GFI1

GFI1
Ідентифікатори
Символи	GFI1, GFI-1, GFI1A, SCN2, ZNF163, growth factor independent 1 transcriptional repressor
Зовнішні ІД	OMIM: 600871 MGI: 103170 HomoloGene: 3854 GeneCards: GFI1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity;
Клітинна компонента	• ядерні тільця; • nuclear matrix; • transcription repressor complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма;
Біологічний процес	• positive regulation of interleukin-6-mediated signaling pathway; • negative regulation of neuron projection development; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • regulation of toll-like receptor signaling pathway; • regulation of histone H3-K4 methylation; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle; • transcription, DNA-templated; • negative regulation of vitamin D biosynthetic process; • negative regulation of calcidiol 1-monooxygenase activity; • GO:0022415 viral process; • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated; • negative regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • cellular response to lipopolysaccharide; • кровотворення; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2672
	14581
	ENSG00000162676
	ENSMUSG00000029275
	Q99684
	P70338
	NM_001127215; NM_001127216; NM_005263
	NM_001267621; NM_010278
	NP_001120687; NP_001120688; NP_005254
	NP_001254550; NP_034408
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GFI1 (англ. Growth factor independent 1 transcriptional repressor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 422 амінокислот, а молекулярна маса — 45 297^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPRSFLVKSK	KAHSYHQPRS	PGPDYSLRLE	NVPAPSRADS	TSNAGGAKAE
PRDRLSPESQ	LTEAPDRASA	SPDSCEGSVC	ERSSEFEDFW	RPPSPSASPA
SEKSMCPSLD	EAQPFPLPFK	PYSWSGLAGS	DLRHLVQSYR	PCGALERGAG
LGLFCEPAPE	PGHPAALYGP	KRAAGGAGAG	APGSCSAGAG	ATAGPGLGLY
GDFGSAAAGL	YERPTAAAGL	LYPERGHGLH	ADKGAGVKVE	SELLCTRLLL
GGGSYKCIKC	SKVFSTPHGL	EVHVRRSHSG	TRPFACEMCG	KTFGHAVSLE
QHKAVHSQER	SFDCKICGKS	FKRSSTLSTH	LLIHSDTRPY	PCQYCGKRFH
QKSDMKKHTF	IHTGEKPHKC	QVCGKAFSQS	SNLITHSRKH	TGFKPFGCDL
CGKGFQRKVD	LRRHRETQHG	LK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

Roberts T., Cowell J.K. (1997). Cloning of the human Gfi-1 gene and its mapping to chromosome region 1p22. Oncogene. 14: 1003—1005. PMID 9051000 DOI:10.1038/sj.onc.1200910
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Zweidler-Mckay P.A., Grimes H.L., Flubacher M.M., Tsichlis P.N. (1996). Gfi-1 encodes a nuclear zinc finger protein that binds DNA and functions as a transcriptional repressor. Mol. Cell. Biol. 16: 4024—4034. PMID 8754800 DOI:10.1128/MCB.16.8.4024
Duan Z., Zarebski A., Montoya-Durango D., Grimes H.L., Horwitz M. (2005). Gfi1 coordinates epigenetic repression of p21Cip/WAF1 by recruitment of histone lysine methyltransferase G9a and histone deacetylase 1. Mol. Cell. Biol. 25: 10338—10351. PMID 16287849 DOI:10.1128/MCB.25.23.10338-10351.2005
Dahl R., Iyer S.R., Owens K.S., Cuylear D.D., Simon M.C. (2007). The transcriptional repressor GFI-1 antagonizes PU.1 activity through protein-protein interaction. J. Biol. Chem. 282: 6473—6483. PMID 17197705 DOI:10.1074/jbc.M607613200
Ossovskaya V.S., Dolganov G., Basbaum A.I. (2009). Loss of function genetic screens reveal MTGR1 as an intracellular repressor of beta1 integrin-dependent neurite outgrowth. J. Neurosci. Methods. 177: 322—333. PMID 19026687 DOI:10.1016/j.jneumeth.2008.10.031

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4237 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q99684 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4237 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q99684 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

GFI1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук