NCOR2

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
NCOR2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи NCOR2, CTG26, N-CoR2, SMAP270, SMRT, SMRTE, SMRTE-tau, TNRC14, TRAC, TRAC-1, TRAC1, nuclear receptor corepressor 2
Зовнішні ІД OMIM: 600848 MGI: 1337080 HomoloGene: 31370 GeneCards: NCOR2
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_006312
NM_001077261
NM_001206654
NM_001253904
NM_001253905
NM_011424
RefSeq (білок)
NP_001070729
NP_001193583
NP_006303
NP_001193583.1
NP_001240833
NP_001240834
NP_035554
Локус (UCSC) Хр. 12: 124.32 – 124.57 Mb Хр. 5: 125.02 – 125.18 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

NCOR2 (англ. Nuclear receptor corepressor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 525 амінокислот, а молекулярна маса — 274 804[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MSGSTQPVAQTWRATEPRYPPHSLSYPVQIARTHTDVGLLEYQHHSRDYA
SHLSPGSIIQPQRRRPSLLSEFQPGNERSQELHLRPESHSYLPELGKSEM
EFIESKRPRLELLPDPLLRPSPLLATGQPAGSEDLTKDRSLTGKLEPVSP
PSPPHTDPELELVPPRLSKEELIQNMDRVDREITMVEQQISKLKKKQQQL
EEEAAKPPEPEKPVSPPPIESKHRSLVQIIYDENRKKAEAAHRILEGLGP
QVELPLYNQPSDTRQYHENIKINQAMRKKLILYFKRRNHARKQWEQKFCQ
RYDQLMEAWEKKVERIENNPRRRAKESKVREYYEKQFPEIRKQRELQERM
QSRVGQRGSGLSMSAARSEHEVSEIIDGLSEQENLEKQMRQLAVIPPMLY
DADQQRIKFINMNGLMADPMKVYKDRQVMNMWSEQEKETFREKFMQHPKN
FGLIASFLERKTVAECVLYYYLTKKNENYKSLVRRSYRRRGKSQQQQQQQ
QQQQQQQQQQPMPRSSQEEKDEKEKEKEAEKEEEKPEVENDKEDLLKEKT
DDTSGEDNDEKEAVASKGRKTANSQGRRKGRITRSMANEANSEEAITPQQ
SAELASMELNESSRWTEEEMETAKKGLLEHGRNWSAIARMVGSKTVSQCK
NFYFNYKKRQNLDEILQQHKLKMEKERNARRKKKKAPAAASEEAAFPPVV
EDEEMEASGVSGNEEEMVEEAEALHASGNEVPRGECSGPATVNNSSDTES
IPSPHTEAAKDTGQNGPKPPATLGADGPPPGPPTPPPEDIPAPTEPTPAS
EATGAPTPPPAPPSPSAPPPVVPKEEKEEETAAAPPVEEGEEQKPPAAEE
LAVDTGKAEEPVKSECTEEAEEGPAKGKDAEAAEATAEGALKAEKKEGGS
GRATTAKSSGAPQDSDSSATCSADEVDEAEGGDKNRLLSPRPSLLTPTGD
PRANASPQKPLDLKQLKQRAAAIPPIQVTKVHEPPREDAAPTKPAPPAPP
PPQNLQPESDAPQQPGSSPRGKSRSPAPPADKEAEKPVFFPAFAAEAQKL
PGDPPCWTSGLPFPVPPREVIKASPHAPDPSAFSYAPPGHPLPLGLHDTA
RPVLPRPPTISNPPPLISSAKHPSVLERQIGAISQGMSVQLHVPYSEHAK
APVGPVTMGLPLPMDPKKLAPFSGVKQEQLSPRGQAGPPESLGVPTAQEA
SVLRGTALGSVPGGSITKGIPSTRVPSDSAITYRGSITHGTPADVLYKGT
ITRIIGEDSPSRLDRGREDSLPKGHVIYEGKKGHVLSYEGGMSVTQCSKE
DGRSSSGPPHETAAPKRTYDMMEGRVGRAISSASIEGLMGRAIPPERHSP
HHLKEQHHIRGSITQGIPRSYVEAQEDYLRREAKLLKREGTPPPPPPSRD
LTEAYKTQALGPLKLKPAHEGLVATVKEAGRSIHEIPREELRHTPELPLA
PRPLKEGSITQGTPLKYDTGASTTGSKKHDVRSLIGSPGRTFPPVHPLDV
MADARALERACYEESLKSRPGTASSSGGSIARGAPVIVPELGKPRQSPLT
YEDHGAPFAGHLPRGSPVTTREPTPRLQEGSLSSSKASQDRKLTSTPREI
AKSPHSTVPEHHPHPISPYEHLLRGVSGVDLYRSHIPLAFDPTSIPRGIP
LDAAAAYYLPRHLAPNPTYPHLYPPYLIRGYPDTAALENRQTIINDYITS
QQMHHNAATAMAQRADMLRGLSPRESSLALNYAAGPRGIIDLSQVPHLPV
LVPPTPGTPATAMDRLAYLPTAPQPFSSRHSSSPLSPGGPTHLTKPTTTS
SSERERDRDRERDRDREREKSILTSTTTVEHAPIWRPGTEQSSGSSGSSG
GGGGSSSRPASHSHAHQHSPISPRTQDALQQRPSVLHNTGMKGIITAVEP
STPTVLRSTSTSSPVRPAATFPPATHCPLGGTLDGVYPTLMEPVLLPKEA
PRVARPERPRADTGHAFLAKPPARSGLEPASSPSKGSEPRPLVPPVSGHA
TIARTPAKNLAPHHASPDPPAPPASASDPHREKTQSKPFSIQELELRSLG
YHGSSYSPEGVEPVSPVSSPSLTHDKGLPKHLEELDKSHLEGELRPKQPG
PVKLGGEAAHLPHLRPLPESQPSSSPLLQTAPGVKGHQRVVTLAQHISEV
ITQDYTRHHPQQLSAPLPAPLYSFPGASCPVLDLRRPPSDLYLPPPDHGA
PARGSPHSEGGKRSPEPNKTSVLGGGEDGIEPVSPPEGMTEPGHSRSAVY
PLLYRDGEQTEPSRMGSKSPGNTSQPPAFFSKLTESNSAMVKSKKQEINK
KLNTHNRNEPEYNISQPGTEIFNMPAITGTGLMTYRSQAVQEHASTNMGL
EAIIRKALMGKYDQWEESPPLSANAFNPLNASASLPAAMPITAADGRSDH
TLTSPGGGGKAKVSGRPSSRKAKSPAPGLASGDRPPSVSSVHSEGDCNRR
TPLTNRVWEDRPSSAGSTPFPYNPLIMRLQAGVMASPPPPGLPAGSGPLA
GPHHAWDEEPKPLLCSQYETLSDSE

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Sande S., Privalsky M.L. (1996). Identification of TRACs (T3 receptor-associating cofactors), a family of cofactors that associate with, and modulate the activity of, nuclear hormone receptors. Mol. Endocrinol. 10: 813—825. PMID 8813722 DOI:10.1210/mend.10.7.8813722
  • Chen J.D., Evans R.M. (1995). A transcriptional co-repressor that interacts with nuclear hormone receptors. Nature. 377: 454—457. PMID 7566127 DOI:10.1038/377454a0
  • Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
  • Hauksdottir H., Farboud B., Privalsky M.L. (2003). Retinoic acid receptors beta and gamma do not repress, but instead activate target gene transcription in both the absence and presence of hormone ligand. Mol. Endocrinol. 17: 373—385. PMID 12554770 DOI:10.1210/me.2002-0340
  • Goodson M.L., Jonas B.A., Privalsky M.L. (2005). Alternative mRNA splicing of SMRT creates functional diversity by generating corepressor isoforms with different affinities for different nuclear receptors. J. Biol. Chem. 280: 7493—7503. PMID 15632172 DOI:10.1074/jbc.M411514200

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7673 (англ.) . Архів оригіналу за 2 квітня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9Y618 (англ.) . Архів оригіналу за 4 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]