Dopo aver vinto le World Series 2017 come bench coach degli Houston Astros,[1] nell'ottobre 2017 venne nominato nuovo manager dei Boston Red Sox, con cui vinse nuovamente le World Series al suo primo anno di permanenza.[2] Il 14 gennaio 2020 venne licenziato dalla franchigia a seguito del suo coinvolgimento durante la stagione 2017 nello scandalo degli Houston Astros per rubare le chiamate dei ricevitori avversari.[3][4] Dopo una stagione di inattività, Cora tornò ad essere il manager degli stessi Red Sox dal 6 novembre 2020.[5]