(Translated by https://www.hiragana.jp/)
側鎖 - Wikipedia コンテンツにスキップ

がわくさり

出典しゅってん: フリー百科ひゃっか事典じてん『ウィキペディア(Wikipedia)』
IUPAC definition
Branch
Side-chain
Pendant chain
An oligomeric or polymeric offshoot from a macromolecular chain.

Notes

  1. An oligomeric branch may be termed a short-chain branch.
  2. A polymeric branch may be termed a long-chain branch.[1]

有機ゆうき化学かがく生化学せいかがくでは、がわくさり(そくさ、えい: side chain)とは、しゅくさり(またはバックボーン)とばれる分子ぶんし中心ちゅうしん部分ぶぶん結合けつごうしている化学かがくもと置換ちかんもとである。これはよりおおきな炭化たんか水素すいそ骨格こっかく結合けつごうしている分子ぶんし炭化たんか水素すいそ分岐ぶんき要素ようそであり、分子ぶんし性質せいしつ反応はんのうせい決定けっていする要因よういんひとつである[2]

がわくさりは、ペンダント分子ぶんしくさりえい: pendant chain)ともばれる。しかし、ペンダントもと英語えいごばんえい: pendant group)やがわもとえい: side group)は定義ていぎことなる。

記法きほう

[編集へんしゅう]

化学かがく構造こうぞうでは、アルキルもと飽和ほうわ炭化たんか水素すいそがわくさりあらわ一般いっぱんてき代用だいようとして R がよく使つかわれる。構造こうぞうでその炭素たんそ以外いがいもとしめ場合ばあいには、X, Y, Z がよく使用しようされる。

歴史れきし

[編集へんしゅう]

R記号きごうは、19世紀せいきのフランスの化学かがくしゃシャルル・フレデリック・ジェラールが、複数ふくすうヨーロッパ言語げんごで「(root)」や「残留ざんりゅうぶつ(residue)」の頭文字かしらもじ対応たいおうしていることから、ひろ認識にんしきされ、理解りかいされるだろうという理由りゆう採用さいよう提唱ていしょうした。フランス語ふらんすごracine)とrésidu残留ざんりゅうぶつ)、これらの言葉ことば英訳えいやくであるradicalラテン語らてんごradix由来ゆらい)、ラテン語らてんごradix)とresiduum残留ざんりゅうぶつ)、ドイツRestのこもの化学かがく文脈ぶんみゃくでは残留ざんりゅうぶつ(residue)とラジカル(radical)の両方りょうほう意味いみ)などがある[3]

使用しようほう

[編集へんしゅう]

有機ゆうき化学かがく

[編集へんしゅう]

高分子こうぶんし化学かがくでは、オリゴマーポリマー分岐ぶんきがわくさりは、ポリマーのしゅくさりからびるものをう。がわくさりは、ポリマーの特性とくせいおも結晶けっしょうたび密度みつど)におおきな影響えいきょうあたえる。オリゴマーの分岐ぶんきたんくさり分岐ぶんきえい: short-chain branch)とばれ、ポリマーの分岐ぶんきちょうくさり分岐ぶんきえい: long-chain branch)とばれることがある。ペンダントもと英語えいごばんまたはがわもとは、がわくさりとはことなり、オリゴマーでもポリマーでもない[4]

生化学せいかがく

[編集へんしゅう]
21しゅアミノ酸あみのさん一覧いちらん

アミノ酸あみのさんざんもと構成こうせいされるタンパク質たんぱくしつでは、がわくさりアミド骨格こっかくαあるふぁ炭素たんそ原子げんし結合けつごうしている。αあるふぁ炭素たんそ結合けつごうしているがわくさりは、かくアミノ酸あみのさん固有こゆうのもので、アミノ酸あみのさん電荷でんか極性きょくせい決定けっていする役割やくわりたす。アミノ酸あみのさんがわくさりは、タンパク質たんぱくしつただしくりたたまれて機能きのうするためのおおくの相互そうご作用さようにも関与かんよしている[5]極性きょくせいアミノ酸あみのさん同士どうし通常つうじょうきつけられるが、極性きょくせいがわくさり極性きょくせいがわくさり通常つうじょうたがいに反発はんぱつする。極性きょくせい/極性きょくせい相互そうご作用さようは、タンパク質たんぱくしつ全体ぜんたい比較的ひかくてきおお存在そんざいするため、構造こうぞう安定あんてい重要じゅうよう役割やくわりたす可能かのうせいがある[6]がわくさり原子げんし空間くうかんてき位置いちは、がわくさりさい構築こうちくのための計算けいさんツールを使用しようし、タンパク質たんぱくしつ骨格こっかく形状けいじょうもとづいて予測よそくできる[7]

参照さんしょう項目こうもく

[編集へんしゅう]

脚注きゃくちゅう

[編集へんしゅう]
  1. ^ Jenkins, A. D.; Kratochvíl, P.; Stepto, R. F. T.; Suter, U. W. (1996). “Glossary of basic terms in polymer science (IUPAC Recommendations 1996)”. Pure and Applied Chemistry 68 (12): 2287–2311. doi:10.1351/pac199668122287. http://pac.iupac.org/publications/pac/pdf/1996/pdf/6812x2287.pdf. 
  2. ^ Wade, L.G. (2010). Organic Chemistry, 7th Edition. Upper Saddle River, NJ: Pearson Prentice Hall. pp. 70–78. ISBN 978-0-321-59231-6 
  3. ^ Jensen W.B., Journal of Chemical Education 87, 360 (2010)
  4. ^ Chemistry, International Union of Pure and Applied. IUPAC Compendium of Chemical Terminology. IUPAC. doi:10.1351/goldbook.B00720. http://goldbook.iupac.org/B00720.html 
  5. ^ Voet, Donald; Voet, Judith; Pratt, Charlotte (2013). Fundamentals of Biochemistry: Life at the Molecular Level (Fourth ed.). Hoboken, NJ: John Wiley & Sons, Inc.. ISBN 9781118129180 
  6. ^ Andrew, C. D.; Penel, S.; Jones, G. R.; Doig, A. J. (2001-12-01). “Stabilizing nonpolar/polar side-chain interactions in the alpha-helix”. Proteins 45 (4): 449–455. doi:10.1002/prot.1161. ISSN 0887-3585. PMID 11746692. 
  7. ^ Badaczewska-Dawid, Aleksandra E.; Kolinski, Andrzej; Kmiecik, Sebastian (2019-12-26). “Computational reconstruction of atomistic protein structures from coarse-grained models”. Computational and Structural Biotechnology Journal 18: 162–176. doi:10.1016/j.csbj.2019.12.007. ISSN 2001-0370. PMC 6961067. PMID 31969975. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6961067/.