Ero sivun ”EC-numero” versioiden välillä
Siirry navigaatioon
Siirry hakuun
| [katsottu versio] | [katsottu versio] |
Poistettu sisältö Lisätty sisältö
p r2.5.4) (Botti poisti: en:EC number, sr:EC broj (hemija) |
Aiheesta muualla |
||
| (11 välissä olevaa versiota 9 käyttäjän tekeminä ei näytetä) | |||
| Rivi 2: | Rivi 2: | ||
==Historia== |
==Historia== |
||
Entsyymien nimeäminen on ollut sekavaa ja yleisesti käytetyt triviaalinimet eivät välttämättä kertoneet tarkasti entsyymin katalysoimasta reaktiosta. Niinpä [[International Union of Biochemistry and Molecular Biology|IUBMB]] perusti komitean selkeyttämään entsyymien nimeämistä. Komitean työn tuloksena valmistui vuonna 1961 ensimmäinen versio entsyymien luokittelusta, jossa entsyymit jaettiin kuuteen luokkaan niiden katalysoimien reaktioiden mukaan.<ref name="Biochemistry">{{Kirjaviite | Tekijä =Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer | Nimeke =Biochemistry, 6th Edition | Vuosi =2006 | Sivu = |
Entsyymien nimeäminen on ollut sekavaa ja yleisesti käytetyt triviaalinimet eivät välttämättä kertoneet tarkasti entsyymin katalysoimasta reaktiosta. Niinpä [[International Union of Biochemistry and Molecular Biology|IUBMB]] perusti komitean selkeyttämään entsyymien nimeämistä. Komitean työn tuloksena valmistui vuonna 1961 ensimmäinen versio entsyymien luokittelusta, jossa entsyymit jaettiin kuuteen luokkaan niiden katalysoimien reaktioiden mukaan.<ref name="Biochemistry">{{Kirjaviite | Tekijä =Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer | Nimeke =Biochemistry, 6th Edition | Vuosi =2006 | Sivu =236–237 |Julkaisija =W. H. Freeman and Company | Tunniste =ISBN 978-0-7167-8724-2 | Kieli ={{en}}}}</ref><ref name="classification">{{Verkkoviite | Osoite =http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/rules.html | Nimeke =Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse | Tekijä = | Tiedostomuoto = | Selite = | Julkaisu = | Ajankohta = | Julkaisupaikka = | Julkaisija =Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB) | Viitattu = 12.7.2011 | Kieli ={{en}} }}</ref> |
||
==EC-numeron muodostaminen== |
==EC-numeron muodostaminen== |
||
EC-numero koostuu Tunnuksesta EC ja neljästä luvusta, jotka erotetaan toisitaan pisteillä. Ensimmäinen numero kertoo pääluokan, johon entsyymi kuuluu ja |
EC-numero koostuu Tunnuksesta EC ja neljästä luvusta, jotka erotetaan toisitaan pisteillä. Ensimmäinen numero kertoo pääluokan, johon entsyymi kuuluu ja minkä tyyppistä reaktiota se katalysoi. Toinen numero kertoo alaluokan ja lisätietoa reaktiosta. Kolmas numero antaa lisätietoa reaktiosta ja neljäs numero kertoo substraattispesifisyyden.<ref name="Biochemistry" /><ref name="classification" /><ref>{{Kirjaviite | Tekijä =Torsten Schwede,Manuel Claude Peitsch | Nimeke =Computational structural biology | Vuosi =2008 | Sivu =193 |Julkaisija =World Scientific | Tunniste =ISBN 978-981-277-877-2 | www =http://books.google.fi/books?id=aZLpHRteWtIC&pg=PA192&dq=EC+number&hl=fi&ei=-QkcTtjqEsn5sgac782WBw&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=6&ved=0CEUQ6AEwBTgK#v=onepage&q=EC%20number&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu = 12.07.2011 | Kieli ={{en}}}}</ref> |
||
===Entsyymien pääluokat=== |
===Entsyymien pääluokat=== |
||
| Rivi 12: | Rivi 12: | ||
|- |
|- |
||
|-valign="top" |
|-valign="top" |
||
| '''EC1.x.x.x''' <br/>[[ |
| '''EC1.x.x.x''' <br/>[[Oksidoreduktaasit]] || [[Hapetus-pelkistysreaktio]] || AH + B → A + BH (<small>'''pelkistynyt'''</small>)<br /> A + O → AO (<small>'''hapettunut'''</small>) |
||
|- |
|- |
||
|-valign="top" |
|-valign="top" |
||
| '''EC2.x.x.x''' <br/>[[ |
| '''EC2.x.x.x''' <br/>[[Transferaasit]] || Ryhmänsiirto substraatilta toiselle ||AB + C → A + BC |
||
|- |
|- |
||
|-valign="top" |
|-valign="top" |
||
| '''EC3.x.x.x''' <br/>[[ |
| '''EC3.x.x.x''' <br/>[[Hydrolaasit]] || [[Hydrolyysi]] || AB + H<sub>2</sub>O → AOH + BH |
||
|- |
|- |
||
|-valign="top" |
|-valign="top" |
||
| '''EC4.x.x.x''' <br/>[[ |
| '''EC4.x.x.x''' <br/>[[Lyaasit]] || Eliminaatio muodostaen kaksoissidoksia tai renkaita, additio kaksoissidokseen || [X-A-B-Y] → [A=B + X-Y] |
||
|- |
|- |
||
|-valign="top" |
|-valign="top" |
||
| '''EC5.x.x.x''' <br/>[[ |
| '''EC5.x.x.x''' <br/>[[Isomeraasit]] || Isomerointi || AB → BA |
||
|- |
|- |
||
|-valign="top" |
|-valign="top" |
||
| '''EC6.x.x.x''' <br/>[[ |
| '''EC6.x.x.x''' <br/>[[Ligaasit]] || Substraattien välisen sidoksen muodostaminen [[ATP]]-molekyylin hydrolyysin vapauttaman energian avulla || X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi |
||
|} |
|} |
||
| Rivi 35: | Rivi 35: | ||
==Aiheesta muualla== |
==Aiheesta muualla== |
||
* [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ Enzyme nomenclature] IUBMB |
* [http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/ Enzyme nomenclature] IUBMB |
||
* [https://www.brenda-enzymes.org/ BRENDA Enzyme Database] {{en}} |
|||
{{Tynkä/Biologia}} |
{{Tynkä/Biologia}} |
||
| Rivi 40: | Rivi 41: | ||
[[Luokka:Entsyymit]] |
[[Luokka:Entsyymit]] |
||
[[Luokka:Bioinformatiikka]] |
[[Luokka:Bioinformatiikka]] |
||
[[ar:رقم التصنيف الأنزيمي]] |
|||
[[id:Nomor EC]] |
|||
[[bg:Класификация на ензими]] |
|||
[[ca:Nombre EC]] |
|||
[[cs:Číslo EC]] |
|||
[[da:EC-nummer]] |
|||
[[de:EC-Nummer]] |
|||
[[es:Número EC]] |
|||
[[fr:Nomenclature EC]] |
|||
[[gl:Número EC]] |
|||
[[ko:효소 번호]] |
|||
[[it:Classificazione EC]] |
|||
[[nl:EC-nummer]] |
|||
[[ja:EC |
|||
[[pl:Numer EC]] |
|||
[[pt:Número EC]] |
|||
[[ru:Шифр КФ]] |
|||
[[sl:Številka EC]] |
|||
[[sv:EC-nummer]] |
|||
[[tr:EC numarası]] |
|||
[[zh:EC |
|||
Nykyinen versio 25. syyskuuta 2023 kello 15.19
EC-numero (Enzyme Commission) on entsyymien katalysoimiin reaktioihin perustuva niiden luokitteluun käytettävä numerosarja.
Historia
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]Entsyymien nimeäminen on ollut sekavaa ja yleisesti käytetyt triviaalinimet eivät välttämättä kertoneet tarkasti entsyymin katalysoimasta reaktiosta. Niinpä IUBMB perusti komitean selkeyttämään entsyymien nimeämistä. Komitean työn tuloksena valmistui vuonna 1961 ensimmäinen versio entsyymien luokittelusta, jossa entsyymit jaettiin kuuteen luokkaan niiden katalysoimien reaktioiden mukaan.[1][2]
EC-numeron muodostaminen
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]EC-numero koostuu Tunnuksesta EC ja neljästä luvusta, jotka erotetaan toisitaan pisteillä. Ensimmäinen numero kertoo pääluokan, johon entsyymi kuuluu ja minkä tyyppistä reaktiota se katalysoi. Toinen numero kertoo alaluokan ja lisätietoa reaktiosta. Kolmas numero antaa lisätietoa reaktiosta ja neljäs numero kertoo substraattispesifisyyden.[1][2][3]
Entsyymien pääluokat
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]| Ryhmä[1][2] | Katalysoitu reaktio[1][2] | Tyypillinen reaktio |
| EC1.x.x.x Oksidoreduktaasit |
Hapetus-pelkistysreaktio | AH + B → A + BH (pelkistynyt) A + O → AO (hapettunut) |
| EC2.x.x.x Transferaasit |
Ryhmänsiirto substraatilta toiselle | AB + C → A + BC |
| EC3.x.x.x Hydrolaasit |
Hydrolyysi | AB + H2O → AOH + BH |
| EC4.x.x.x Lyaasit |
Eliminaatio muodostaen kaksoissidoksia tai renkaita, additio kaksoissidokseen | [X-A-B-Y] → [A=B + X-Y] |
| EC5.x.x.x Isomeraasit |
Isomerointi | AB → BA |
| EC6.x.x.x Ligaasit |
Substraattien välisen sidoksen muodostaminen ATP-molekyylin hydrolyysin vapauttaman energian avulla | X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi |
Lähteet
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]- ↑ a b c d Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer: Biochemistry, 6th Edition, s. 236–237. W. H. Freeman and Company, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2 (englanniksi)
- ↑ a b c d Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB). Viitattu 12.7.2011. (englanniksi)
- ↑ Torsten Schwede,Manuel Claude Peitsch: Computational structural biology, s. 193. World Scientific, 2008. ISBN 978-981-277-877-2 Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.07.2011). (englanniksi)
Aiheesta muualla
[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]- Enzyme nomenclature IUBMB
- BRENDA Enzyme Database (englanniksi)