Ησημαία της Εσθονίας είναι τρίχρωμη και αποτελείται από τρεις ισομεγέθεις οριζόντιες λωρίδες, χρώματος μπλε (στην κορυφή, συμβολίζει τον ουρανό, τις λίμνεςκαιτηθάλασσα), μαύρου (γιατο έδαφος της χώρας καιτο εθνόσημο) καιλευκού (γιατην ευτυχία του λαού καιτο φως). Το κανονικό της μέγεθος είναι 105×165 εκατοστά. Στηνεσθονική αποκαλείται «sinimustvalge» («γαλανομελανόλευκη»), από τα χρώματα των λωρίδων. Υιοθετήθηκε ξανά στις 7 Αυγούστου 1990 (είχε υιοθετηθεί για πρώτη φορά το 1918-40 και ανεπίσημα το 1941-44).
Πρωτοεμφανίστηκε τη δεκαετία του 1880 ως η σημαία της Φοιτητικής Οργάνωσης τουΠανεπιστημίου του Τάρτου. Αφιερώθηκε στην έδρα του πάστορα της πόλης Ότεπε (Otepää) στις 4 Ιουνίου 1884. Σύντομα η σημαία ταυτίστηκε μετον εσθονικό εθνικισμό καιμετην ανακήρυξη της ανεξαρτησίας στις 24 Φεβρουαρίου1918 καθιερώθηκε ως εθνική σημαία (επίσημα στις 21 Νοεμβρίου 1918). Τον Ιούνιο του 1940 μετη σοβιετική εισβολή η σημαία απαγορεύτηκε. Υψώθηκε ξανά μετά την αποχώρηση των Ναζί από τοΤάλιν, το 1944. Έπειτα από τη δεύτερη σοβιετική εισβολή, η σημαία εξαφανίστηκε και πάλι καιδεν υψώθηκε ξανά παρά στις 24 Φεβρουαρίου 1989. Στις 7 Αυγούστου 1990 λίγο πριντην πλήρη ανεξαρτησία της χώρας, η σημαία έκανε ξανά την εμφάνισή της.
Το 2001 ο πολιτικός Κάαρελ Τάραντ (Kaarel Tarand) πρότεινε να αλλάξει η σημαία από τρίχρωμη σε ένα σχέδιο με σκανδιναβικού τύπου σταυρό μετα ίδια χρώματα.[1] Επίσης ο δημοσιογράφος Εέρικ-Νίιλες Κρος πρότεινε την αλλαγή της επίσημης ονομασίας του κράτους στα αγγλικά από EstoniaσεEstland (που είναι το όνομα της χώρας σε γερμανικές γλώσσες).[2] Καθώς η τρίχρωμη σημαία θεωρείται επίσημα το εθνικό σύμβολο, η πρόταση αυτή δεν είχε την υποστήριξη της πλειοψηφίας.