SF3B1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
SF3B1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи SF3B1, Hsh155, MDS, PRP10, PRPF10, SAP155, SF3b155, splicing factor 3b subunit 1
Зовнішні ІД OMIM: 605590 MGI: 1932339 HomoloGene: 6696 GeneCards: SF3B1
Пов'язані генетичні захворювання
хронічний лімфолейкоз[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001005526
NM_001308824
NM_012433
NM_031179
RefSeq (білок)
NP_001005526
NP_001295753
NP_036565
н/д
Локус (UCSC) Хр. 2: 197.39 – 197.44 Mb Хр. 1: 54.99 – 55.03 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

SF3B1 (англ. Splicing factor 3b subunit 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 304 амінокислот, а молекулярна маса — 145 830[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAKIAKTHEDIEAQIREIQGKKAALDEAQGVGLDSTGYYDQEIYGGSDSR
FAGYVTSIAATELEDDDDDYSSSTSLLGQKKPGYHAPVALLNDIPQSTEQ
YDPFAEHRPPKIADREDEYKKHRRTMIISPERLDPFADGGKTPDPKMNAR
TYMDVMREQHLTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRW
DQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAKGSETPGATPG
SKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTE
RDTPGHGSGWAETPRTDRGGDSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGST
PVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLS
DEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTED
RTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLVDVDESTLSPEEQKERKIMKL
LLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERH
LLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNL
AKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALGIPSLLPFLKA
VCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQK
VRTISALAIAALAEAATPYGIESFDSVLKPLWKGIRQHRGKGLAAFLKAI
GYLIPLMDAEYANYYTREVMLILIREFQSPDEEMKKIVLKVVKQCCGTDG
VEANYIKTEILPPFFKHFWQHRMALDRRNYRQLVDTTVELANKVGAAEII
SRIVDDLKDEAEQYRKMVMETIEKIMGNLGAADIDHKLEEQLIDGILYAF
QEQTTEDSVMLNGFGTVVNALGKRVKPYLPQICGTVLWRLNNKSAKVRQQ
AADLISRTAVVMKTCQEEKLMGHLGVVLYEYLGEEYPEVLGSILGALKAI
VNVIGMHKMTPPIKDLLPRLTPILKNRHEKVQENCIDLVGRIADRGAEYV
SAREWMRICFELLELLKAHKKAIRRATVNTFGYIAKAIGPHDVLATLLNN
LKVQERQNRVCTTVAIAIVAETCSPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKS
LSFLFEYIGEMGKDYIYAVTPLLEDALMDRDLVHRQTASAVVQHMSLGVY
GFGCEDSLNHLLNYVWPNVFETSPHVIQAVMGALEGLRVAIGPCRMLQYC
LQGLFHPARKVRDVYWKIYNSIYIGSQDALIAHYPRIYNDDKNTYIRYEL
DYIL

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК. Локалізований у ядрі.

Література

[ред. | ред. код]
  • Das R., Zhou Z., Reed R. (2000). Functional association of U2 snRNP with the ATP-independent spliceosomal complex E. Mol. Cell. 5: 779—787. PMID 10882114 DOI:10.1016/S1097-2765(00)80318-4
  • Boudrez A., Beullens M., Waelkens E., Stalmans W., Bollen M. (2002). Phosphorylation-dependent interaction between the splicing factors SAP155 and NIPP1. J. Biol. Chem. 277: 31834—31841. PMID 12105215 DOI:10.1074/jbc.M204427200
  • Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 DOI:10.1017/S1355838202021088
  • Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155
  • Cavellan E., Asp P., Percipalle P., Oestlund Farrants A.-K. (2006). The WSTF-SNF2h chromatin remodeling complex interacts with several nuclear proteins in transcription. J. Biol. Chem. 281: 16264—16271. PMID 16603771 DOI:10.1074/jbc.M600233200
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Захворювання, генетично пов'язані з SF3B1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10768 (англ.) . Процитовано 6 лютого 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, O75533 (англ.) . Архів оригіналу за 25 березня 2017. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]