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La production de peptides de grande taille par synthèse peptidique en phase solide (SPPS) tend à être limitée par des problèmes de faible solvatation ou de faible solubilité de fragments peptidiques protégés : même les procédés les plus sélectifs sont affectés par l'autoassemblage de segments peptidiques non protégés. La formation spontanée de feuillets β est notamment responsable d'une baisse significative de solvatation et de solubilité des précurseurs protéiques utilisés par SPPS Fmoc[1],[2].
L'une des méthodes permettant d'accroître la solvatation des peptides au cours de ces synthèses consiste à modifier certains résidus de sérine, de thréonine ou de cystéine pour former une pseudoproline qui altère les propriétés physicochimiques des chaînes peptidiques par l'introduction d'un coude qui empêche leur empilement en feuillets β. Ces pseudoprolines assurent à la fois la protection des chaînes latérales des résidus de sérine, de thréonine ou de cystéine à partir desquelles elles sont formées, et agissent également en favorisant la solubilisation des réactifs utilisés lors de la synthèse peptidique en phase solide. On procède de préférence à partir de dérivés de type Fmoc–Xaa–Oxa/Thz-OH plutôt que par formation d'une pseudoproline directement sur l'extrémité N-terminale de la chaîne polypeptidique en croissance car, dans ce dernier cas, les rendements sont trop faibles.
Notes et références
↑(en) Gabriele Tuchscherer, Arunan Chandravarkar, Marie-Stéphanie Camus, Jérémy Bérard, Karine Murat, Adrian Schmid, Richard Mimna, Hilal A. Lashuel et Manfred Mutter, « Switch-peptides as folding precursors in self-assembling peptides and amyloid fibrillogenesis », Peptide Science, vol. 88, no 2, , p. 239-252 (PMID17206626, DOI10.1002/bip.20663, lire en ligne)
↑(en) Thomas Haack et Manfred Mutter, « Serine derived oxazolidines as secondary structure disrupting, solubilizing building blocks in peptide synthesis », Tetrahedron Letters, vol. 33, no 12, , p. 1589-1592 (DOI10.1016/S0040-4039(00)91681-2, lire en ligne)