海峡線とは、JR北海道が管理する在来線である。
概要
洞爺丸事故をきっかけに掘削が始まった青函トンネルは整備新幹線計画に基づき新幹線に対応する形で掘削を進めていたが、国鉄の赤字などから整備新幹線計画が一時凍結された。
その後青函トンネルが開通するに伴い、新幹線規格で掘られたトンネルに当面の間は在来線を通す事でトンネルを生かす事となり海峡線が開業した。
区間は中小国駅～木古内駅間であり、津軽線・江差線・函館本線と一体となって「津軽海峡線」と呼ばれる事が多い（現在この愛称は廃止）。
また、この海峡線には竜飛海底駅と吉岡海底駅があり、かつては見学者のみ乗降可能な特殊な駅であった（現在北海道新幹線の工事の関係で廃止されたため、見学は不可能である）。
元々新幹線規格の在来線（＝スーパー特急）である為に北海道新幹線ではこの貴重なインフラを生かす形で海峡線を三線軌化し架線・ATCを新幹線対応へと変更して在来線と共用する形となるが、旅客の輸送は新幹線に移行し、在来線は主にJR貨物が利用する事となる予定である。
現在、この区間を走る旅客列車は設定されていない。北海道新幹線開業前は特急「スーパー白鳥」「白鳥」と寝台特急「カシオペア」、急行「はまなす」が運行されていた。
青函トンネル開通時から運転された快速「海峡」廃止後は普通列車が存在しなくなったため、特例で津軽線蟹田～木古内間相互利用時のみ普通車自由席に限り乗車券のみで特急に乗車することができた。そのため青春18きっぷのシーズンになると特急の自由席は非常に混雑していた。
また季節列車としてJR北海道のキハ183系5200番台（ノースレインボーエクスプレス）及び6000番台（お座敷列車）が走行することもあった。但し気動車が青函トンネルを自走することはできないため、津軽海峡線内はED79形電気機関車が牽引していた。
2016年3月の北海道新幹線開業後は、前述した在来線の定期旅客列車は全廃となり、以後海峡線を運行するのは、貨物列車以外では、クルーズトレイン「TRAIN SUITE 四季島」のみとなる（この関係で、「海峡線」と言う路線自体は残ることになる）。
開業当初は青函トンネルの開業効果と、同時に開催された青函博の影響もあり、300万人を越える利用者が居たが、近年は160万人程度（平成18年度調べ）であり、利用者の落ち込みが目立っていた。
それに対して函館空港の定期旅客便の離発着件数は海峡線開業前よりもむしろ伸びており、JR側の旅客需要の掘り起しが失敗した形となっている。
対して、貨物列車は開業当初より順調に輸送実績を伸ばしてはいたが、海峡線の末端区間（津軽線・江差線）の輸送容量の不足により、開業数年後より頭打ちとなり、輸送実績は以後横ばいとなっている。
また、開業後急増した列車本数の影響による騒音・振動が問題となり、JRは対応に追われる事となった。
駅の存廃問題
前述の通り、海峡線は将来的に北海道新幹線の一部となる予定であり、在来線の車両は今のところJR貨物のみとなっている。そのため、問題になるのが海峡線の途中駅である。このうち、津軽今別駅は北海道新幹線の駅となることが決まっているため、確実に存続することになっている。知内駅は信号場に格下げされることが濃厚となっており、いずれ北海道新幹線開通までには廃止されるだろうと言う意見が多数であった。
しかし、竜飛海底駅・吉岡海底駅に関しては、完全に存廃不明であった。
2013年8月2日、北海道新幹線の工事および新幹線車両の試運転のため、竜飛海底駅での見学コースを2013年11月10日に取りやめた後に、竜飛海底駅・吉岡海底駅・知内駅を2014年3月に廃止することを発表した。
（なお、正確には竜飛海底駅・吉岡海底駅は当初の計画通り「竜飛定点」「吉岡定点」となり、保線基地および非常時の避難所として使用される。知内駅は一旦廃止後、北海道新幹線開通時に湯の里知内信号場となる。）
2014年3月15日、竜飛海底駅・吉岡海底駅・知内駅が廃止となった。
2016年3月25日、津軽今別駅が廃止。これにより海峡線の単独駅がなくなった。
駅一覧（信号場を含む）
北海道新幹線開業前までの使用車両
JR北海道
JR東日本
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