Στην68η διοργάνωση τουκυπέλλου Ελλάδας 2009-10 μετείχαν συνολικά 70 ομάδες (16 Α' εθνικής, 18 Β' εθνικήςκαι 36 Γ' εθνικής κατηγορίας). Θα διεξαχθεί σε 8 γύρους, συμπεριλαμβανομένου του τελικού.
Το σύστημα διεξαγωγής παραμένει το ίδιο όπως ισχύει από τησαιζόν 2005-06και όπως τροποποιήθηκε για τις φάσεις των "16" καιτων "8", ξεκινώντας με ομάδες Γ' εθνικήςκαι σταδιακά να εισέρχονται οι ομάδες της Β'και της Α' εθνικής, ενώ στους μονούς νοκ άουτ αγώνες των πρώτων φάσεων οι ομάδες μικρότερης κατηγορίας ορίζονται πάντα γηπεδούχες. Αναλυτική αναφορά γιατο σύστημα διεξαγωγής μπορείτε να δείτε εδώ. Ο τελικός της διοργάνωσης θα διεξαχθεί στοΟλυμπιακό Στάδιο της Αθήνας. [1]
Από τις χαρακτηριστικές στιγμές του κυπέλλου αυτής της χρονιάς ήταν ο αποκλεισμός του κυπελλούχου της προηγούμενης χρονιάς Ολυμπιακού στον πρωτο του αγώνα στην διοργάνωση με αντίπαλο τον Πανσερραϊκό στις Σέρρες αλλά και της φιναλίστ του προηγούμενου τελικού, ΑΕΚ, στον ίδιο γύρο (4ο) από τον Θρασύβουλο. Την έκπληξη πραγματοποίησε η Καλλιθέα, πουανκαι αγωνιζόταν στηνΓ' Εθνική κατάφερε να φτάσει μέχρι τα προημιτελικά της διοργάνωσης, ενώ η ήττα τουΠΑΟΚ από τοΠΑΣ Γιάννινα με 4-0, μια περίοδο πουη ομάδα της Θεσσαλονίκης είχε την καλύτερη άμυνα στο πρωτάθλημα, χωρίς να έχει δεχθεί γκολγια αρκετούς αγώνες, προκάλεσε εντύπωση.
Στον τελικό τις 24ης Απριλίου στο Ολυμπιακό Στάδιο, έφτασαν ο πρωταθλητής της χρονιάς Παναθηναϊκός καιο Άρης. Κυπελλούχος αναδείχθηκε ο Παναθηναϊκός νικώντας τον Άρη με 1-0.
Στα αξιοσημείωτα του τελικού καταγράφεται το γεγονός ότι ο Άρης πέτυχε ρεκόρ μαζικότερης μετακίνησης οπαδών. Περίπου 30.000 φίλαθλοι ακολούθησαν την ομάδα τους στοΟΑΚΑ σχηματίζοντας ουρά πολλών χιλιομέτρων στην εθνική οδό Θεσσαλονίκης-Αθηνών από πλήθος λεωφορείων καθώς καιΙΧ αυτοκινήτων. Είναι χαρακτηριστικό ότι το τελευταίο όχημα της πομπής έφτασε στο γήπεδο τρεις ώρες μετά την άφιξη του πρώτου!