B-DNA
(přesměrováno z B-forma)
B-DNA je nejčastější druh dvoušroubovice DNA, který za normálních podmínek v buňkách zcela převažuje. Blíží se tradičnímu Watson-Crickovskému modelu dvoušroubovice. Dvoušroubovice B-DNA je pravotočivá, na jednu otáčku připadá cca 10,5 párů bází a průměr dvoušroubovice činí 2 nm.[1] Některé další helikální formy jsou ve srovnání s B-DNA zcela minoritní, ačkoliv zřejmě za určitých okolností mohou vznikat i v buňkách.
![](https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/b/b1/A-DNA%2C_B-DNA_and_Z-DNA.png/220px-A-DNA%2C_B-DNA_and_Z-DNA.png)
![](https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/4/43/Bdna_cropped.gif/220px-Bdna_cropped.gif)
Porovnání s A-DNA a Z-DNA
editovatAtribut | A-DNA | B-DNA | Z-DNA |
Točivá tendence šroubovice (chiralita) | pravotočivá | pravotočivá | levotočivá |
Opakování | po každém páru | po každém páru | po každých dvou párech |
Otočení po každém opakování | 32,7° | 34,3° | -60°/2 páry |
Průměrný počet párů na jedno otočení šroubovice | 11 | 10,5 | 12 |
Sklon páru k ose | 20° | −1,2° | -9° |
Vzestup vůči ose na jeden pár | 2,3 Å (0,25 nm) | 3,32 Å (0,34 nm) | 3,8 Å (0,37 nm) |
Vzestup vůči ose na jednu otočku | 28,2 Å (2,82 nm) | 33,2 Å (3,32 nm) | 45,6 Å (4,56 nm) |
Průměr | 23 Å (2,3 nm) | 20 Å (2,0 nm) | 18 Å (1,8 nm) |
Konformace nukleosidu | anti | anti | C: anti, G: syn |
Konformace ribofuranózy | C3'-endo | C2'-endo | C: C2'-endo, G: C3'-endo |
Reference
editovat- ↑ Vladimir N. Potaman; Richard R. Sinden. DNA: Alternative Conformations and Biology. [s.l.]: Landes Bioscience, Madame Curie Bioscience Database, 2000-. Dostupné online.
Externí odkazy
editovat- Obrázky, zvuky či videa k tématu B-DNA na Wikimedia Commons