AGAP2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
AGAP2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи AGAP2, CENTG1, GGAP2, PIKE, ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2
Зовнішні ІД OMIM: 605476 HomoloGene: 86815 GeneCards: AGAP2
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001122772
NM_014770
NM_023026
RefSeq (білок)
NP_001116244
NP_055585
NP_075415
Локус (UCSC) Хр. 12: 57.72 – 57.74 Mb н/д
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

AGAP2 (англ. ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 192 амінокислот, а молекулярна маса — 124 674[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSRGAGALQRRTTTYLISLTLVKLESVPPPPPSPSAAAVGAPGARGSEPR
DPGSPRGAEEPGKKRHERLFHRQDALWISTSSAGAGGAEPPALSPAPASP
ARPVSPAPGRRLSLWAAPPGPPLSGGLSPDSKPGGAPSSSRRPLLSSPSW
GGPEPEGRTGGGVPGSSSPHPGTGSRRLKVAPPPPAPKPCKTVTTSGAKA
GGGKGAGSRLSWPESEGKPRVKGSKSSAGTGASVSAAATAAAAGGGGSTA
STSGGVGAGAGARGKLSPRKGKSKTLDNSDLHPGPPAGSPPPLTLPPTPS
PATAVTAASAQPPGPAPPITLEPPAPGLKRGREGGRASTRDRKMLKFISG
IFTKSTGGPPGSGPLPGPPSLSSGSGSRELLGAELRASPKAVINSQEWTL
SRSIPELRLGVLGDARSGKSSLIHRFLTGSYQVLEKTESEQYKKEMLVDG
QTHLVLIREEAGAPDAKFSGWADAVIFVFSLEDENSFQAVSRLHGQLSSL
RGEGRGGLALALVGTQDRISASSPRVVGDARARALCADMKRCSYYETCAT
YGLNVDRVFQEVAQKVVTLRKQQQLLAACKSLPSSPSHSAASTPVAGQAS
NGGHTSDYSSSLPSSPNVGHRELRAEAAAVAGLSTPGSLHRAAKRRTSLF
ANRRGSDSEKRSLDSRGETTGSGRAIPIKQSFLLKRSGNSLNKEWKKKYV
TLSSNGFLLYHPSINDYIHSTHGKEMDLLRTTVKVPGKRPPRAISAFGPS
ASINGLVKDMSTVQMGEGLEATTPMPSPSPSPSSLQPPPDQTSKHLLKPD
RNLARALSTDCTPSGDLSPLSREPPPSPMVKKQRRKKLTTPSKTEGSAGQ
AEAKRKMWKLKSFGSLRNIYKAEENFEFLIVSSTGQTWHFEAASFEERDA
WVQAIESQILASLQCCESSKVKLRTDSQSEAVAIQAIRNAKGNSICVDCG
APNPTWASLNLGALICIECSGIHRNLGTHLSRVRSLDLDDWPRELTLVLT
AIGNDTANRVWESDTRGRAKPSRDSSREERESWIRAKYEQLLFLAPLSTS
EEPLGRQLWAAVQAQDVATVLLLLAHARHGPLDTSVEDPQLRSPLHLAAE
LAHVVITQLLLWYGADVAARDAQGRTALFYARQAGSQLCADILLQHGCPG
EGGSAATTPSAATTPSITATPSPRRRSSAASVGRADAPVALV

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Seki N., Ishikawa K., Tanaka A., Nomura N. (1996). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. V. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0161-KIAA0200) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1. DNA Res. 3: 17—24. PMID 8724849 DOI:10.1093/dnares/3.1.17
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Ahn J.-Y., Hu Y., Kroll T.G., Allard P., Ye K. (2004). PIKE-A is amplified in human cancers and prevents apoptosis by up-regulating Akt. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 101: 6993—6998. PMID 15118108 DOI:10.1073/pnas.0400921101
  • Nie Z., Fei J., Premont R.T., Randazzo P.A. (2005). The Arf GAPs AGAP1 and AGAP2 distinguish between the adaptor protein complexes AP-1 and AP-3. J. Cell Sci. 118: 3555—3566. PMID 16079295 DOI:10.1242/jcs.02486
  • Knobbe C.B., Trampe-Kieslich A., Reifenberger G. (2005). Genetic alteration and expression of the phosphoinositol-3-kinase/Akt pathway genes PIK3CA and PIKE in human glioblastomas. Neuropathol. Appl. Neurobiol. 31: 486—490. PMID 16150119 DOI:10.1111/j.1365-2990.2005.00660.x
  • Tang X., Feng Y., Ye K. (2007). Src-family tyrosine kinase fyn phosphorylates phosphatidylinositol 3-kinase enhancer-activating Akt, preventing its apoptotic cleavage and promoting cell survival. Cell Death Differ. 14: 368—377. PMID 16841086 DOI:10.1038/sj.cdd.4402011

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16921 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, Q99490 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]