أنشأ المركز قسم البحث العلمي لرصد ما كتب عن السنة والسيرة في العالم بجميع اللغات، وتوجيه الردود العلمية المناسبة على الحاقدين والمغرضين من المستشرقين وأعداء الإسلام وذلك بالروح العلمية الدقيقة، والحقائق الثابتة لدحض شبههم ومفترياتهم.
وقد وضع المركز في هذا المجال كتاباً كبيراً بعنوان (السيرة النبوية والمستشرقون) تعقب فيه كتابات المستشرق ويليم ميوير، والمستشرق دافيد مرغوليوث، والمستشرق منتغومري وات، وقد اختير هؤلاء الثلاثة من المستشرقين لأنهم من أبرز من تخصص في السيرة النبوية، وكتب عنها، وكتاباتهم حافلة بالافتراءات التي أثارها المستشرقون خلال القرنين الماضيين.
وكتب الكتاب المذكور باللغة الإنجليزية الأستاذ الدكتور / محمد مهر علي الباحث بالمركز – سابقاً - والحاصل على جائزة الملك فيصل العالمية.