Piala AFC 2013 akan menjadi edisi ke-10 bagi Piala AFC, dimainkan di antara kelab-kelab dari negara-negara yang menjadi ahli kepada Konfederasi Bola Sepak Asia.
Al-Kuwait dari Kuwait, juara bertahan edisi lalu telah berjaya mempertahankan kejuaraan mereka dalam Piala AFC edisi kali ini setelah menewaskan pasukan senegaranya, Al-Qadsia, menjadikan mereka pasukan paling berjaya dalam Piala AFC dengan tiga gelaran.[3]
†Al-Muharraq menarik diri setelah undian diadakan. Maka Regar-TadAZ mendapat tempat dalam peringkat kumpulan secara langsung tanpa perlu memasuki kelayakan play-off.
India (IND): Dempo, Juara I-League 2011–12, menolak untuk menyertai Piala AFC 2013, maka mereka telah digantikan oleh Churchill Brothers, pemenang tempat ke-3 I-League 2011–12.[5]
Malaysia (MAS): Oleh kerana naib juara liga, Singapore LIONSXII tidak layak untuk mendapat tempat di sebarang perlawanan AFC, maka tempat ke-3 liga, Selangor telah diberi tempat dalam Piala AFC kali ini.
Pasukan-pasukan boleh ditukar daripada satu zon kepada yang lain untuk keseimbangan.
Undian bagi peringkat kumpulan telah diadakan di Kuala Lumpur, Malaysia pada 6 Disember 2012[11]. Kelab dari negara yang sama tidak akan diundi di dalam kumpulan sama. Pemenang dan naib johan dari setiap kumpulan akan mara ke peringkat kalah mati.
Berdasarkan keputusan undian peringkat kumpulan, jadual perlawanan untuk Pusingan 16 pasukan diputuskan seperti berikut. Setiap pasukan akan bermain dalam satu perlawanan, dihoskan oleh juara setiap kumpulan (Pasukan 1) dengan naib juara kumpulan yang lain (Pasukan 2).[12]