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島原藩（日语：島原藩／しまばらはん Shimabara han */?）是日本江戶時代的一個藩。位於肥前國島原周邊。初時稱為日野江藩。藩廳早期在日野江城，後來遷至島原城。
戰國時代是有馬氏的領地，關原之戰後支持德川軍保住了領地。1614年移遷到延岡藩。期間成為了天領，1616年由松倉氏入主，對領內的基督教徒鎮壓，加上實行暴政，導致了島原之亂的原因。松倉氏因而被處罰。並由高力氏入主。後來經戶田、松平氏管治。廢藩置縣後，成為島原縣，然後被編入為長崎縣。
4万石 外樣 （1600年～1614年）
- 晴信
- 直純
1614-1616年
4万石 外樣 （1616年～1638年）
- 重政
- 勝家
4万石 譜代 （1638年～1668年）
- 忠房
- 隆長
6万5000石 譜代 （1668年～1747年）
- 忠房
- 忠雄
- 忠俔
- 忠刻
- 忠祗
7万7000石 譜代 （1747年～1774年）
- 忠盈
- 忠寛
6万5000石 譜代 （1774年～1871年）
- 忠恕
- 忠馮
- 忠侯
- 忠誠
- 忠精
- 忠淳
- 忠愛
- 忠和
