CCDC78

CCDC78
Ідентифікатори
Символи	CCDC78, C16orf25, CNM4, JFP10, hsCcdc78, coiled-coil domain containing 78
Зовнішні ІД	OMIM: 614666 MGI: 2685784 HomoloGene: 105408 GeneCards: CCDC78
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	124093	381077
Ensembl	ENSG00000162004	ENSMUSG00000071202
UniProt	A2IDD5	D3Z5T1
RefSeq (мРНК)	NM_001031737 NM_173476 NM_001378030 NM_001378031 NM_001378033	NM_001165929
RefSeq (білок)	NP_001026907 NP_001364959 NP_001364960 NP_001364962	NP_001159401
Локус (UCSC)	Хр. 16: 0.72 – 0.73 Mb	Хр. 17: 26.01 – 26.01 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCDC78 (англ. Coiled-coil domain containing 78) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 438 амінокислот, а молекулярна маса — 48 521.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEHAATTGPR		PGPPSRRVEN		VVLRAKDWLP		GAPGGTAVWA		TSLEAEVPPD
LALNKEQQLQ		ISKELVDIQI		TTHHLHEQHE		AEIFQLKSEI		LRLESRVLEL
ELRGDGTSQG		CAVPVESDPR		HPRAAAQELR		HKAQVPGHSD		DHRFQVQPKN
TMNPENEQHR		LGSGLQGEVK		WALEHQEARQ		QALVTRVATL		GRQLQGAREE
ARAAGQRLAT		QAVVLCSCQG		QLRQAEAENA		RLQLQLKKLK		DEYVLRLQHC
AWQAVEHADG		AGQAPATTAL		RTFLEATLED		IRAAHRSREQ		QLARAARSYH
KRLVDLSRRH		EELLVAYRAP		GNPQAIFDIA		SLDLEPLPVP		LVTDFSHRED
QHGGPGALLS		SPKKRPGGAS		QGGTSEPQGL		DAASWAQIHQ		KLRDFSRSTQ
SWNGSGHSCW		SGPRWLKSNF		LSYRSTWTST		WAGTSTKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як біогенез та деградація війок, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, саркоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16