Kodon
Izgled
Kodon je niz triju nukleotida koji se nalazi na molekuli glasničke RNK. Određuje položaj određene aminokiseline u procesu sinteze bjelančevina[1] u stanici, čime djeluju kao jedinica genetičkoga kodiranja. Ovi su nukleotidi uzastopni.[2] Svaka trojka nukleotida prepisana s DNK na glasničku RNK naziva se kodon ili kod[3] i predstavlja osnovnu jedinicu genskog koda.[4]
Kodone u procesima sinteze bjelančevina dijelimo na:[2]
- početni kodon: AUG – kodira aminokiselinu metionin, koja označava početak stvaranja polipeptidnoga lanca
- završni kodon (STOP-kodon), koji označava kraj stvaranja polipeptidnoga lanca, ali ne kodira ni jednu aminokiselinu jer mu ne postoji ni jedan komplementarni antikodon. Postoje 3 poznata STOP-kodona: UAG, UAA i UGA (za RNK), te TAG, TAA i TAG (za DNK).
Biokemijska svojstva aminokiselina | Nepolarna | Polarna | Bazična | Kisela ↓ | Kraj: stop kodon |
Prvi nukleotid | Drugi nukleotid | Treći nukleotid | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
U | C | A | G | ||||||
U | UUU | (Phe/F) Fenilalanin | UCU | (Ser/S) Serin | UAU | (Tyr/Y) Tirozin | UGU | (Cys/C) Cistein | U |
UUC | UCC | UAC | UGC | C | |||||
UUA | (Leu/L) Leucin | UCA | UAA | Stop | UGA | Stop | A | ||
UUG | UCG | UAG | Stop | UGG | (Trp/W) Triptofan | G | |||
C | CUU | CCU | (Pro/P) Prolin | CAU | (His/H) Histidin | CGU | (Arg/R) Arginin | U | |
CUC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CUA | CCA | CAA | (Gln/Q) Glutamin | CGA | A | ||||
CUG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
A | AUU | (Ile/I) Izoleucin | ACU | (Thr/T) Treonin | AAU | (Asn/N) Asparagin | AGU | (Ser/S) Serin | U |
AUC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
AUA | ACA | AAA | (Lys/K) Lizin | AGA | (Arg/R) Arginin | A | |||
AUG | (Met/M) Metionin | ACG | AAG | AGG | G | ||||
G | GUU | (Val/V) Valin | GCU | (Ala/A) Alanin | GAU | (Asp/D) Asparaginska kiselina ↓ | GGU | (Gly/G) Glicin | U |
GUC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GUA | GCA | GAA | (Glu/E) Glutaminska kiselina ↓ | GGA | A | ||||
GUG | GCG | GAG | GGG | G |
Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | |
---|---|---|---|---|---|---|
Ala, A | GCU, GCC, GCA, GCG | GCN | Ile, I | AUU, AUC, |
||
Arg, R | CGU, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; ili CGY, MGR |
Leu, L | CUU, CUC, CUA, CUG; UUA, UUG | CUN, UUR; ili CUY, YUR | |
Asn, N | AAU, AAC | AAY | Lys, K | AAA, AAG | AAR | |
Asp, D | GAU, GAC | GAY | Met, M | AUG | ||
Asn ili Asp, B | AAU, AAC; GAU, GAC | RAY | Phe, F | UUU, UUC | UUY | |
Cys, C | UGU, UGC | UGY | Pro, P | CCU, CCC, CCA, CCG | CCN | |
Gln, Q | CAA, CAG | CAR | Ser, S | UCU, UCC, UCA, UCG; AGU, AGC | UCN, AGY | |
Glu, E | GAA, GAG | GAR | Thr, T | ACU, ACC, ACA, ACG | ACN | |
Gln ili Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | SAR | Trp, W | UGG | ||
Gly, G | GGU, GGC, GGA, GGG | GGN | Tyr, Y | UAU, UAC | UAY | |
His, H | CAU, CAC | CAY | Val, V | GUU, GUC, GUA, GUG | GUN | |
START | AUG | STOP | UAA, UGA, UAG | URA, UAR |
Prvi nukleotid | Drugi nukleotid | Treći nukleotid | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
T | C | A | G | ||||||
T | TTT | (Phe/F) Fenilalanin | TCT | (Ser/S) Serin | TAT | (Tyr/Y) Tirozin | TGT | (Cys/C) Cistein | T |
TTC | TCC | TAC | TGC | C | |||||
TTA | (Leu/L) Leucin | TCA | TAA | Stop | TGA | Stop | A | ||
TTG | TCG | TAG | Stop | TGG | (Trp/W) Triptofan | G | |||
C | CTT | CCT | (Pro/P) Prolin | CAT | (His/H) Histidin | CGT | (Arg/R) Arginin | T | |
CTC | CCC | CAC | CGC | C | |||||
CTA | CCA | CAA | (Gln/Q) Glutamin | CGA | A | ||||
CTG | CCG | CAG | CGG | G | |||||
A | ATT | (Ile/I) Izoleucin | ACT | (Thr/T) Treonin | AAT | (Asn/N) Asparagin | AGT | (Ser/S) Serin | T |
ATC | ACC | AAC | AGC | C | |||||
ATA | ACA | AAA | (Lys/K) Lizin | AGA | (Arg/R) Arginin | A | |||
ATG | (Met/M) Metionin | ACG | AAG | AGG | G | ||||
G | GTT | (Val/V) Valin | GCT | (Ala/A) Alanin | GAT | (Asp/D) Asparaginska kiselina ↓ | GGT | (Gly/G) Glicin | T |
GTC | GCC | GAC | GGC | C | |||||
GTA | GCA | GAA | (Glu/E) Glutaminska kiselina ↓ | GGA | A | ||||
GTG | GCG | GAG | GGG | G |
Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | Aminokiselina | DNA kodoni | Skraćeno | |
---|---|---|---|---|---|---|
Ala, A | GCT, GCC, GCA, GCG | GCN | Ile, I | ATT, ATC, ATA | ATH | |
Arg, R | CGT, CGC, CGA, CGG; AGA, AGG | CGN, AGR; ili CGY, MGR |
Leu, L | CTT, CTC, CTA, CTG; TTA, TTG | CTN, TTR; ili CTY, YTR | |
Asn, N | AAT, AAC | AAY | Lys, K | AAA, AAG | AAR | |
Asp, D | GAT, GAC | GAY | Met, M | ATG | ||
Asn ili Asp, B | AAT, AAC; GAT, GAC | RAY | Phe, F | TTT, TTC | TTY | |
Cys, C | TGT, TGC | TGY | Pro, P | CCT, CCC, CCA, CCG | CCN | |
Gln, Q | CAA, CAG | CAR | Ser, S | TCT, TCC, TCA, TCG; AGT, AGC | TCN, AGY | |
Glu, E | GAA, GAG | GAR | Thr, T | ACT, ACC, ACA, ACG | ACN | |
Gln ili Glu, Z | CAA, CAG; GAA, GAG | SAR | Trp, W | TGG | ||
Gly, G | GGT, GGC, GGA, GGG | GGN | Tyr, Y | TAT, TAC | TAY | |
His, H | CAT, CAC | CAY | Val, V | GTT, GTC, GTA, GTG | GTN | |
START | ATG | STOP | TAA, TGA, TAG | TRA, TAR |
- Genska uputa (genski kod)
- Genska karta
- ↑ Glavna razlika između DNA i RNA je da je DNA baza timin (T) unutar RNA zamijenjena uracilom (U). To je jedina razlika u tablicama DNA i RNA kodona
- ↑ Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne Arhivirana inačica izvorne stranice od 21. rujna 2016. (Wayback Machine) (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 68
- ↑ a b kodon. Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. Pristupljeno 26. veljače 2015.
- ↑ Ilić, Sanda. Zadražil, Lela. Kostanić, Ljubica. Školski leksikon biologije s pitanjima za maturu i prijemne Arhivirana inačica izvorne stranice od 21. rujna 2016. (Wayback Machine) (ur. Hrvoje Zrnčić), Hinus, Zagreb, ISBN 978-953-6904-26-6, str. 46-47
- ↑ genski kôd. Hrvatska enciklopedija. Leksikografski zavod Miroslav Krleža. Pristupljeno 26. veljače 2015.
- ↑ Amino Acid Translation Table. Oregon State University. Inačica izvorne stranice arhivirana 29. svibnja 2020. Pristupljeno 2. prosinca 2020.
- ↑ The Information in DNA Determines Cellular Function via Translation. Scitable. Nature. Inačica izvorne stranice arhivirana 23. rujna 2017. Pristupljeno 5. prosinca 2020.
- ↑ a b IUPAC—IUB Commission on Biochemical Nomenclature. Abbreviations and Symbols for Nucleic Acids, Polynucleotides and Their Constituents (PDF). International Union of Pure and Applied Chemistry. Pristupljeno 5. prosinca 2020.
- ↑ Genes. DNA, Genetics, and Evolution. Boston University. Inačica izvorne stranice arhivirana 28. travnja 2020. Pristupljeno 10. prosinca 2020.