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Y RNA

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Y RNA
Y RNAてきあずかそうきゅう結構けっこう以及保守ほしゅ序列じょれつ
识别
だいごう Y_RNA
Alt.だいごう Y1; Y2; Y3; Y5
Rfam RF00019
其他すうすえ
RNA类型 もといん
いき かく生物せいぶつ

Y RNAかかりいちしゅたんへん碼RNA。它是Ro60かくとうかく蛋白たんぱく顆粒かりゅうまとぐみぶんいち[1]ざい全身ぜんしんせいべにむらおおかみかさ患者かんじゃたい內,它是患者かんじゃ自身じしん抗體こうたいてき攻擊こうげき目標もくひょういち[2]。Y RNAたいDNA複製ふくせいらいせついたりせき重要じゅうよういんため它們のうあずか染色せんしょくしつおこり始點してん識別しきべつふくごうぶつ相互そうご作用さよう[3][4]

結構けっこう

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推測すいそくY RNAてき5'3'はしかいすりたたみ形成けいせいいち保守ほしゅてきくきがた結構けっこうやめ確認かくにんY RNAゆういちたん胞嘧啶(C)突出とっしゅつ,這個突出とっしゅつたいY RNAあずかRo蛋白たんぱくてき結合けつごういたりせき重要じゅうよう[5][6][7]

こうのう

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目前もくぜんやめY RNAゆうりょう大功たいこうのういち抑制よくせいRo60作爲さくいDNA複製ふくせいてきいちしゅおこりはじめ因子いんししつりょう保守ほしゅてきあずかRo60蛋白たんぱくてき結合けつごうてんてき突變人類じんるいY RNA仍然のう參與さんよDNA複製ふくせい[3],這說明せつめいあずかRo蛋白たんぱく結合けつごう以及けいどうDNA複製ふくせいY RNAてきりょうたね互不しょうてきこうのう。儘管Y RNAてき衍生小型こがたRNA大小だいしょうあずかほろRNA相當そうとうただし它們卻和ほろRNAざいこうのうじょう卻毫無關係むかんけい[8]

ちゅう自身じしん抗原こうげんRoしめぎしげる白色はくしょくあずかY RNA(しめぎしげる紅色こうしょくてきそう鏈區まつはし結合けつごう。另外,かえゆう一條いちじょうたん鏈RNA(しめぎしげる藍色あいいろ)(PDB: 1YVP [1]) (页面そん档备份そん互联网档あん[5]

Ro60抑制よくせい

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ざい自由じゆう狀態じょうたい,Ro蛋白質たんぱくしつかい與一よいち系列けいれつてきすりたたみ錯誤さくごてきRNA結合けつごう如摺たたみ錯誤さくごてき5SrRNA,這被みとめため(RNA)品質ひんしつひかえせいせいてきいちしゅ[9]あずかY RNAある另外てきRNA結合けつごうてきRoふくあい物的ぶってきあきらたい結構けっこう顯示けんじ,Ro蛋白質たんぱくしつあずかたん鏈RNAてき3'はしてき結合けつごう特異とくいせい相對そうたい較低。ただしY RNAあずかRo蛋白質たんぱくしつかえかいざいいちてん發生はっせい特異とくいせい結合けつごう,且該結合けつごうのう調ちょうひかえRoふくごうぶつあずか其他RNAてき結合けつごう[5]ざいDeinococcusなか自由じゆう狀態じょうたいてきRo蛋白たんぱくまたあずか參與さんよ23SrRNAてき成熟せいじゅく過程かてい[10]ざい該物しゅちゅう造成ぞうせいY RNAかけしつてき突變なみ致死ちし,Y RNAざいあずかRo蛋白たんぱく結合けつごうかい不穩ふおんじょう[10]

けいどうDNA複製ふくせい

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人類じんるいてきY RNAたいDNA複製ふくせい不可ふかあるかけてき[3]通過つうか生物せいぶつ化學かがくじょうてき分離ぶんり和重かずえ實驗じっけんにん們已證明しょうめいざい體外たいがい培養ばいようin vitroてき脊椎動物せきついどうぶつ細胞さいぼうてきかくなか,Y RNAたい染色せんしょくたいDNAてき複製ふくせい不可ふかしょうてき[3]。如果たい體外たいがい細胞さいぼうあるからだ內(in vivo細胞さいぼうちゅうてきY RNA進行しんこう特異とくいせいくだかいてきばなし麼DNA複製ふくせいかい抑制よくせい[3]科學かがくみとめためY RNA通過つうかさく同時どうじあずか染色せんしょくしつやわあずか複製ふくせいけいどう相關そうかんてき蛋白たんぱく包括ほうかつおこりはじめ識別しきべつふく合體がったい結合けつごう的中てきちゅうあいだたい發揮はっき作用さよう[4]

人類じんるい病理びょうりがくちゅう應用おうよう

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Y RNAざいいち些人るいしゅこぶちゅうしょ過度かどひょうたち狀態じょうたい,且爲細胞さいぼう增殖ぞうしょくしょ必需ひつじゅ[11]。Y染色せんしょくたいてきあずかほろRNA大小だいしょう相近すけちかてき小型こがた分解ぶんかい產物さんぶつ可能かのうあずか自體じたい免疫めんえきびょうとう病症びょうしょうゆうせき[12]

ぶん

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やめざいかくほそ胞與細菌さいきんちゅう發現はつげんりょう推定すいていためY RNARo蛋白質たんぱくしつてき物質ぶっしつ[6][13]人類じんるいおうゆう4しゅY RNA,分別ふんべつhY1、hY3、hY4,以及hY5[13]。另外,人體じんたい內也ゆう很多あずかY RNA相關そうかんてきかりもといん秀麗しゅうれいかくれ桿線ちゅうC. elegansのりゆう1しゅY RNA,めいためCeY RNA。該生物體ぶったい許多きょたsbRNA也被みとめため可能かのうあずかY RNAどうみなもと[14][15]こう輻射ふくしゃ奇異きい球菌きゅうきんDeinococcus radioduransへんいちしゅあずかRo蛋白たんぱくどうみなもとてき蛋白質たんぱくしつめいためrsr(Ro sixty related,ためだいろくあずかRoゆうせきてき)。ようUVとうたい該菌進行しんこう照射しょうしゃ誘導ゆうどうへん碼rsrてきもといんてきひょうたちざい該情きょうこう輻射ふくしゃ奇異きい球菌きゅうきんてききんたい內至しょうかい出現しゅつげん4しゅたんRNA,其中いちしゅRNA乎與Y RNA具有ぐゆうどうみなもとせい[16]

參考さんこう

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  1. ^ Y RNAs: recent developments. Adam E. Hall, Carly Turnbull, Tamas Dalmay. Biomolecular Concepts. 2013 January; 4(2):103-110. doi:10.1515/bmc-2012-0050.
  2. ^ Lerner, MR; Boyle JA; Hardin JA; Steitz JA. Two novel classes of small ribonucleoproteins detected by antibodies associated with lupus erythematosus. Science. 1981, 211 (4480): 400–402. PMID 6164096. doi:10.1126/science.6164096. 
  3. ^ 3.0 3.1 3.2 3.3 3.4 Christov CP, Gardiner TJ, Szüts D, Krude T. Functional Requirement of Noncoding Y RNAs for Human Chromosomal DNA Replication. Mol. Cell. Biol. 2006, 26 (18): 6993–7004. PMC 1592862可免费查阅. PMID 16943439. doi:10.1128/MCB.01060-06. 
  4. ^ 4.0 4.1 Zhang, AT; Langley, AR; Christov, CP; Kheir, E; Shafee, T; Gardiner, TJ; Krude, T. Dynamic interaction of Y RNAs with chromatin and initiation proteins during human DNA replication.. Journal of Cell Science. Jun 15, 2011, 124 (Pt 12): 2058–69. PMC 3104036可免费查阅. PMID 21610089. doi:10.1242/jcs.086561. 
  5. ^ 5.0 5.1 5.2 Stein, AJ; Fuchs G; Fu C; Wolin SL; Reinisch KM. Structural insights into RNA quality control: The Ro autoantigen binds misfolded RNAs via its central cavity. Cell. 2005, 121 (4): 529–537. PMC 1769319可免费查阅. PMID 15907467. doi:10.1016/j.cell.2005.03.009. 
  6. ^ 6.0 6.1 Teunissen SW, Kruithof MJ, Farris AD, Harley JB, Venrooij WJ, Pruijn GJ. Conserved features of Y RNAs: a comparison of experimentally derived secondary structures. Nucleic Acids Res. 2000, 28 (2): 610–9. PMC 102524可免费查阅. PMID 10606662. doi:10.1093/nar/28.2.610. 
  7. ^ Green, CD; Long KS; Shi H; Wolin SL. Binding of the 60-kDa Ro autoantigen to Y RNAs: evidence for recognition in the major groove of a conserved helix. RNA. 1998, 4 (7): 750–765. PMC 1369656可免费查阅. PMID 9671049. doi:10.1017/S1355838298971667. 
  8. ^ Biogenesis of Y RNA-derived small RNAs is independent of the microRNA pathway. Francisco Esteban Nicolas, Adam E. Hall, Tibor Csorba, Carly Turnbull, Tamas Dalmay. FEBS Letters. 2012 April; 586(8):1226-1230. doi:10.1016/j.febslet.2012.03.026.
  9. ^ Reinisch, KM; Wolin SL. Emerging themes in non-coding RNA quality control. Current Opinion in Structural Biology. 2007, 17 (2): 209–214. PMID 17395456. doi:10.1016/j.sbi.2007.03.012. 
  10. ^ 10.0 10.1 Chen X, Wurtmann EJ, Van Batavia J, Zybailov B, Washburn MP, Wolin SL. An ortholog of the Ro autoantigen functions in 23S rRNA maturation in D. radiodurans. Genes Dev. 2007, 21 (11): 1328–39. PMC 1877746可免费查阅. PMID 17510283. doi:10.1101/gad.1548207. 
  11. ^ Christov CP, Trivier E, Krude T. Noncoding human Y RNAs are overexpressed in tumours and required for cell proliferation. Br. J. Cancer. March 2008, 98 (5): 981–8. PMC 2266855可免费查阅. PMID 18283318. doi:10.1038/sj.bjc.6604254. 
  12. ^ Are the Ro RNP-associated Y RNAs concealing microRNAs? Y RNA-derived miRNAs may be involved in autoimmunity. Verhagen AP, Pruijn GJ. Bioessays. 2011 Sep;33(9):674-82. doi:10.1002/bies.201100048
  13. ^ 13.0 13.1 Perreault J, Perreault JP, Boire G. Ro-associated Y RNAs in metazoans: evolution and diversification. Mol. Biol. Evol. 2007, 24 (8): 1678–89. PMID 17470436. doi:10.1093/molbev/msm084. 
  14. ^ Van Horn, DJ; Eisenberg D; O'Brien CA; Wolin SL. Caenorhabditis elegans embryos contain only one major species of Ro RNP. RNA. 1995, 1 (3): 293–303. PMC 1369082可免费查阅. PMID 7489501. 
  15. ^ Boria I, Gruber AR, Tanzer A, et al. Nematode sbRNAs: Homologs of Vertebrate Y RNAs. J Mol Evol. March 2010, 70 (4): 346–58. PMID 20349053. doi:10.1007/s00239-010-9332-4. 
  16. ^ Chen, X; Quinn AM; Wolin SL. Ro ribonucleoproteins contribute to the resistance of Deinococcus radiodurans to ultraviolet irradiation. Genes Dev. 2000, 14 (7): 777–782. PMC 316496可免费查阅. PMID 10766734. doi:10.1101/gad.14.7.777. 

外部がいぶ連結れんけつ

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