EC-numero
EC-numero (Enzyme Commission) on entsyymien katalysoimiin reaktioihin perustuva niiden luokitteluun käytettävä numerosarja.
Historia
Entsyymien nimeäminen on ollut sekavaa ja yleisesti käytetyt triviaalinimet eivät välttämättä kertoneet tarkasti entsyymin katalysoimasta reaktiosta. Niinpä IUBMB perusti komitean selkeyttämään entsyymien nimeämistä. Komitean työn tuloksena valmistui vuonna 1961 ensimmäinen versio entsyymien luokittelusta, jossa entsyymit jaettiin kuuteen luokkaan niiden katalysoimien reaktioiden mukaan.[1][2]
EC-numeron muodostaminen
EC-numero koostuu Tunnuksesta EC ja neljästä luvusta, jotka erotetaan toisitaan pisteillä. Ensimmäinen numero kertoo pääluokan, johon entsyymi kuuluu ja minkätyyppistä reaktiota se katalysoi. Toinen Numero kertoo alaluokan ja lisätietoa reaktiosta. Kolmas numero antaa lisätietoa reaktiosta ja neljäs numero kertoo substraattispesifisyyden.[1][2][3]
Entsyymien pääluokat
| Ryhmä[1][2] | Katalysoitu reaktio[1][2] | Tyypillinen reaktio |
| EC1.x.x.x Oksidoreduktaasit |
Hapetus-pelkistysreaktio | AH + B → A + BH (pelkistynyt) A + O → AO (hapettunut) |
| EC2.x.x.x Transferaasit |
Ryhmänsiirto substraatilta toiselle | AB + C → A + BC |
| EC3.x.x.x Hydrolaasit |
Hydrolyysi | AB + H2O → AOH + BH |
| EC4.x.x.x Lyaasit |
Eliminaatio muodostaen kaksoissidoksia tai renkaita, additio kaksoissidokseen | [X-A-B-Y] → [A=B + X-Y] |
| EC5.x.x.x Isomeraasit |
Isomerointi | AB → BA |
| EC6.x.x.x Ligaasit |
Substraattien välisen sidoksen muodostaminen ATP-molekyylin hydrolyysin vapauttaman energian avulla | X + Y+ ATP → XY + ADP + Pi |
Lähteet
- ↑ a b c d Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko & Lubert Stryer: Biochemistry, 6th Edition, s. 236-237. W. H. Freeman and Company, 2006. ISBN 978-0-7167-8724-2 (englanniksi)
- ↑ a b c d Classification and Nomenclature of Enzymes by the Reactions they Catalyse Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry and Molecular Biology (NC-IUBMB). Viitattu 12.7.2011. (englanniksi)
- ↑ Torsten Schwede,Manuel Claude Peitsch: Computational structural biology, s. 193. World Scientific, 2008. ISBN 978-981-277-877-2 Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.07.2011). (englanniksi)
Aiheesta muualla
- Enzyme nomenclature IUBMB