Ανήκει στο κόμμα BSP (Βουλγαρικό Σοσιαλιστικό Κόμμα), του οποίου είναι Πρόεδρος. Μετά τις εκλογές της 25 Ιουνίου 2005, ο Στάνισεφ επιλέχθηκε στις 27 Ιουλίου2005 από το Κοινοβούλιο γιατην Πρωθυπουργία. Η κυβέρνησή του όμως καταψηφίστηκε με πρόταση μομφής και επαναδιορίστηκε λίγο μετά. Ηγήθηκε τρικομματικής κυβέρνησης συνασπισμού, μαζί μετο Κίνημα γιατα Δικαιώματα και τις Ελευθερίες καιτο κόμμα του απερχόμενου Πρωθυπουργού Συμεών. Με ψήφους 168 υπέρ και 67 κατά το Κοινοβούλιο ενέκρινε τελικά την τρικομματική κυβέρνηση συνασπισμού και στις 17 Αυγούστου2005 ανέλαβε την πρωθυπουργία. Στις εκλογές που διεξήχθησαν τον Ιούλιο του 2009 ηττήθηκε από την Κεντροδεξιά αλλά επανεξελέγη πρόεδρος του κόμματός τουμε 455 ψήφους στις 19 Οκτωβρίου 2009, σε έκτακτο συνέδριο[8]. Τον διαδέχθηκε στην πρωθυπουργία οΜπόικο Μπορίσοφ.