Jakoba
 | ||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 4 Jakobida-faj: Jakoba libera (ventrális), Stygiella incarcerata (ventrális), Reclinomonas americana (dorzális), Histiona aroides (ventrális)
| ||||||||||||
| Rendszertani besorolás | ||||||||||||
| ||||||||||||
| Szinonimák | ||||||||||||
| ||||||||||||
| Fajok | ||||||||||||
| ||||||||||||
| Hivatkozások | ||||||||||||
A Jakoba az Excavata génusza,[1][2] és 1 leírt fajt tartalmaz, a David J. Patterson által 1990-ben leírt Jakoba liberát,[3] és a holland algológus, miológus és lichenológus Jakoba Ruinenről lett elnevezve[4] (a korábban Jakoba incarcerata nevű faj neve Andalucia incarcerata lett, a Jakoba bahamensist formálisan nem írták le).[5]
Megjelenése és jellemzői
[szerkesztés]A Jakoba génusz tagjai a Jakobida rend kis bakterivor ostorosai rendből tengeri[6] és hipersós környezetekben.[5] Kétostoros szabadon úszó, 5-10
Ultraszerkezet
[szerkesztés]A Jakoba sejtalkotói nem különösen egyediek. Egy sejtmagvuk van az ostoralapokhoz közel, egy Golgi-készülékük, és a mitokondriális cristák laposak, így feltehetően más platikrisztát taxonokkal rokon. A mitokondriumok baktériumszerű genomjaik miatt keltenek jelentős érdeklődést. Kiderült, hogy a mitokondriális genomjuk sokkal több funkcionális gént tartalmaz más eukarióta csoportoknál, és a bakteriális RNS-polimerázt is megtarthatták, melyet más mitokondriummal rendelkező eukarióták esetén a virális váltott fel. A Jakobida mitokondriális genomja elsődlegesen összetett, mivel a bakteriális ősökhöz jobban hasonlít más ismert mitokondriumoknál.[8]
Életciklus
[szerkesztés]A Jakoba ivartalanul szaporodik kettéhasadással. Nem figyeltek meg esetében ivaros szaporodást vagy cisztaképzést.[6]
Molekuláris szekvencia
[szerkesztés]A Jakoba libera ATCC 50422 mitokondriális genomja 96,6 kbp méretű. A szekvenálás majdnem kész. 2012-ig 77 gént azonosítottak, egyikükben sincs intron. Az intergénikus régiók a genom mintegy 30%-át adják, és tandem ismétlődések csoportjait tartalmazzák, melyek egységhossza mintegy 20 bp. Mindkét DNS-szálon vannak átírt gének. A standard genetikai kód használatos transzlációra. A kódolt gének közé tartoznak a mitokondriális DNS-ben gyakran szereplők, például a nad1, 2, 3, 4, 4L, 5, 6, cob, cox1, 2, 3, atp6, 8, 9, valamint a nagy (rnl) és kis (rns) rRNS-gének, valamint több mint 22 tRNS-gén. Ezenkívül számos protisztákra jellemző, állatokra és gombákra nem jellemző gén is jelen van, ilyenek a nad7, 9, 11, az atp1, az rpl2, 5, 6, 14, 16 és az rps2-4, 11-14 és 19. Számos egyedi ORF is jelen van a J. libera mtDNS-ében. Számos mitokondriális génje ritka vagy nincs jelen más mitokondriális genomokban, de bakteriálisakban gyakori. Ilyen például a dpo, az rpoB, C, az rrn5, az rnpB, a tufA, a yejU–W, valamint számos riboszómásfehérje-gén. A génsorrend alapján a baktériumokban nem fellelhető csoportok a protomitokondrium baktériumoktól való kiválásával jelentek meg. Ilyenek például az sdh3–nad5 ötgénes csoport, az atp8-[trn]-rps4-atp9 és az nad11-nad1-cox11-cox3-tufA is.[9]
A Jakoba libera nem rendelkezik azonban bizonyos mitokondriálisan kódolt bakteriális génekkel, például két RNS-polimeráz génje, az rpoA és az rpoD nincs benne,[10] a Jakoba bahamensis mitokondriális genomja nem tartalmazza az rpl34 és rpl35 géneket.[10]
Kultúrák
[szerkesztés]Jelenleg 3 kultúraképzésre elérhető Jakoba libera-törzs van. Ezek nem növekedhetnek más fajokba tartozó élőlény nélkül, de kevés hozzáadott Klebsiella aerogenes esetén már igen.[6]
Hasonló nemzetségek
[szerkesztés]- Histiona: 2-3 faj
- Reclinomonas: 1 faj [11]
Malawimonas: 1 leírt faj
Jegyzetek
[szerkesztés]- ↑ Rodriquez-Ezpeleta, Naiara (2007. augusztus 1.). „Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans”. Current Biology 17 (16), 1420–1425. o. DOI:10.1016/j.cub.2007.07.036. PMID 17689961.
- ↑ Simpson, A. G. B., Patterson, D. J. (2001). „On core jakobids and excavate taxa: the ultrastructure of Jakoba incarcerata”. J. Euk. Microbial. 48, 480-492. o. DOI:10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183..x
- ↑ Patterson, D. J. 1990. Jakoba libera (Ruinen, 1938) a heterotrophic flagellate from deep oceanic sediments. Journal of the Marine Biological Association, U.K. 70: 381-393
- ↑ Burkhardt, Lotte. Eine Enzyklopädie zu eponymischen Pflanzennamen (pdf) (german nyelven), Berlin: Botanic Garden and Botanical Museum, Freie Universität Berlin. DOI: 10.3372/epolist2022 (2022). ISBN 978-3-946292-41-8
- ↑ a b Jakoba libera. The Tree of Life Web Project. [2011. szeptember 27-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2012. április 3.)
- ↑ a b c d e Jakoba. Protist Image Database. [2006. szeptember 22-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2012. április 3.)
- ↑ a b Jakoba libera. Encyclopedia of Life. (Hozzáférés: 2012. április 3.)
- ↑ Jakobida. The Tree of Life Web Project. [2019. november 29-i dátummal az eredetiből archiválva]. (Hozzáférés: 2012. április 13.)
- ↑ Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code. (Hozzáférés: 2012. április 3.)
- ↑ a b Gertraud Burger, Matthew W. Gray, Lise Forget, B. Franz Lang (2013. január 18.). „Strikingly Bacteria-Like and Gene-Rich Mitochondrial Genomes throughout Jakobid Protists”. Genome Biol Evol 5 (2), 418–438. o. DOI:10.1093/gbe/evt008. PMID 23335123. PMC 3590771.
- ↑ Introduction to the jakobid flagellates. Protist Image Database. (Hozzáférés: 2012. április 12.)