Ο Φετφατζίδης ξεκίνησε το ποδόσφαιρο σε νεαρή ηλικία στην ομάδα Α.Σ. Σουρμένων, μια ερασιτεχνική ομάδα τωννοτίων προαστίωντωνΑθηνώνκαιστη συνεχεία προσχώρησε στην παιδική ομάδα τουΟλυμπιακού. Την πρώτη του εμφάνιση μετον Ολυμπιακό την πραγματοποίησε στην εκτός έδρας νίκη εναντίον τουΑτρόμητου Αθηνών στις 31 Οκτωβρίου 2009. Η πρώτη του εμφάνιση στοΤσάμπιονς Λιγκ έγινε στον αγώνα του Ολυμπιακού μετηΣταντάρ Λιέγηςστο πλαίσιο τωνομίλων της διοργάνωσης 2009-10, όταν μπήκε ως αλλαγή στη θέση τουΛουσιάνο Γκαλέτι. Την επόμενη χρονιά στα προκριματικά τουΓιουρόπα Λιγκστον εντός έδρας αγώνα μετηνΜπέσα σκόραρε το πρώτο «ευρωπαϊκό» τουγκολ. Στις 23 Νοεμβρίου 2011 σκόραρε το πρώτο τουκαι καθοριστικό γιατην έκβαση της αναμέτρησης γκολ στους ομίλους τουΤσάμπιονς Λιγκ (2011-12) οδηγώντας τον Ολυμπιακό στη νίκη επί της ΜαρσέιγστοΣταντ Βελοντρόμμε σκορ 0-1.
Το Σεπτέμβριο του 2013 μεταγράφηκε στηνιταλικήΤζένοα έναντι 4 εκατομμυρίων ευρώ. Στις 26 Μαρτίου 2014 σημείωσε το πρώτο του τέρμα στηΣέριε Α (2013-14), όταν στην εντός έδρας νίκη της ομάδας του εναντίον της Λάτσιο διαμόρφωσε το τελικό 2-0.[1]Τον Ιανουάριο του 2015 παραχωρήθηκε ως δανεικός για έξι μήνες στηνΚιέβο Βερόναμετη φανέλα της οποίας πραγματοποίησε μόλις τέσσερις εμφανίσεις.[2]
Την 1η Ιουνίου του 2018 επέστρεψε στονΟλυμπιακό υπογράφοντας τριετές συμβόλαιο συνεργασίας.[4] Στις 31 Ιανουαρίου του 2019 το συμβόλαιό τουμετην ομάδα λύθηκε και αποχώρησε ως ελεύθερος.[5]
Στις 2 Φεβρουαρίουτου2019 ανακοινώθηκε η απόκτησή του από τονΆρη μέχρι το τέλος της σεζόν.[6] Στις 4 Ιουλίου ανακοινώθηκε η επέκταση συνεργασίας μετονΆρη Θεσσαλονίκης. Κατόπιν της ανανέωσης του συμβολαίου του, ο Γιάννης εξελίχθηκε σε έναν από τους ηγέτες της ομάδας του Άρη, αφότου βοήθησε την ομάδα πολλάκις φορές δημιουργώντας και σκοράροντας αρκετά και κρίσιμα γκολ. Οι οπαδοί της ομάδας τρέφουν ιδιαίτερα συναισθήματα γιατον ίδιο. Ο «Φέτφα» αγωνίστηκε σε 56 παιχνίδια με απολογισμό επτά γκολκαι 13 ασίστ.[7]
Διεθνής καριέρα
Ο Φετφατζίδης έκανε το ντεμπούτο τουμετη φανέλα της Ελλάδας στις 8 Οκτωβρίου 2010 στον αγώνα μετηΛετονίαστα πλαίσια τωνπροκριματικώντουEuro 2012. Συμμετείχε στην αποστολή της τελικής φάσης της διοργάνωσης, χωρίς όμως να πάρει χρόνο συμμετοχής.