NPTX2

NPTX2
Ідентифікатори
Символи	NPTX2, NARP, NP-II, NP2, neuronal pentraxin 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600750 MGI: 1858209 HomoloGene: 1892 GeneCards: NPTX2
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • carbohydrate binding • молекулярна функція Клітинна компонента • extracellular region • компонент клітини • клітинна мембрана • cytoplasmic side of plasma membrane • Філоподія • дендрит (нейробіологія) • growth cone • neuronal cell body • glutamatergic synapse Біологічний процес • associative learning • chemical synaptic transmission • neuron projection development • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4885	53324
Ensembl	ENSG00000106236	ENSMUSG00000059991
UniProt	P47972	O70340
RefSeq (мРНК)	NM_002523	NM_016789
RefSeq (білок)	NP_002514	NP_058069
Локус (UCSC)	Хр. 7: 98.62 – 98.63 Mb	Хр. 5: 144.48 – 144.49 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NPTX2 (англ. Neuronal pentraxin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 431 амінокислот, а молекулярна маса — 47 042.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLALLAASVA		LAVAAGAQDS		PAPGSRFVCT		ALPPEAVHAG		CPLPAMPMQG
GAQSPEEELR		AAVLQLRETV		VQQKETLGAQ		REAIRELTGK		LARCEGLAGG
KARGAGATGK		DTMGDLPRDP		GHVVEQLSRS		LQTLKDRLES		LEHQLRANVS
NAGLPGDFRE		VLQQRLGELE		RQLLRKVAEL		EDEKSLLHNE		TSAHRQKTES
TLNALLQRVT		ELERGNSAFK		SPDAFKVSLP		LRTNYLYGKI		KKTLPELYAF
TICLWLRSSA		SPGIGTPFSY		AVPGQANEIV		LIEWGNNPIE		LLINDKVAQL
PLFVSDGKWH		HICVTWTTRD		GMWEAFQDGE		KLGTGENLAP		WHPIKPGGVL
ILGQEQDTVG		GRFDATQAFV		GELSQFNIWD		RVLRAQEIVN		IANCSTNMPG
NIIPWVDNNV		DVFGGASKWP		VETCEERLLD		L

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, лектинами. Секретований назовні.

Література

• Hsu Y.-C., Perin M.S. (1995). Human neuronal pentraxin II (NPTX2): conservation, genomic structure, and chromosomal localization. Genomics. 28: 220—227. PMID 8530029 DOI:10.1006/geno.1995.1134
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kirkpatrick L.L., Matzuk M.M., Dodds D.C., Perin M.S. (2000). Biochemical interactions of the neuronal pentraxins. Neuronal pentraxin (NP) receptor binds to taipoxin and taipoxin-associated calcium-binding protein 49 via NP1 and NP2. J. Biol. Chem. 275: 17786—17792. PMID 10748068 DOI:10.1074/jbc.M002254200

Див. також

• Хромосома 7