1942年にイギリスとカナダの研究者が共同して、NRC(National Research Council of Canada:カナダ国家研究会議)の下に原子力研究施設として、モントリオール研究所が作られた。
1944年に チョーク・リバー研究所が開所された。1945年には、アメリカ合衆国外では最初の核反応施設である重水試験炉ZEEP(Zero Energy Experimental Pile)が作られた。1946年モントリオール研究所は閉鎖され、チョーク・リバー研究所に集約された。1947年、天然ウラン燃料のフルスケール重水研究炉NRX(National Research eXperimental)が運転を開始した[1]。
1952年に核の平和利用をはかるために、カナダ原子力公社AECL(Atomic Energy of Canada Limited)が設立され、チョーク・リバー研究所もNRCからAECLに移管された。