(Translated by https://www.hiragana.jp/)
α-變形菌 - 维基百科,自由的百科全书 とべ转到内容ないよう

αあるふぁ-變形へんけいきん

维基百科ひゃっか自由じゆうてき百科ひゃっかぜん

αあるふぁ-变形きん
穿ほじとおるしき電子でんし顯微鏡けんびきょうてき昆蟲こんちゅう細胞さいぼう細胞さいぼう沃爾ともえかつたい(Wolbachia)感染かんせん
授權:Public Library of Science / Scott O'Neill
科学かがくぶん 编辑
いき 细菌いき Bacteria
さかい 细菌かい Bacteria
门: 變形へんけいきんもん Pseudomonadota
纲: αあるふぁ-变形きん纲 Alphaproteobacteria
つな

αあるふぁ-變形へんけいきんAlphaproteobacteriaこれ變形へんけいきんもん(Proteobacteria)したてきいち[3]。此綱てき成員せいいん變異へんいせい極大きょくだい,且共通きょうつうてん極少きょくしょうただし確實かくじつけいどうみなもとαあるふぁ-變形へんけいきんだいおおかわ兰氏阴性きん,而有些包內寄生きせいてき物種ものだねかけしょう肽聚醣,而造成ぞうせいかわらん染色せんしょく變異へんい[3][4]

特性とくせい

[编辑]

αあるふぁ-變形へんけいきん包含ほうがん多種たしゅ細菌さいきん,其中包含ほうがんひかり自營じえい細菌さいきん植物しょくぶつ共生きょうせいきん(如根瘤こんりゅうきん)、內共生きょうせい細菌さいきん(如Wolbachia),かず胞內寄生きせい細菌さいきん(如たて克次かつじからだ)。

此外,ほんつなかえ包含ほうがんやめめつぜってきProto-mitochondrionえいProto-mitochondrionかく生物せいぶつてき祖先そせんにゅうりょう此種細菌さいきん進行しんこう共生きょうせい作用さようなりため後來こうらいてきつぶせんからだ[2]かえゆう一種生物技術上很喜歡使用的のう桿菌かんきん(Rhizobium radiobacter)也是ほんつな成員せいいん科學かがく常常つねづね使用しよう本物ほんものしゅらいはた外來がいらいDNA導入どうにゅう植物しょくぶつもといんたいちゅう[5]另外,一些光自營生物像是遍在へんざい遠洋えんよう桿菌かんきんPelagibacter ubique)也屬於此つなαあるふぁ-變形へんけいきんてき微生物びせいぶつ可能かのう佔了海洋かいよう微生物びせいぶつてき10%左右さゆう

えんじ及基いんたい

[编辑]

せき於本つな所屬しょぞくてき有人ゆうじん反對はんたい現行げんこうてき分類ぶんるいほうゆう其是PelagibacteralesえいPelagibacteralesてき地位ちいただし大體だいたいじょう大家たいかかえ普遍ふへん接受せつじゅ細菌さいきんてき分類ぶんるいがく一直是分類學家相當頭痛的問題,いんため細菌さいきんてきもといんかい彼此ひし互相交流こうりゅう,且基いん歧異相當そうとうだかぞう遍在へんざい遠洋えんよう桿菌かんきんよし於他てき寄生きせい行為こうい,就會せい簡化てきもといんたい)。ざいぼう些目ちゅう,其成いんてきGC含量變異へんい也大てき誇張こちょう[2]。舉個れいぞうPelagibacteralesたて克次かつじからだRickettsialesHolosporales三者的基因體都含有高AT含量,有人ゆうじんみとめため其實趨同えんじところしるべ致的假象かしょう[6][7][8],而反對はんたいかた也有やゆう自己じこてき論述ろんじゅつ[2][9][10][11]後來こうらい有人ゆうじん發現はつげんよう判斷はんだん分類ぶんるい依據いきょてきrRNAなか,GC含量このみぞうこのみぞうふとしかい受基いんたい變異へんい影響えいきょうよし此,rRNAちゅうGC含量較高てき Holosporales 就被ていGC含量てきPelagibacteralesたて克次かつじからだぶんひらけりょう[2]

αあるふぁ-變形へんけいきんつなゆうさんつなMagnetococcidaeたて克次かつじからだつなRickettsidaeかず桿菌かんきんつなCaulobacteridae[2]もとぐんためMagnetococcidae,此類べつ包含ほうがんりょう許多きょた趋磁细菌ゆかり於趨磁細菌さいきんためけいぐんいん此只ゆう部分ぶぶん包含ほうがんαあるふぁ-變形へんけいきんした[12]たて克次かつじからだつなそくよし細胞さいぼう寄生きせいてきだて克次かつじからだRickettsiales),以及以在胞外單獨たんどく生存せいぞんてきPelagibacterales桿菌かんきんつなそくゆかりHolosporalesべに螺旋らせんきんRhodospirillales)、さやあぶらたん胞菌Sphingomonadales)、べに細菌さいきん Rhodobacterales)、桿菌かんきんCaulobacterales)、KiloniellalesKordiimonadales短小たんしょう盒菌Parvularculales),Sneathiellales

αあるふぁ-变形きん包括ほうかつ以下いか亚纲:

Magnetococcidae亚纲
Rickettidae亚纲
Caulobacteridae亚纲

系統けいとう發生はっせいがく

[编辑]

以下いかひょうかく根據こんきょ美国びくに国家こっか生物せいぶつわざ术信いき中心ちゅうしん(NCBI)[4][14] 而樹じょうそく根據こんきょ'The All-Species Living Tree' Projectえい'The All-Species Living Tree' Projectところ提供ていきょうてき16s rRNA分析ぶんせき結果けっか[15]

?Aquaspirillum polymorphum(Williams and Rittenberg 1957) Hylemon et al. 1973

?FurvibacterLee et al. 2007

?Kopriimonas byunsanensisKwon et al. 2005

?Magnetococcus marinus Bazylinski et al. 2012 (in press)

?Micavibrio aeruginosavorusLambina et al. 1983

?Polymorphum gilvumCai 2010

?Reyranella massiliensis Pagnier et al. 2011

?Ronia tepidophila

?Subaequorebacter tamlenseLee 2006

?Tuberoidobacter mutans

?Vibrio adaptatus Muir et al. 1990

?Vibrio cyclosites Muir et al. 1990

Rhodovibrio

べににしきん Rhodospirillaceae 2

Tistrella

べににしきん Rhodospirillaceae 3

べににしきん Rhodospirillaceae 4

Defluviicoccus vanus Maszenan et al. 2005

Elioraea tepidiphila Albuquerque et al. 2008

Acetobacteraceae

たて克次かつじからだ Rickettsiales (包含ほうがんせんつぶからだ

Sneathiella

Sphingomonadaceae包含ほうがんErythrobacteraceae, Caulobacter leidyi, Asticcacaulis

Rhodothalassium salexigens (Drews 1982) Imhoff et al. 1998

Kordiimonas

べににしきん 1 [包含ほうがんRoseospirillum parvum, Kiloniella laminariae, Terasakiella pusilla]

根瘤こんりゅうきん [包含ほうがんCaulobacteraceae, Rhodobacteraceae, Parvularcula & Streptomyces longisporoflavus]

參考さんこう文獻ぶんけん

[编辑]
  1. ^ Jana Grote, J. Cameron Thrash, Megan J. Huggett, Zachary C. Landry, Paul Carini, Stephen J. Giovannoni, Michael S. Rappé. Streamlining and core genome conservation among highly divergent members of the SAR11 clade. mBio. 2012, 3 (5) [2019-02-12]. ISSN 2150-7511. PMC 3448164可免费查阅. PMID 22991429. doi:10.1128/mBio.00252-12. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-27). 
  2. ^ 2.00 2.01 2.02 2.03 2.04 2.05 2.06 2.07 2.08 2.09 2.10 Matteo P. Ferla, J. Cameron Thrash, Stephen J. Giovannoni, Wayne M. Patrick. New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability. PloS One. 2013, 8 (12): e83383 [2019-02-12]. ISSN 1932-6203. PMC 3859672可免费查阅. PMID 24349502. doi:10.1371/journal.pone.0083383. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-10). 
  3. ^ 3.0 3.1 Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T. George M. Garrity , 编. The Proteobacteria. Bergey's Manual of Systematic Bacteriology 2C 2nd. New York: Springer. July 26, 2005: 1388 [1984(Williams & Wilkins)] [2014-11-08]. ISBN 978-0-387-24145-6. British Library no. GBA561951. (原始げんし内容ないようそん于2015-02-19). 
  4. ^ 4.0 4.1 J.P. Euzéby. Alphaproteobacteria. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). [2011-11-17]. (原始げんし内容ないようそん档于2013-01-27). 
  5. ^ Chilton MD, Drummond MH, Merio DJ, Sciaky D, Montoya AL, Gordon MP, Nester EW., Stable incorporation of plasmid DNA into higher plant cells: the molecular basis of crown gall tumorigenesis, Cell. 1977 Jun;11(2):263-71.
  6. ^ Naiara Rodríguez-Ezpeleta, T. Martin Embley. The SAR11 group of alpha-proteobacteria is not related to the origin of mitochondria. PloS One. 2012, 7 (1): e30520 [2019-02-12]. ISSN 1932-6203. PMC 3264578可免费查阅. PMID 22291975. doi:10.1371/journal.pone.0030520. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-27). 
  7. ^ Johan Viklund, Thijs J. G. Ettema, Siv G. E. Andersson. Independent genome reduction and phylogenetic reclassification of the oceanic SAR11 clade. Molecular Biology and Evolution. 2012-02, 29 (2): 599–615 [2019-02-12]. ISSN 1537-1719. PMID 21900598. doi:10.1093/molbev/msr203. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-27). 
  8. ^ Johan Viklund, Joran Martijn, Thijs J. G. Ettema, Siv G. E. Andersson. Comparative and phylogenomic evidence that the alphaproteobacterium HIMB59 is not a member of the oceanic SAR11 clade. PloS One. 2013, 8 (11): e78858 [2019-02-12]. ISSN 1932-6203. PMC 3815206可免费查阅. PMID 24223857. doi:10.1371/journal.pone.0078858. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-27). 
  9. ^ Kalliopi Georgiades, Mohammed-Amine Madoui, Phuong Le, Catherine Robert, Didier Raoult. Phylogenomic analysis of Odyssella thessalonicensis fortifies the common origin of Rickettsiales, Pelagibacter ubique and Reclimonas americana mitochondrion. PloS One. 2011, 6 (9): e24857 [2019-02-12]. ISSN 1932-6203. PMC 3177885可免费查阅. PMID 21957463. doi:10.1371/journal.pone.0024857. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-27). 
  10. ^ J. Cameron Thrash, Alex Boyd, Megan J. Huggett, Jana Grote, Paul Carini, Ryan J. Yoder, Barbara Robbertse, Joseph W. Spatafora, Michael S. Rappé, Stephen J. Giovannoni. Phylogenomic evidence for a common ancestor of mitochondria and the SAR11 clade. Scientific Reports. 2011, 1: 13 [2019-02-12]. ISSN 2045-2322. PMC 3216501可免费查阅. PMID 22355532. doi:10.1038/srep00013. (原始げんし内容ないようそん于2019-10-15). 
  11. ^ Kelly P. Williams, Bruno W. Sobral, Allan W. Dickerman. A robust species tree for the alphaproteobacteria. Journal of Bacteriology. 2007-07, 189 (13): 4578–4586 [2019-02-12]. ISSN 0021-9193. PMC 1913456可免费查阅. PMID 17483224. doi:10.1128/JB.00269-07. (原始げんし内容ないようそん于2020-05-12). 
  12. ^ Bazylinski DA, Williams TJ, Lefèvre CT, Berg RJ, Zhang CL, Bowser SS, Dean AJ, Beveridge TJ. (2012) Magnetococcus marinus gen. nov., sp. nov., a marine, magnetotactic bacterium that represents a novel lineage (Magnetococcaceae fam. nov.; Magnetococcales ord. nov.) at the base of the Alphaproteobacteria. Int J Syst Evol Microbiol. doi: 10.1099/ijs.0.038927-0
  13. ^ Jana Grote, J. Cameron Thrash, Megan J. Huggett, Zachary C. Landry, Paul Carini, Stephen J. Giovannoni, Michael S. Rappé. Streamlining and core genome conservation among highly divergent members of the SAR11 clade. mBio. 2012, 3 (5) [2019-02-12]. ISSN 2150-7511. PMC 3448164可免费查阅. PMID 22991429. doi:10.1128/mBio.00252-12. (原始げんし内容ないようそん于2019-05-27). 
  14. ^ Sayers; et al. Alphaproteobacteria. 美国びくに国家こっか生物せいぶつわざ术信いき中心ちゅうしん(NCBI) taxonomy database. [2011-06-05]. (原始げんし内容ないようそん于2021-02-15). 
  15. ^ 'The All-Species Living Tree' Project.16S rRNA-based LTP release 106 (full tree) (PDF). Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. [2011-11-17]. (原始げんし内容ないようそん (PDF)于2012-08-11). 

外部がいぶ連結れんけつ

[编辑]