TIMP2

TIMP2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1BR9, 1GXD, 2TMP, 4ILW
Ідентифікатори
Символи	TIMP2, CSC-21K, DDC8, TIMP metallopeptidase inhibitor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 188825 MGI: 98753 HomoloGene: 2444 GeneCards: TIMP2
Пов'язані генетичні захворювання
	періодонтит, ожиріння
Онтологія гена
Молекулярна функція	• peptidase inhibitor activity; • GO:0048551 enzyme inhibitor activity; • зв'язування з іоном металу; • integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protease binding; • metalloendopeptidase inhibitor activity; • zinc ion binding;
Клітинна компонента	• growth cone; • extracellular region; • cell surface; • soma; • neuron projection; • екзосома; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • міжклітинний простір; • specific granule lumen; • tertiary granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• negative regulation of proteolysis; • response to cytokine; • negative regulation of peptidase activity; • positive regulation of adenylate cyclase activity; • GO:0010260 старіння людини; • extracellular matrix disassembly; • negative regulation of Ras protein signal transduction; • central nervous system development; • positive regulation of neuron differentiation; • response to hormone; • negative regulation of membrane protein ectodomain proteolysis; • positive regulation of MAPK cascade; • negative regulation of cell population proliferation; • negative regulation of mitotic cell cycle; • regulation of Rap protein signal transduction; • negative regulation of endopeptidase activity; • neutrophil degranulation; • negative regulation of metallopeptidase activity; • response to organic substance;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7077
	21858
	ENSG00000035862
	ENSMUSG00000017466
	P16035
	P25785
	NM_003255
	NM_011594
	NP_003246
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

TIMP2 (англ. TIMP metallopeptidase inhibitor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 220 амінокислот, а молекулярна маса — 24 399^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGAAARTLRL	ALGLLLLATL	LRPADACSCS	PVHPQQAFCN	ADVVIRAKAV
SEKEVDSGND	IYGNPIKRIQ	YEIKQIKMFK	GPEKDIEFIY	TAPSSAVCGV
SLDVGGKKEY	LIAGKAEGDG	KMHITLCDFI	VPWDTLSTTQ	KKSLNHRYQM
GCECKITRCP	MIPCYISSPD	ECLWMDWVTE	KNINGHQAKF	FACIKRSDGS
CAWYRGAAPP	KQEFLDIEDP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до інгібіторів протеаз, інгібіторів металоферментів. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Секретований назовні.

Література

Boone T.C., Johnson M.J., de Clerck Y.A., Langley K.E. (1990). cDNA cloning and expression of a metalloproteinase inhibitor related to tissue inhibitor of metalloproteinases. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2800—2804. PMID 2157214 DOI:10.1073/pnas.87.7.2800
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Osthues A., Knaueper V., Oberhoff R., Reinke H., Tschesche H. (1992). Isolation and characterization of tissue inhibitors of metalloproteinases (TIMP-1 and TIMP-2) from human rheumatoid synovial fluid. FEBS Lett. 296: 16—20. PMID 1730286 DOI:10.1016/0014-5793(92)80393-U
de Clerck Y.A., Darville M.I., Eeckhout Y., Rousseau G.G. (1994). Characterization of the promoter of the gene encoding human tissue inhibitor of metalloproteinases-2 (TIMP-2). Gene. 139: 185—191. PMID 8112602 DOI:10.1016/0378-1119(94)90753-6
Chattopadhyay N., Mitra A., Frei E., Chatterjee A. (2001). Human cervical tumor cell (SiHa) surface alphavbeta3 integrin receptor has associated matrix metalloproteinase (MMP-2) activity. J. Cancer Res. Clin. Oncol. 127: 653—658. PMID 11710594 DOI:10.1007/s004320100271
Morgunova E., Tuuttila A., Bergmann U., Tryggvason K. (2002). Structural insight into the complex formation of latent matrix metalloproteinase 2 with tissue inhibitor of metalloproteinase 2. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99: 7414—7419. PMID 12032297 DOI:10.1073/pnas.102185399

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з TIMP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11821 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P16035 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 17

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з TIMP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11821 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P16035 (англ.) . Архів оригіналу за 23 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

TIMP2

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук