해독을 위해서는 세 가지 종류의 RNA, 즉 mRNA, tRNA, rRNA가 사용된다. 우선 mRNA는 유전자의 정보를 담고 있는 RNA이다.DNA에 들어있는 유전자 정보를 그대로 복사한 RNA이다. 진핵생물의 경우에는 가공이 완료된 RNA를 말한다. 다음으로 염기 서열 정보를 아미노산 서열 정보로 변환하는 변환 어댑터 tRNA(transfer RNA)가 있고, 마지막으로 리보솜을 구성하는 rRNA(ribosomal RNA)가 있다. tRNA는 클로버 잎 모양의 2차 구조를 가지는데 아래쪽 동그란 부위에 안티코돈이라 하여 mRNA의 3염기 코돈을 읽는, 즉 상보적 염기 서열을 가진 세 가지 염기가 있다.tRNA 줄기 모양의 끝에는 CCA 염기로 끝나는 3’ 끝이 있다. 이 CCA 끝에 안티코돈에 짝이 맞는 아미노산이 붙어 있다. 여기서 잠깐 논리적인 추론을 해보자. 유전 부호에는 모두 4×4×4=64개의 코돈이 있다.그중 종결코돈이라 불리는 UAA, UAG, UGA를 제외