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人ひと类蛋白しろ质组计划

人ひと类蛋白しろ质组计划（Human proteome project，缩写：HPP）[1]是ぜ由ゆかり人ひと类蛋白しろ质组组织（HUPO）[2]协调的てき合作がっさく计划，目もく标是通どおり过实验观察所有しょゆう从人ひと类基因いん组翻こぼし译序列じょれつ产生的てき蛋白たんぱく质。

人ひと类蛋白しろ质组计划
HUMAN PROTEOME PROJECT
内容ないよう
有ゆう機體きたい智さとし人じん
相關そうかん信しん息いき
研究けんきゅう中心ちゅうしん人ひと类蛋白しろ质组组织（HUPO）
实验室しつ多た个
访问入口いりくち
网站www.thehpp.org
www.c-hpp.org
網あみ絡からま服務ふくむ地ち址しNextProt REST
GPMDB REST
工具こうぐ
其他

历史

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人ひと类蛋白しろ质组组织已やめ成なり为许多た长期运行的てき蛋白たんぱく质组学がく研究けんきゅう项目的もくてき协调机つくえ构，这些研究けんきゅう项目与あずか临床兴趣的てき特定とくてい人体じんたい组织有ゆう关，如血ち浆[3]，肝きも[4]，脑[5]，和わ尿にょう[6]。它还负责与蛋白たんぱく质大规模研究けんきゅう相しょう关的具体ぐたい技わざ术[7]和かず标准[8]。

在ざい科学かがく文献ぶんけん中ちゅう，将はた平行へいこう于人ひと类基因いん组计划的てき一个更大项目的结构和目标被辩论[9][10][11][12][13]。经过2009年ねん、2010年ねん和わ2011年ねん世界せかい大会たいかい和わ一いち系列けいれつ会かい议，人にん类蛋白しろ质组组织将人まさと类蛋白しろ质组计划分ぶん为两个子项目C-HPP和わB/D-HPP进行[14]。其中C-HPP将しょう分ぶん成なり25工作こうさく组，每まい个人ひと类染色せんしょく体たい1个工作こうさく组。而B/D-HPP将はた按照蛋白たんぱく质的生物せいぶつ学がく和わ疾病しっぺい相しょう关性进行分ぶん组[15]。

项目和わ工作こうさく组

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当とう前ぜん设定的てき工作こうさく组列举如下か（取と自じwww.c-hpp.org （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）），按照染色せんしょく体たい顺序排はい序じょ。

染色せんしょく体たい 组长 所属しょぞく机つくえ构国家こっか或ある地区ちく
1 Fuchu He 中国ちゅうごく
2 Lydie Lane 瑞みず士し
3 Toshihide Nishimura 日本にっぽん
4 Yu Ju Chen 台湾たいわん
5 Rainer Bischoff 荷に兰
6 Paul Keown 加か拿大
7 Mark Baker 澳大利おおとし亚、新西しんにし兰
8 Pengyuan Yang 中国ちゅうごく
9 Je-Yoel Cho 韩国，汉城
10 Joshua Labaer 美国びくに
11 Jong Shin Yoo 韩国
12 Visith Thongboonkerd 印度いんど、新しん加か坡、台湾たいわん、泰たい国こく
13 Young Ki Paik 韩国
14 Jérôme Garin 法ほう国こく
15 Gilberto B Domont 巴ともえ西にし
16 Fernando Corrales 西にし班はん牙きば
17 Bill Hancock 美国びくに
18 Alex Archakov 俄にわか国こく
19 Gyorgy Marko Varga 瑞みず典てん
20 Siqiu Liu 中国ちゅうごく
21 Daniel Figeys 加か拿大
22 Charles Lee 美国びくに
X Tadashi Yamamoto 日本にっぽん
Y Hosseini Salekdeh 伊い朗ろう
MT Andrea Urbani 意い大利おおとし

计算资源

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由ゆかりEric Deutsch领导的てき、美国びくに西にし雅みやび图系统生物せいぶつ研究所けんきゅうじょ（PeptideAtlas（英えい语：PeptideAtlas））的てき小しょう组正在ざい提供ていきょう基もと于MS/MS的てき蛋白たんぱく质组学がく结果的てき数すう据すえ简化、分析ぶんせき和わ验证。与あずか抗体こうたい方法ほうほう相しょう关的数すう据すえ处理由りゆう在ざい瑞みず典てん斯德哥尔摩ま的てきKalle von Feilitzen（Human Protein Atlas）进行协调。在ざい瑞みず士し日内ひない瓦かわらSIB的てきLydie Lane负责整体せいたい整合せいごう和わ报告信しん息いき（NeXtProt（英えい语：NeXtProt））。生成せいせい的てき所有しょゆう数すう据すえ都と存そん入いれProteomeXchange（英えい语：ProteomeXchange）数かず据すえ库，作さく为HPP贡献的てき一いち部分ぶぶん。

现状

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正せい在ざい进行的てき按照染色せんしょく体たい为基础的人じん类蛋白しろ质组计划是ぜ《蛋白たんぱく质组研究けんきゅう杂志》（Journal of Proteome Research）特とく刊かん（2014年ねん1月がつ3日にち，第だい13卷かん，第だい1期き）的てき主しゅ题。整せい个项目的もくてき状じょう态是在ざい该期上じょう的てき社しゃ论讨论[16]。

一いち个单独どく的てきCHPP-维基 （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）已やめ经被该项目的もくてき生物せいぶつ信しん息いき学がく组建立こんりゅう维护当とう前ぜん项目的もくてき信しん息いき，包括ほうかつ会かい议、活かつ动、标准操作そうさ程ほど序じょ和わ其他特殊とくしゅ资源的てき个体染色せんしょく体たい团队。

与あずか蛋白たんぱく质观察相关的置おけ信しんじ水平すいへい的てき指ゆび标是本ほん项目的もくてき关键组成部分ぶぶん。如何いか定てい义对所しょ使用しよう的てき各かく种实验协议有意ゆうい义的指ゆび标是正ぜせい在ざい进行的てき辩论的てき主しゅ题：目前もくぜん的てき共きょう识度量りょう已やめ经被发布[17]。

描述项目最新さいしん状じょう况的杂志文章ぶんしょう，并宣布せんぷ推出“Missing ProteinPedia”可か以在这里被ひ发现[18][19]。

参まいり阅

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参考さんこう资料

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  1. ^ Legrain, P. et al. The human proteome project: Current state and future direction. Mol Cell Proteomics. 10:M111.009993 (2011).
  2. ^ HUPO (Human Proteome Organization) 1st World Congress. Mol Cell Proteomics. 9:651-752 (2002).
  3. ^ Omenn, G.S. et al. Overview of the HUPO Plasma Proteome Project. Proteomics. 5, 3226-45 (2005).
  4. ^ He, F. Human liver proteome project: plan, progress, and perspectives. Mol Cell Proteomics. 4, 1841-8 (2005).
  5. ^ Hamacher, M. et al. HUPO Brain Proteome Project: toward a code of conduct. Mol Cell Proteomics. 7, 457 (2008).
  6. ^ Yamamoto, T., Langham, R.G., Ronco, P., Knepper, M.A. & Thongboonkerd, V. Towards standard protocols and guidelines for urine proteomics. Proteomics. 8, 2156-9 (2008).
  7. ^ Uhlen, M. & Ponten, F. Antibody-based proteomics for human tissue profiling. Mol Cell Proteomics. 4, 384-93 (2005).
  8. ^ Orchard, S. et al. Current status of proteomic standards development. Expert Rev Proteomics. 1, 179-83 (2005).
  9. ^ Archakov A, et al. The Moscow HUPO Human Proteome Project workshop. Mol Cell Proteomics. 8:2199-200 (2009).
  10. ^ Baker MS. Building the 'practical' human proteome project - the next big thing in basic and clinical proteomics. Curr Opin Mol Ther. 2009 11:600-2 (2009).
  11. ^ Editorial, The call of the human proteome. Nat Methods. 7:661 (2010).
  12. ^ Rabilloud T., et al. Is a gene-centric human proteome project the best way for proteomics to serve biology? Proteomics. 10:3067-72 (2010).
  13. ^ Editorial. A Gene-centric Human Proteome Project. Mol Cell Proteomics. 9:427-429 (2010).
  14. ^ Paik, Y-K., et al. A Chromosome-Centric Human Proteome Project to Characterize the Sets of Proteins Encoded in the Genome. Nature Biotech.30: 221–3(2012).
  15. ^ Aebersold R., et al. The Biology/Disease-driven Human Proteome Project (B/D-HPP): Enabling Protein Research for the Life Sciences Community. J. Proteome Res. 12:23–27 (2013).
  16. ^ Paik Y-K., et al. Genome-wide Proteomics, Chromosome-centric Human Proteome Project (C-HPP), Part II. J. Proteome Res. 13:1–4 (2014).
  17. ^ Omenn GS., et al. Metrics for the Human Proteome Project 2015: Progress on the Human Proteome and Guidelines for High-Confidence Protein Identification. J Proteome Res. 14:3452-60 (2015).
  18. ^ Horvatovich P., et al. A Quest for Missing Proteins: update 2015 on Chromosome-Centric Human Proteome Project. J Proteome Res. Jun 15 (2015).
  19. ^ Baker, MS; et al. Accelerating the search for the missing proteins in the human proteome. Nature Communications. 2017, 8. doi:10.1038/ncomms14271. 

外部がいぶ链接

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  1. （英文えいぶん）HPP project page (www.hupo.org) （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）
  2. （英文えいぶん）HPP web site (www.thehpp.org) （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）
  3. （英文えいぶん）Chromosome-centric HPP web site (www.c-hpp.org) （页面存そん档备份，存そん于互联网档案あん馆）
  4. （英文えいぶん）BD HPP web site (www.thehpp.org/BD-HPP.php)
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