APOBEC1

APOBEC1
Ідентифікатори
Символи	APOBEC1, APOBEC-1, BEDP, CDAR1, HEPR, apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600130 MGI: 103298 HomoloGene: 1243 GeneCards: APOBEC1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0010577 enzyme activator activity • hydrolase activity, acting on carbon-nitrogen (but not peptide) bonds, in cyclic amidines • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding • cytidine deaminase activity • RNA binding • каталітична активність • zinc ion binding • hydrolase activity • cytosine deaminase activity • зв'язування з іоном металу • protein domain specific binding • ribonucleoprotein complex binding • mRNA 3'-UTR AUえーゆー-rich region binding Клітинна компонента • клітинне ядро • нуклеоплазма • цитоплазма Біологічний процес • DNA cytosine deamination • cellular response to insulin stimulus • response to osmotic stress • mRNA processing • GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing • response to calcium ion • response to ethanol • regulation of cell population proliferation • response to zinc ion • defense response to virus • cytidine to uridine editing • response to gamma radiation • mRNA stabilization • DNA demethylation • lipoprotein metabolic process • lipoprotein transport • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • lipoprotein biosynthetic process • lipid metabolism • negative regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • positive regulation of mRNA modification • cytidine deamination • mRNA modification • triglyceride metabolic process • negative regulation of triglyceride metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	339	11810
Ensembl	ENSG00000111701	ENSMUSG00000040613
UniProt	P41238	P51908
RefSeq (мРНК)	NM_005889 NM_001304566 NM_001644	NM_001134391 NM_031159
RefSeq (білок)	NP_001291495 NP_001635 NP_005880	NP_001127863 NP_112436
Локус (UCSC)	Хр. 12: 7.65 – 7.67 Mb	Хр. 6: 122.55 – 122.58 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

APOBEC1 (англ. Apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 236 амінокислот, а молекулярна маса — 28 192.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSEKGPSTG		DPTLRRRIEP		WEFDVFYDPR		ELRKEACLLY		EIKWGMSRKI
WRSSGKNTTN		HVEVNFIKKF		TSERDFHPSM		SCSITWFLSW		SPCWECSQAI
REFLSRHPGV		TLVIYVARLF		WHMDQQNRQG		LRDLVNSGVT		IQIMRASEYY
HCWRNFVNYP		PGDEAHWPQY		PPLWMMLYAL		ELHCIILSLP		PCLKISRRWQ
NHLTFFRLHL		QNCHYQTIPP		HILLATGLIH		PSVAWR

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Hadjiagapiou C., Giannoni F., Funahashi T., Skarosi S.F., Davidson N.O. (1994). Molecular cloning of a human small intestinal apolipoprotein B mRNA editing protein. Nucleic Acids Res. 22: 1874—1879. PMID 8208612 DOI:10.1093/nar/22.10.1874
• Lau P.P., Zhu H.-J., Baldini A., Charnsangavej C., Chan L. (1994). Dimeric structure of a human apolipoprotein B mRNA editing protein and cloning and chromosomal localization of its gene. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 91: 8522—8526. PMID 8078915 DOI:10.1073/pnas.91.18.8522
• Fujino T., Navaratnam N., Scott J. (1998). Human apolipoprotein B RNA editing deaminase gene (APOBEC1). Genomics. 47: 266—275. PMID 9479499 DOI:10.1006/geno.1997.5110
• Lau P.P., Zhu H.J., Nakamuta M., Chan L. (1997). Cloning of an Apobec-1-binding protein that also interacts with apolipoprotein B mRNA and evidence for its involvement in RNA editing. J. Biol. Chem. 272: 1452—1455. PMID 8999813 DOI:10.1074/jbc.272.3.1452
• Lau P.P., Chang B.-H., Chan L. (2001). Two-hybrid cloning identifies an RNA-binding protein, GRY-RBP, as a component of apobec-1 editosome. Biochem. Biophys. Res. Commun. 282: 977—983. PMID 11352648 DOI:10.1006/bbrc.2001.4679
• Hirano K., Min J., Funahashi T., Baunoch D.A., Davidson N.O. (1997). Characterization of the human apobec-1 gene: expression in gastrointestinal tissues determined by alternative splicing with production of a novel truncated peptide. J. Lipid Res. 38: 847—859. PMID 9186903

Див. також

• Хромосома 12