2007年,譚加盟香港亞洲電視,出任新聞部總監。[2]
2011年8月,亞視爆出新聞部與管理層各項衝突事件,對於《走進上市公司》一節目疑被管理層要求滲入廣告贊助,譚與亞視新聞部另一前主管梁家榮均表示反對,二人認為這類「有償新聞」會影響新聞公信力。及後,有公關界人士向《明報》爆料,指亞視曾對外開出《走進上市公司》的訪問及製作價目[3]。
2011年9月,爆出梁家榮辭職事件之後,譚衛兒跟隨梁家榮提出辭去亞視新聞部副總裁職位,當時未獲接納。
《蘋果日報》報道指,亞視新任高級副總裁(新聞及公共事務)劉瀾昌曾於新聞部例會要求下屬低調處理相關新聞;同場的譚則唱反調要求下屬必須著重新聞價值,不是看誰的意願去決定新聞做大做小。結果在9月7日的亞視新聞詳盡報道民主黨派員到亞視總台抗議,更主動跟進《走進上市公司》的「有償新聞」爭議,不但邀請學者評論事件,甚至於畫面公開相關節目的贊助價目單張[4]。
翌日,譚被亞視管理層要求即時放假兩個月,譚曾要求處理好當日的工作才離開但不得要領,當日亞視在《六點鐘新聞》用了五分鐘報道譚衛兒被要求放假的消息,並播出譚與下屬道別的講話錄音;錄音中譚要求同事,要根據新聞重要性處理新聞,不涉私人感情及利益。[5]
2011年12月,譚衛兒離開亞洲電視,加入《南華早報》擔任高級編輯,後晉升為副總編輯[6]。
2015年11月6日,《南華早報》官方網站發布通告,自2016年1月1日起,譚衛兒將接替王向偉擔任總編輯,成為《南華早報》創刊112年來第一位女性總編輯。
她與國務院港澳辦、新聞辦關係密切,並與中聯辦主任助理陳山玲「情同姐妹」[2][7]。撰寫新聞時,當報導有關政治議題的觀點時,她常学习CNN,BBC等以「消息人士透露」來代替,以隱藏政見的來源。此舉曾被時任亞洲電視行政總裁王維基反對,並向新聞部員工發出電郵,要求他們不要以此方式撰寫新聞。[2]