Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
BCL11B
Ідентифікатори
Символи
BCL11B , ATL1, ATL1-alpha, ATL1-beta, ATL1-delta, ATL1-gamma, CTIP-2, CTIP2, RIT1, ZNF856B, hRIT1-alpha, B-cell CLL/lymphoma 11B, IMD49, B cell CLL/lymphoma 11B, IDDFSTA, BAF complex component, BAF chromatin remodeling complex subunit SMARCM2
Зовнішні ІД
OMIM : 606558 MGI: 1929913 HomoloGene: 10974 GeneCards: BCL11B
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • зв'язування з іоном металу • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • neuron projection • клітинне ядро
Біологічний процес
• commitment of neuronal cell to specific neuron type in forebrain • regulation of neuron differentiation • Нейрогенез • olfactory bulb axon guidance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • T cell differentiation in thymus • аксоноґенеза • epithelial cell morphogenesis • thymus development • T cell receptor V(D)J recombination • negative regulation of apoptotic process • transcription by RNA polymerase II • post-embryonic development • positive T cell selection • transcription, DNA-templated • striatal medium spiny neuron differentiation • odontogenesis of dentin-containing tooth • regulation of lipid metabolic process • keratinocyte development • post-embryonic camera-type eye development • central nervous system neuron differentiation • регуляція експресії генів • alpha-beta T cell differentiation • regulation of keratinocyte proliferation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of cell population proliferation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • skin development • hematopoietic stem cell migration • lymphoid lineage cell migration into thymus
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 14: 99.17 – 99.27 Mb
Хр. 12: 107.88 – 107.97 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
BCL11B (англ. B-cell CLL/lymphoma 11B ) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми .[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 894 амінокислот , а молекулярна маса — 95 519[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSRRKQGNPQ HLSQRELITP EADHVEAAIL EEDEGLEIEE PSGLGLMVGG
PDPDLLTCGQ CQMNFPLGDI LVFIEHKRKQ CGGSLGACYD KALDKDSPPP
SSRSELRKVS EPVEIGIQVT PDEDDHLLSP TKGICPKQEN IAGPCRPAQL
PAVAPIAASS HPHSSVITSP LRALGALPPC LPLPCCSARP VSGDGTQGEG
QTEAPFGCQC QLSGKDEPSS YICTTCKQPF NSAWFLLQHA QNTHGFRIYL
EPGPASSSLT PRLTIPPPLG PEAVAQSPLM NFLGDSNPFN LLRMTGPILR
DHPGFGEGRL PGTPPLFSPP PRHHLDPHRL SAEEMGLVAQ HPSAFDRVMR
LNPMAIDSPA MDFSRRLREL AGNSSTPPPV SPGRGNPMHR LLNPFQPSPK
SPFLSTPPLP PMPPGGTPPP QPPAKSKSCE FCGKTFKFQS NLIVHRRSHT
GEKPYKCQLC DHACSQASKL KRHMKTHMHK AGSLAGRSDD GLSAASSPEP
GTSELAGEGL KAADGDFRHH ESDPSLGHEP EEEDEEEEEE EEELLLENES
RPESSFSMDS ELSRNRENGG GGVPGVPGAG GGAAKALADE KALVLGKVME
NVGLGALPQY GELLADKQKR GAFLKRAAGG GDAGDDDDAG GCGDAGAGGA
VNGRGGGFAP GTEPFPGLFP RKPAPLPSPG LNSAAKRIKV EKDLELPPAA
LIPSENVYSQ WLVGYAASRH FMKDPFLGFT DARQSPFATS SEHSSENGSL
RFSTPPGDLL DGGLSGRSGT ASGGSTPHLG GPGPGRPSSK EGRRSDTCEY
CGKVFKNCSN LTVHRRSHTG ERPYKCELCN YACAQSSKLT RHMKTHGQIG
KEVYRCDICQ MPFSVYSTLE KHMKKWHGEH LLTNDVKIEQ AERS
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , ацетилювання , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші