COBL

COBL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4PL8
Ідентифікатори
Символи	COBL, cordon-bleu WH2 repeat protein
Зовнішні ІД	OMIM: 610317 MGI: 105056 HomoloGene: 9058 GeneCards: COBL
Онтологія гена Молекулярна функція • actin monomer binding • actin binding Клітинна компонента • цитоплазма • dendritic growth cone • cell projection • мембрана • ruffle • клітинна мембрана • axonal growth cone • аксон • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • cell cortex • мікрофіламент • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет Біологічний процес • positive regulation of ruffle assembly • somite specification • actin filament network formation • notochord development • embryonic axis specification • positive regulation of dendrite development • floor plate development • actin filament polymerization • neural tube closure • collateral sprouting in absence of injury • liver development • digestive tract development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23242	12808
Ensembl	ENSG00000106078	ENSMUSG00000020173
UniProt	O75128	Q5NBX1
RefSeq (мРНК)	NM_001287436 NM_001287438 NM_015198 NM_001346441 NM_001346442 NM_001346443 NM_001346444	NM_001282993 NM_001282994 NM_172496 NM_001401095 NM_001401096 NM_001401097 NM_001401098 NM_001401099 NM_001401100
RefSeq (білок)	NP_001274365 NP_001274367 NP_001333370 NP_001333371 NP_001333372 NP_001333373 NP_056013	NP_001269922 NP_001269923 NP_766084 NP_001388024 NP_001388025 NP_001388026 NP_001388027 NP_001388028 NP_001388029
Локус (UCSC)	Хр. 7: 51.02 – 51.32 Mb	Хр. 11: 12.19 – 12.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

COBL (англ. Cordon-bleu WH2 repeat protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 7-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 261 амінокислот, а молекулярна маса — 135 617.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDAPRASAAK		PPTGRKMKAR		APPPPGKAAT		LHVHSDQKPP		HDGALGSQQN
LVRMKEALRA		STMDVTVVLP		SGLEKRSVLN		GSHAMMDLLV		ELCLQNHLNP
SHHALEIRSS		ETQQPLSFKP		NTLIGTLNVH		TVFLKEKVPE		EKVKPGPPKV
PEKSVRLVVN		YLRTQKAVVR		VSPEVPLQNI		LPVICAKCEV		SPEHVVLLRD
NIAGEELELS		KSLNELGIKE		LYAWDNRRET		FRKSSLGNDE		TDKEKKKFLG
FFKVNKRSNS		KGCLTTPNSP		SMHSRSLTLG		PSLSLGSISG		VSVKSEMKKR
RAPPPPGSGP		PVQDKASEKV		SLGSQIDLQK		KKRRAPAPPP		PQPPPPSPLI
PNRTEDKEEN		RKSTMVSLPL		GSGSHCSPDG		APQVLSEAEE		TVSVGSCFAS
EDTTEDSGVM		SSPSDIVSLD		SQQDSMKYKD		KWATDQEDCS		DQDLAGTPDL
GPQKSPLWEK		NGSENSHLRT		EKAVTASNDE		EDLLIAGEFR		KTLAELDEDL
EEMEDSYETD		TSSLTSSIHG		ASNHCPQDAM		IPHGDTDAIP		VTFIGEVSDD
PVDSGLFSNR		NNNAGSFDSE		GVASRRDSLA		PLQAEHSQPH		EKAREEVPAL
HPASHDVGKG		IRVALSNISK		DGNLMETAPR		VTSFASNLHT		DNLNAKVKDK
VYGCADGERT		QATERVNSQP		VNEKDSNDKN		AALAPTSWHQ		RGQNPGKSYR
LKHGLTTYKI		IPPKSEMRCY		DRDVSLSTGA		IKIDELGNLV		SPHATGIRII
SLSSSVPEAE		SQPIGKVREF		WRCNSVEKHL		GRPSESSARG		PPSTPVPTQT
QNPESRLQAD		PKPISPQQKS		AHHEGRNPLG		EGRNQPPTMG		MGHVRVPAAH
TTEVTFLKPQ		RRTSSQYVAS		AIAKRIGAPK		VHADVVRPHG		YAEKGYAGKA
PVLAAPPVTV		KDDRTSSPHS		ETQGWKDGAQ		WPCVTPPNNH		GEDLAVGAPP
RGEVIGPHRK		LSTQDRPAAI		HRSSCFSLVQ		SSQRDRVSVG		QSCGFSGKQS
TSSQEASSAS		EPRRAPDGTD		PPPPHTSDTQ		ACSRELVNGS		VRAPGHGEPS
HPPGGSGTES		HILLEREEKP		SVFSTDGNET		DSIWPPSIFG		PKKKFKPVVQ
RPVPKDTSLH		SALMEAIHSA		GGKDRLRKTA		EHTGEGRPAK		LSYTEAEGER
SALLAAIRGH		SGTCSLRKVA		SSASEELQSF		RDAALSAQGS		ESPLLEDLGL
LSPPAIPPPP		PPPSQALSAP		RTASRFSTGT		LSNTADARQA		LMDAIRSGTG
AARLRKVPLL		V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних відростках.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Husson C., Renault L., Didry D., Pantaloni D., Carlier M.F. (2011). Cordon-Bleu uses WH2 domains as multifunctional dynamizers of actin filament assembly. Mol. Cell. 43: 464—477. PMID 21816349 DOI:10.1016/j.molcel.2011.07.010

Див. також

• Хромосома 7