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Z-DNA

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Z-DNA結構けっこう

Z-DNAまたしょうZがたDNADNAそう螺旋らせん結構けっこうてきいちしゅ形式けいしき具有ぐゆうひだり旋型たいてきそうまた螺旋らせんあずか常見つねみてきB-DNA相反あいはん),なみていげん鋸齒きょし形狀けいじょう。Z-DNAためさんしゅ生物せいぶつ活性かっせいてきDNAそう螺旋らせん結構けっこういち,另兩しゅためA-DNAあずかB-DNA。

歷史れきし

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Z-DNAためくびさき於1979ねんかいあきらたい結構けっこうてきDNAがたたい研究けんきゅうしゃためあさしょう理工りこう大學だいがくてきAlexander Richとうじん[1]。Bがた及Zがた相互そうご結合けつごうてき結晶けっしょうそくかい於2005ねん[2]使つかい科學かがく了解りょうかいZ-DNAざい細胞さいぼうちゅうてき潛在せんざいかくしょくとういちだんZ-DNA形成けいせい,其兩はし必為B-Z相互そうご結合けつごうがたたい形成けいせいあずかB-DNAてきかいめん

結構けっこう

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B-DNA(ふか藍色あいいろあずかZ-DNA(深紅しんくしょく相互そうご結合けつごうがたたい,以及Z-DNA結合けつごうかたまり綠色みどりいろ),兩個りゃんこてき突出とっしゅつてき鹼基(中央ちゅうおうてきあわ藍色あいいろ及淡紅色こうしょく)。らいPDB 2ACJ

Z-DNAてきそうまた螺旋らせんためひだり旋型たいあずかB-DNAてきみぎ旋型たいあかりあらわゆうしょ差別さべつ。其結構けっこうまい兩個りゃんこ鹼基たい重複じゅうふく出現しゅつげんいち大小だいしょう螺旋らせん凹槽あいだてき差別さべつ較Aがた及Bかたしょうただざいひろしじょうゆう些微差異さい。這種がたたいなみ常見つねみただしぼう特定とくてい情況じょうきょう增加ぞうか存在そんざいてき可能かのう,如嘌呤-嘧啶交替こうたい序列じょれつDNAちょう螺旋らせんあるしお份與ぼうはなれ濃度のうどだか

Z-DNAのう夠與B-DNA構成こうせい相互そうご結合けつごうがたたい,這種結構けっこうかい使一對鹼基突出於雙螺旋之外。

いち些DNA形式けいしき幾何きか形狀けいじょうてき對比たいひ

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A-, B-, あずか Z-DNAてきがわ.
A-, B-, あずか Z-DNAてき螺旋らせんじく.
幾何きか屬性ぞくせい A-DNA B-DNA Z-DNA
螺旋らせん方向ほうこう みぎ みぎ ひだり
重複じゅうふく單元たんげん 1 bp 1 bp 2 bp
Rotation/bp 32.7° 35.9° 60°/2
bp/turn 10 11 12
Inclination of bp to axis +19° −1.2° −9°
Rise/bp along axis 2.3 Å (0.23 nm) 3.32 Å (0.332 nm) 3.8 Å (0.38 nm)
Pitch/turn of helix 28.2 Å (2.82 nm) 33.2 Å (3.32 nm) 45.6 Å (4.56 nm)
Mean propeller twist +18° +16°
とうもと角度かくど anti anti C: anti,
G: syn
Sugar pucker C3'-endo C2'-endo C: C2'-endo,
G: C3'-endo
直徑ちょっけい 23 Å (2.3 nm) 20 Å (2.0 nm) 18 Å (1.8 nm)
らいみなもと:[3][4][5]

まいり

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參考さんこう文獻ぶんけん

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  1. ^ Wang AHJ, Quigley GJ, Kolpak FJ, Crawford JL, van Boom JH, Van der Marel G, Rich A. Molecular structure of a left-handed double helical DNA fragment at atomic resolution. Nature (London). 1979, 282: 680–686.  PMID 514347
  2. ^ Ha SC, Lowenhaupt K, Rich A, Kim YG, Kim KK. Crystal structure of a junction between B-DNA and Z-DNA reveals two extruded bases. Nature. 2005, 437: 1183–1186. PMID 16237447. 
  3. ^ Sinden, Richard R. DNA structure and function 1st. Academic Press. 1994-01-15: 398. ISBN 0-126-45750-6. 
  4. ^ Rich A, Norheim A, Wang AHJ. The chemistry and biology of left-handed Z-DNA. Annual Review of Biochemistry. 1984, 53 (1): 791–846. PMID 6383204. doi:10.1146/annurev.bi.53.070184.004043. 
  5. ^ Ho PS. The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA. Proc Natl Acad Sci USA. 1994-09-27, 91 (20): 9549–9553. Bibcode:1994PNAS...91.9549H. PMC 44850可免费查阅. PMID 7937803. doi:10.1073/pnas.91.20.9549. 

延伸えんしん閱讀

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  • Sinden RR (1994). DNA structure and function. Academic Press, 179-216. ISBN 978-0-12-645750-6
  • Rich A, Zhang S (2003). Timeline: Z-DNA: the long road to biological function. Nat Rev Genet, 4:566–572.

外部がいぶ連結れんけつ

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