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都督府,中国历史上设置的军事或行政机构。
唐朝沿袭了汉末魏晋南北朝的都督制,在都督的驻地设立都督府。北周、隋朝把都督改为总管,唐朝恢复都督的名称。都督府一般节制数州的军政,但是唐朝实行府兵制,军权集中在朝廷,地方都督几无实权。后来府兵败坏之后,军权多为持节的节度使或观察使所有。安史之乱后都督府撤销,都督成为荣誉官衔,宰相出征的加衔。唐朝在羁縻地区也设立都督府,一般以一个国家政权或者民族部落为一个都督府,以国王或者酋长担任都督。
元文宗天历二年(1329年),始立钦察亲军都督府,后改大都督府。韩宋龙凤七年(1361年),吴国公朱元璋改改枢密院为大都督府。明太祖洪武十三年(1380年),大都督府改为五军都督府:中军都督府﹑左军都督府﹑右军都督府﹑前军都督府﹑后军都督府。
辛亥革命后,各省设立都督府主管本省军政,如鄂军都督府、沪军都督府、云南军都督府等,后来改称督军府或省政府。
日本在1906年到1919年于旅顺设立关东都督府。日本在1872年到1891年设立的近衛都督府即近卫师团的前身。