CHD9
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
CHD9 (англ. Chromodomain helicase DNA binding protein 9) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 897 амінокислот, а молекулярна маса — 326 022[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MTDPMMDFFD | DANLFGETLE | GLSDDAFVQP | GPVSLVDELN | LGAEFEPLHI | ||||
DSLNHVQGTP | THQKMTDFEQ | LNQFDSIKFH | HVNQSFGSPA | EHVLSPHSQF | ||||
NCSPIHPQNQ | PNGLFPDVSD | GSPMWGHQTA | TTISNQNGSP | FHQQGHSHSM | ||||
HQNKSFVAHH | DFALFQANEQ | QTQCTSLRSQ | QNRNNLNPGQ | NSLSQSKNFM | ||||
NVSGPHRVNV | NHPPQMTNAS | NSQQSISMQQ | FSQTSNPSAH | FHKCSSHQEG | ||||
NFNGPSPNMT | SCSVSNSQQF | SSHYSFSSNH | ISPNSLLQSS | AVLASNHTNQ | ||||
TLSDFTGSNS | FSPHRGIKQE | STQHILNPNT | SLNSNNFQIL | HSSHPQGNYS | ||||
NSKLSPVHMN | FPDPVDSGTQ | MGHFNDHVET | NGFSSLEENL | LHQVESQTEP | ||||
FTGLDPEDLL | QEGLLPHFDE | STFGQDNSSH | ILDHDLDRQF | TSHLVTRPSD | ||||
MAQTQLQSQA | RSWHSSFSNH | QHLHDRNHLC | LQRQPPSSKK | SDGSGTYTKL | ||||
QNTQVRVMSE | KKQRKKVESE | SKQEKANRII | SEAIAKAKER | GERNIPRVMS | ||||
PENFPTASVE | GKEEKKGRRM | KSKPKDKDSK | KTKTCSKLKE | KTKIGKLIIT | ||||
LGKKQKRKNE | SSDEISDAEQ | MPQHTLKDQD | SQKRRSNRQI | KRKKYAEDIE | ||||
GKQSEEEVKG | SMKIKKNSAP | LPGEQPLQLF | VENPSEEDAA | IVDKILSSRT | ||||
VKKEISPGVM | IDTEEFFVKY | KNYSYLHCEW | ATEEQLLKDK | RIQQKIKRFK | ||||
LRQAQRAHFF | ADMEEEPFNP | DYVEVDRVLE | VSFCEDKDTG | EPVIYYLVKW | ||||
CSLPYEDSTW | ELKEDVDLAK | IEEFEQLQAS | RPDTRRLDRP | PSNIWKKIDQ | ||||
SRDYKNGNQL | REYQLEGLNW | LLFNWYNRRN | CILADEMGLG | KTIQSITFLY | ||||
EILLTGIRGP | FLIIAPLSTI | ANWEREFRTW | TDINVVVYHG | SLISRQMIQQ | ||||
YEMYFRDSQG | RIIRGAYRFQ | AIITTFEMIL | GGCGELNAIE | WRCVIIDEAH | ||||
RLKNKNCKLL | EGLKLMNLEH | KVLLTGTPLQ | NTVEELFSLL | HFLEPLRFPS | ||||
ESTFMQEFGD | LKTEEQVQKL | QAILKPMMLR | RLKEDVEKKL | APKEETIIEV | ||||
ELTNIQKKYY | RAILEKNFSF | LSKGAGQTNV | PNLVNTMMEL | RKCCNHPYLI | ||||
KGAEEKILGE | FRDTYNPAAS | DFHLQAMIQS | AGKLVLIDKL | LPKMKAGGHK | ||||
VLIFSQMVRC | LDILEDYLIH | KRYLYERIDG | RVRGNLRQAA | IDRFSKPDSD | ||||
RFVFLLCTRA | GGLGINLTAA | DTCIIFDSDW | NPQNDLQAQA | RCHRIGQNKA | ||||
VKVYRLVTRN | SYEREMFDRA | SLKLGLDKAV | LQSMSGRESN | VGGIQQLSKK | ||||
EIEDLLRRGA | YGAIMEEEDE | GSKFCEEDID | QILLRRTKTI | TIESEGRGST | ||||
FAKASFVASG | NRTDISLDDP | NFWQKWAKKA | EIDIEAISGR | NSLVIDTPRI | ||||
RKQTRPFSAT | KDELAELSEA | ESEGDEKPKL | RRPCDRSNGY | GRTECFRVEK | ||||
NLLVYGWGRW | REILSHGRFK | RQLNEHDVEI | ICRALLAYCL | VHYRGDEKIK | ||||
GFIWDLITPT | EDGQTRELQN | HLGLSAPVPR | GRKGKKVKTQ | TSSFDIQKAE | ||||
WLRKYNPEQL | LQDEGYKKHI | KHHCNKVLLR | VRMLYYLKQE | VIGNECQKVF | ||||
DGVDASDIDV | WVPEPDHSEV | PAEWWDFDAD | KSLLIGVFKH | GYEKYNTIRA | ||||
DPALCFLERV | GKPDEKAVAA | EQRANDYMDG | DVEDPEYKPA | PAIFKDDIED | ||||
DVSSPGDLVI | ADGDGQLMEG | DKVYWPTQSA | LTTRLRRLIT | AYQRTNKNRQ | ||||
IQQIQPTFSV | PTSVMQPIYE | EATLNPKMAA | KIERQQRWTR | REEADFYRVV | ||||
STFGVVFDPD | RGQFDWTKFR | AMARLHKKTD | DSLEKYLYAF | MSMCRRVCRL | ||||
PSKEELVDPN | IFIQPITEER | ASRTLYRIEL | LRKVREQALR | HPQLFERLKL | ||||
CHPNPDLPVW | WECGPHDRDL | LIGAAKHGVS | RTDYHILRDP | ELSFMAAQRN | ||||
YSQSKMAHSR | TSTPLLQQYQ | VALSASPLTS | LPRLLDAKGI | ILEEMKVKSE | ||||
NLKEEPQSSE | EESMSSVETR | TLIKSEPVSP | KNGVLPQATG | DQKSGGKCET | ||||
DRRMVAARTE | PLTPNPASKK | PRVHKRGSES | SSDSDSDSER | SSCSSRSSSS | ||||
SSSSSCSHSR | SGSSSSSSSS | CSSASSSSSS | STSSSSSSSS | SSSEESDSDE | ||||
EEAQKRESTT | HMKAYDEESV | ASLSTTQDET | QDSFQMNNGT | PESAYILQGG | ||||
YMLAASYWPK | DRVMINRLDS | ICQTVLKGKW | PSARRSYDAN | TVASFYTTKL | ||||
LDSPGAATEY | SDPSVPTPPG | AGVKEEHDQS | TQMSKVKKHV | REKEFTVKIK | ||||
DEGGLKLTFQ | KQGLAQKRPF | DGEDGALGQQ | QYLTRLRELQ | SASETSLVNF | ||||
PKSIPVSGTS | IQPTLGANGV | ILDNQPIVKK | RRGRRKNVEG | VDIFFFNRNK | ||||
PPNHVSLGLT | SSQISTGINP | ALSYTQPQGI | PDTESPVPVI | NLKDGTRLAG | ||||
DDAPKRKDLE | KWLKEHPGYV | EDLGAFIPRM | QLHEGRPKQK | RHRCRNPNKL | ||||
DVNSLTGEER | VQLINRRNAR | KVGGAFAPPL | KDLCRFLKEN | SEYGVAPEWG | ||||
DVVKQSGFLP | ESMYERILTG | PVVREEVSRR | GRRPKSGIAK | ATAAAAAASA | ||||
TSVSGNPLLA | NGLLPGVDLT | TLQALQQNLQ | NLQSLQVTAG | LMGMPTGLPS | ||||
GGEAKNMAAM | FPMLLSGMAG | LPNLLGMGGL | LTKPTESGTE | DKKGSDSKES | ||||
EGKTERTESQ | SSENGGENSV | SSSPSTSSTA | ALNTAAAANP | LALNPLLLSN | ||||
ILYPGMLLTP | GLNLHIPTLS | QSNTFDVQNK | NSDLGSSKSV | EVKEEDSRIK | ||||
DQEDKGGTEP | SPLNENSTDE | GSEKADASSG | SDSTSSSSED | SDSSNED |
Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
- Shur I., Benayahu D. (2005). Characterization and functional analysis of CReMM, a novel chromodomain helicase DNA-binding protein. J. Mol. Biol. 352: 646—655. PMID 16095617 DOI:10.1016/j.jmb.2005.06.049
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
- Hendriks I.A., Treffers L.W., Verlaan-de Vries M., Olsen J.V., Vertegaal A.C. (2015). SUMO-2 orchestrates chromatin modifiers in response to DNA damage. Cell Rep. 10: 1778—1791. PMID 25772364 DOI:10.1016/j.celrep.2015.02.033
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:25701 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}
: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q3L8U1 (англ.) . Архів оригіналу за 16 вересня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
Це незавершена стаття про білки. Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її. |
На цю статтю не посилаються інші статті Вікіпедії. Будь ласка розставте посилання відповідно до прийнятих рекомендацій. |