Während und in der Folge der Deportation kamen viele Karatschaier (nach einigen Schätzungen 50 %) ums Leben.<ref>Isabelle Kreindler ''The Soviet Deportated Nationalities: A Summary and an Update'', in: Soviet Studies, Vol 38, no 3, July 1986. p. 391</ref> Die Deportation der [[Karatschaier]], vorwiegend nach Sibirien, dauerte bis 1957 an; in dieser Zeit existierte die Republik nicht. 1957 wurden den Karatschaiern die Rückkehr gestattet und die Republik mit dem früheren Doppelnamen und den alten Grenzen als Autonome Oblast ([[Liste autonomer Gebiete der Sowjetunion|AO]]) im Bestand der [[Russische SFSR|Russischen SFSR]] wiederhergestellt. Mit Auflösung der [[Sowjetunion]] wurde sie zu einer Republik innerhalb Russlands. Staatsoberhaupt wurde der seit 1979 als Vorsitzender des Republiksowjets und 1990–1992 zugleich als Regierungschef amtierende [[Wladimir Chubijew]].
Im Vergleich zu Tschetschenien, Dagestan und Kabardino-Balkarien blieb die Teilrepublik KaratschaevoKaratschai-Tscherkessien von gewaltverbundenen politischen Erschütterungen der 1990-er Jahre verschont. Die Region wird in Russland daher meist als die "ruhige Republik" im unruhigen Nordkaukasus bezeichnet.<ref>{{Internetquelle|autor=Казенин, Константин|url=http://carnegie.ru/commentary/62652|titel=Село вместо города: как сохранили мир в Карачаево-Черкесии|werk=|hrsg=Московский центр Карнеги|datum=03.02.2016|zugriff=07.10.2017|sprache=Russisch}}</ref> Nach den Regionalpräsidentenwahlen in Karatschai-Tscherkessien 1999 drohte die Spaltung dieser autonomen Republik. Die den zahlreicheren Karatschaiern unterlegenen Tscherkessen und Abasinen wollen ihre eigene autonome Republik wieder errichten, die bereits bis 1957 bestanden hatte. Staatschef war bis 2003 Präsident [[Wladimir Magomedowitsch Semjonow|Wladimir Semjonow]], danach bis 2008 [[Mustafa Asret-Alijewitsch Batdyjew|Mustafa Batdyjew]]. Im August 2008 wurde [[Boris Safarowitsch Ebsejew|Boris Ebsejew]] – gemäß der russischen Verfassung auf Vorschlag Staatspräsident [[Dmitri Anatoljewitsch Medwedew|Dmitri Medwedews]] – zum neuen Präsidenten Karatschai-Tscherkessiens gewählt. Als Regierungschef führt [[Alik Chussenowitsch Kardanow|Alik Kardanow]] seit 2005 die Republik (bereits 2000–2003 Regierungschef). Im Februar 2011 wurde Raschid Temrezow zum neuen Staatschef von KaratschiKaratschai-Tscherkessien ernannt.<ref>{{Literatur|Titel=Пост главы Карачаево-Черкесии занял Рашид Темрезов|Online=http://www.ng.ru/regions/2011-03-02/6_cherkessk.html|Abruf=2017-10-07}}</ref>
