Wolframソリューションバイオサイエンス
Wolframのバイオサイエンスソリューションは，データのインポートから
- Wolframの
強 み - Wolframを
使 う理由 主 な機能
Wolframテクノロジーには
-
PKPD，システム
生物 学 ，システムズ薬理 学 のモデルを開発 する -
パラメータがシステム
力学 に及 ぼす影響 を調 べるために，感度 解析 およびパラメータスイープを実行 する -
ヒト
初回 投与 試験 のための投薬 量 を選 ぶ -
生体 系 のモンテカルロシミュレーションを実行 する -
細胞 や酵素 の動的 な特性 を決定 する -
<画像処理技術を使って，細菌集落の数の計算，コンピュータを使用した細胞分析，感染葉の領域とクロロフィルの予測等を
実行 する -
リアルタイムでのエージェントベースの
生態 系 のシミュレーションとモデル化 -
モデルのパラメータ
最適 化 を行 う -
臨床 試験 の設計 と分析 -
定常 状態 解析 を実行 する -
組込 みの気象 データを使 った生態 予測 -
計算 できる形式 での配列 アラインメントを生成 する -
免疫 系 と寄生 体 の共 進化 の調査
-
自由形 式 の言語 入力 によって，シンタックスを使 わずに結果 を即座 に出 すことが可能
Wolframテクノロジー特有 の機能 -
実験 データをインポートして計算 し，結果 を提示 するという操作 を，複数 のアプリケーションを使 わなくても，単一 のインタラクティブなドキュメントの中 で行 うことができる
Excel，R，Stata，およびその他 のプログラムは，計算 ，解析 ，インタラクティブなプレゼンテーションのための統合 環境 を提供 しない -
プログラミングを
行 わなくてもインタラクティブなインターフェースを自動 構築 する
C/C++，BioPerl，BioJava，BioPythonでは，インタラクティブなインターフェースを構築 するために大々的 なプログラミングを行 う必要 がある -
無料 のWolfram Playerを使 うことによって，同僚 がアプリケーション，およびテキスト，グラフィックス，アニメーションを含 むドキュメントとインタラクトできるようにする
Wolframテクノロジー特有 の機能 -
計算 にすぐ使 え，継続 的 にアップデートされているゲノムとタンパク質 の精選 データへの組込 みのアクセス
Wolframテクノロジー特有 の機能 -
すぐに
使用 できる組込 みの統計 とデータ解析 の関数 ，および自動 レポート作成 機能 -
Wolfram
言語 のワークフローに統合 されている組込 みの画像 処理 機能
Excel，Stata，およびその他 の統計 ソフトウェアは，画像 処理 機能 を持 たない -
SBML（システム
生物 学 マークアップ言語 ）モデルをModelicaにインポートしたりエキスポートしたりする
Wolfram System Modeler特有 の機能
Wolframテクノロジーには，
バイオサイエンスに
自由形 式 の言語 入力 によって，シンタックスを使 わずに結果 を即座 に出 すことが可能 »前 処理 を行 わなくてもすぐに使 える，組込 みのゲノム，タンパク質 ，化学 のデータ »生態 学 ，分子生物学 等 の分野 における主成分 分析 ，非線形 回帰 ，分散 分析 等 の標準 統計 解析 とデータ解析 の技術 すべてのために，すぐに使 える組込 み関数 »画像 をノートブックにドラッグアンドドロップし，画像 処理 技術 を適用 して高分子 構造 ，骨 の断面 特徴 等 を調 べたり，コンピュータを使 った細胞 分析 等 を行 ったりする »単一 のコマンドでインタラクティブなアプリケーションを構築 してウィルスの蔓延 を抑制 するためのネットワーク設計 等 のプロトタイプモデルを作成 し，パラメータを変更 することによる効果 を調 べる »
即座 にレポートやインタラクティブなアプリケーションを生成 し，それを他 の生物 学者 や同僚 と無料 のWolfram Playerを使 って共有 する »組込 み関数 を使 って，標準 化 された，あるいは高度 にカスタマイズされた出版 品質 のグラフィックスを簡単 に作成 する »高度 に自動 化 された微分 方程式 ソルバは方程式 を解析 し，正 しいアルゴリズムを選択 して，生態 学 ，分子 力学 等 のアプリケーションの正確 な答 を素早 く得 ることができるようにする »- PDB，MMCIF，GenBank，FASTA
等 を含 めた数 多 くの生体 分子 形式 によるデータをインポートしたりエキスポートしたりする » - データベースとJava，Cおよび.NETのコードにリンクしたり
接続 したりできる広範 で簡単 に使 える機能 » 生物 学 システムのモデルの作成 ，データの解析 ，結果 のインタラクティブな可視 化 ，実験 報告 の自動 生成 を行 うための完全 に統合 されたプラットフォーム
Wolfram System Modelerは
予 め用意 されたコンポーネントをドラッグアンドドロップするだけで，大 規模 な複雑 系 のモデルが簡単 に構築 できる »組込 みのBioChemライブラリを使 って，生物 学 システムのモデルを作成 する »- SBML（システム
生物 学 マークアップ言語 ）モデルをインポートしたりエキスポートしたりする » 階層 的 モデリングを使 って，複雑 なモデルを層状 に作成 し見 ることができる．サブコンポーネントは別々 に検証 したり，再 利用 したりすることが可能 生体 反応 ネットワークを可視 化 する »- Wolfram
言語 とシームレスに接続 し，統合 された究極 のモデリング，シミュレーション，解析 のワークフローを使 う
「Wolframテクノロジーは，バイオサイエンスの研究 に不可欠 なパズル解 きツールです．バイオサイエンス分野 の研究 はますます定量 的 になっていますからね．」
Melih Senerイリノイ大学 アーバナ・シャンペーン校 ，生物 物理 学者
「今回 の発生 についてのデータがもっと集 まり次第 ，すぐにそれをインポートし，再 計算 してよりよい結果 を得 ることができます．これで予測 をより正確 なものにし，よりよい管理 政策 を設計 することができます．」
Zhilan Fengパデュー大学 ，数学 教授
「Mathematicaには驚 くほど多様 な機能 が備 わっています．誰 もが利用 範囲 の広 さに驚 くでしょう．無人島 に持 って行 くアプリケーションが1つ選 べるとしたら，私 ならこれを選 びます．」
David DeBrotaシニア臨床 研究 医
「Wolframテクノロジーを使 うと異 なる種類 の画像 アルゴリズムを統合 ・評価 するのが簡単 になります．」
Richard ScottCDx Laboratories
Wolframテクノロジーを使用 している機関 の例
