遺伝子発現を
種々の
薬物や
機能蛋白で
刺激し mRNA を
産生させ、PCRによってその
効果を
観察する
方法は、
非常に
有効な
方法である
事を
報告してきた。
更に Antisense(As-)で mRNA の
翻訳を
抑制し、その
効果を
観察する
事によって、
細胞や
生体の
研究を、より
速く
正確に
行える
事も
報告してきた。
我々の
用いるファジィ
推理によるプライマーの
設計は、PCR-Primer や As-Primer の
設計において、
優れた
方法である。
従来の As-Primer のコンピュータによる
設計は、
成功率 10%-20%
程度と
言われ、あまり
高くないことが
知られていたが、
我々の
方法を(1. GC Contents Check; 2. Homology Check: [versus a.: GAPDH, b: Profilin, c:
β-actin]; 3. Self Homology Check;)
用いる
事により
成功率を 90% にまで
高めることが
出来ていた。この
論文ではファジィ
推理を
行うことで、4: プライマーの5'-と-3'のチェックを
加え、
更に5: ターゲットとする
遺伝子のファミリーとのホモロジーを
検査することによって、いっそう
特異性の
高い PCR-Primer を
設計できた (Fuzzy Deducing Check)。そして Gene Expression Programming (GEP)におけるアルコール
中毒ラットの
遺伝子発現を
示す。
結果として、ファミリーの
多い
遺伝子である VEGF の
検査において、
不特定のバンドを
消去する
事が
出来た。
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