In einer Zukunft, in der die Welt von Großkonzernen beherrscht wird, existieren Menschen mit Psi-Kräften, Esper genannt. Kai ist ein Esper und wird von der privaten militärischen Einheit AESES der Firma Ashurum aufgenommen, wo er mit anderen Esper-Kids ausgebildet wird, um die Menschheit mit Hilfe seiner Kräfte zu beschützten. Auch seine kleine Schwester Hikari befindet sich im Stützpunkt. Angeblich soll sie über enorme Kräfte verfügen, jedoch ist sie schwer krank. Nach einem Jahr hat Kai bei AESES Freunde und Feinde gefunden.
Schon bald sollen Kai und seine Esper-Kollegen einen gemeinsamen Einsatz in der Stadt Gald übernehmen. Da er niemanden verletzten will, weigert sich Kai, eine Waffe zu tragen. Zudem lässt er sich versichern, dass Zivilisten bei ihrem Angriff nicht zu Schaden kommen werden. Doch die Realität sieht anders aus: Um die Esper zu „unterstützen", bombardiert das Militär die Stadt.
Als Kai und seine Kollegin Ruri nachsehen wollen, ob sich tatsächlich noch Menschen in der Stadt befinden, wird Ruri getötet und Shin-Lu, die Schwester seines Rivalen Shen-Lon, schwer verletzt. Daraufhin liefern sich Kai und Shen-Lon einen erbitterten Zweikampf, der alles noch schlimmer macht: Shen-Lon sprengt den ganzen Stadtteil in die Luft.
Wenig später: Das Mädchen Asuka findet den schwer verletzten Kai am Strand und nimmt ihn mit nach Hause. Dort wird er von ihr und ihrem Vormund Yuuki gepflegt und mit einer anderen Wahrheit über Ashurum konfrontiert: Diese Firma rekrutiert Esper, um sie für ihre zwielichtigen Zwecke einzusetzen. Kai ist schockiert und will sofort nach Ashurum zurück – aber nach einer Gedenkzeit beschließt er, vorerst doch bei Yuuki zu bleiben. Doch Ashurum hat bereits einen Spion losgeschickt...
Kai lebt nun bei Yuuki und Asuka, und er freundet sich immer enger mit ihnen an. Wird Ashurum ihn finden und zurückholen? Was geschieht mit seiner Schwester, wenn er nicht zurückkehrt?

"E´S otherwise" erscheint komplett auf sechs DVDs bei ADV-Films mit deutscher Synchro.