隐性遗传（英语：recessive）是一种基因遗传中的情况，表现为在遗传过程中，某个基因的性状并不显现出来，而有可能“隐藏”于基因内，除非来自父母双方的基因都给子代遗传了此基因的情况下，才会在子代身上使此隐性基因显现出来。
常染色体显性遗传谱系图解
常染色体隐性遗传谱系图解
与此对应的是显性遗传，父母双方有一方的基因显现的情况下，子代即会出现此基因显现的性状，显性遗传的基因称为显性基因。
隐性基因（Recessive gene）用来形容一种等位基因，只会在该生物的基因型为同质基因型，才会影响到表现型。若一个等位基因无论在同质还是异质的情况，都会影响表现型，则称为显性的。隐性基因决定的遗传过程，称为隐性遗传，而显性基因决定的遗传过程，则称为显性遗传。
有时，等位基因只有两种可能，其中刚好一项是隐性，一项的显性。隐性基因习惯以小楷英文字母表示，对应的显性基因则以相应的大楷字母表示。这类隐性和显性基因的分布可用哈代-温伯格定律估计。
亦可能会有多于一个等位基因是显性的，这种情况叫共显性。如人类血型中，A和B都是显性的，O是隐性的。
许多著名的遗传病都是隐性的，因为这较难从表现型发现。
与肿瘤发生的有关基因中，肿瘤抑制基因通常为隐性基因。
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