنامج حفظ آخر نتائج بحث تمت سواء تم البحثعلى الطرف أو بكلمات أو بحث صرفي
- برنامج لنسخ نص الحديث من كتب الموسوعة لقاعدةبيانات الأحاديث
- إضافة محرر كلمات مبسط لموسوعة المتون تصميم برنامج التهيئة والتنزيل لموسوعة المتون (setup) وهذا يجعل البرنامج يعمل بصورة آلية فور إدخال المستخدم لقرص الليزر المضغوط الذي عليه البرنامج إلى سواقة تشغيل قرص الليزر وجميع هذه البرامج خضعت للمراجعة والتطوير كما أُعِدَّت برامج مساعدة للبرامج الرئيسية وذلك لزيادة كفاءتها.
وقد أجريت تجربة على (91000) ترجمة و(25000) رواية و(1200) عنواناً بجزئياتها في التقسيم الموضوعي تحتوي على (300) مجلد في العقيدة والتفسير. كما تم تجهيز برامج موسوعة الرواة على نظام شبكة ويندوز (2000).
11. إعداد برنامج فضائل المدينة النبوية.
تم الانتهاء من عمل برنامج خاص بكتاب الأحاديث الواردة في فضائل المدينة والبرنامج يساعد على تصفح الكتاب إلكترونياً بواسطة اسطوانة ليزر CD-ROM ،كما يستطيع القارئ الوصول إلى الأحاديث المذكورة في الكتاب أو أي مكان أو مسجد أو جبل ...إلخ خاص بالمدينة ورد ذكره في هذا الكتاب.

3. شعبة الصيانة والشبكات:
تقوم هذه الشعبة بتصميم شبكات المركز وتنفيذها وعمل صيانة لها . كما تقوم أيضاً بتركيب أنظمة التشغيل للأجهزة والشبكات والقيام بعمل صيانة وإصلاح لجميع أجهزة المركز.