(Translated by https://www.hiragana.jp/)
強化子RNA - 维基百科,自由的百科全书 とべ转到内容ないよう

強化きょうかRNA

维基百科ひゃっか自由じゆうてき百科ひゃっかぜん
強化きょうかRNA可能かのうてき作用さようせい

強化きょうかRNA(Enhancer RNA,簡稱eRNAこれかく生物せいぶつもといんぐみなか強化きょうか序列じょれつてんろくさんせいてきへん碼RNA[1]ちょう50ntいたり4000ntあいだ,此類RNA於2010ねんゆかりRNAはかじょあずかChIP-seqひとしだい規模きぼはかじょ技術ぎじゅつはかとく[2]強化きょうかためもといんぐみちゅうあずかRNA聚合酶Ⅱちゅうかいたいてんろく因子いんし結合けつごう以啟どうもといんてんろくてき重要じゅうよう序列じょれつ,其轉ろく生成せいせいてき強化きょうかRNAだい多留たるざい細胞さいぼうかくなか,此類RNAだい不穩ふおんじょうえき細胞さいぼうかくちゅうてき外切がいせつたいくだかいただし可能かのう調ちょうひかえ其他もといんてきてんろく[3]なみ所有しょゆう強化きょうかみなてんろくゆう研究けんきゅう顯示けんじ僅有少數しょうすう強化きょうかてんろくさん生出おいでeRNA[4]可能かのうため較為活躍かつやくてき強化きょうか[5]ゆう強化きょうかRNA複雜ふくざつてきつぎきゅう結構けっこうなみたいゆうm6Aとう鹼基修飾しゅうしょく[5]

強化きょうかRNA可分かぶんため1D eRNAあずか2D eRNAりょう大類おおるい兩者りょうしゃちょうせん苷酸情況じょうきょうあずかてんろく方向ほうこうみなゆう差異さい[6],1D eRNAてきてんろくため單向たんこうちょうたちすうせんnt,較常せん苷酸[5]一般いっぱんゆかりH3K4me1えいH3K4me1/H3K4me3えいH3K4me3值較ていてき強化きょうかてんろく[7];2D eRNAてきてんろくそくためそうむかい,且長較短,かい於50ntいたり2000ntあいだてんろくてき強化きょうかH3K4me1/H3K4me3較高[8]

ゆう研究けんきゅうみとめため強化きょうかRNA僅是もといんてんろく的中てきちゅうてきざつ訊,そくよし染色せんしょくたい結構けっこう疏鬆てき區域くいきしょずい機轉きてんろくさんせい不具ふぐ重要じゅうようこうのうてきRNA[4][9][10]ただしゆう許多きょた研究けんきゅうみとめため強化きょうかRNA可能かのう重要じゅうようてきてんろく調ちょうひかえこうのう影響えいきょう特定とくていもといんてき表現ひょうげん,其詳細しょうさいせいなお不明朗ふめいろうただし目前もくぜんやめゆう數個すうこ假說かせつ提出ていしゅつ[6]ゆう強化きょうかRNA可能かのうくみ蛋白たんぱく修飾しゅうしょくあるてんろく因子いんしとう調しらべひかえ蛋白たんぱく結合けつごう,以促進そくしん強化きょうかしょひかえせいもといんてきてんろくれい周期しゅうき蛋白たんぱくD1もといん強化きょうかてんろくてきeRNA結合けつごうくみ蛋白たんぱくおつ轉移てんい促進そくしん周期しゅうき蛋白たんぱくD1てきてんろく[3],受p53調しらべひかえてきかく目標もくひょうもといん強化きょうかp53BER也可てんろくeRNA以促進そくしんかく目標もくひょうもといんてんろく[11]かえゆう強化きょうかRNA可能かのう調ちょうひかえ其他較遠てんてきもといんてきてんろく[12]ゆうeRNA可能かのう作為さくいいちがんしょう病理びょうり狀況じょうきょうてき生物せいぶつ標記ひょうき[5][13]

參考さんこう文獻ぶんけん

[编辑]
  1. ^ Fedoseeva DM, Kretova OV, Tchurikov NA. Molecular analysis of enhancer RNAs and chromatin modifications in the region of their synthesis in Drosophila cells possessing genetic constructs. Doklady. Biochemistry and Biophysics. 2012, 442: 7–11. PMID 22419084. doi:10.1134/S1607672912010012. 
  2. ^ Kim TK, Hemberg M, Gray JM, Costa AM, Bear DM, Wu J, Harmin DA, Laptewicz M, Barbara-Haley K, Kuersten S, Markenscoff-Papadimitriou E, Kuhl D, Bito H, Worley PF, Kreiman G, Greenberg ME. Widespread transcription at neuronal activity-regulated enhancers. Nature. May 2010, 465 (7295): 182–7. PMC 3020079可免费查阅. PMID 20393465. doi:10.1038/nature09033. 
  3. ^ 3.0 3.1 Wang X, Arai S, Song X, Reichart D, Du K, Pascual G, Tempst P, Rosenfeld MG, Glass CK, Kurokawa R. Induced ncRNAs allosterically modify RNA-binding proteins in cis to inhibit transcription. Nature. July 2008, 454 (7200): 126–30. PMC 2823488可免费查阅. PMID 18509338. doi:10.1038/nature06992. 
  4. ^ 4.0 4.1 De Santa F, Barozzi I, Mietton F, Ghisletti S, Polletti S, Tusi BK, Muller H, Ragoussis J, Wei CL, Natoli G. Mattick JS , 编. A large fraction of extragenic RNA pol II transcription sites overlap enhancers. PLoS Biology. May 2010, 8 (5): e1000384. PMC 2867938可免费查阅. PMID 20485488. doi:10.1371/journal.pbio.1000384. 
  5. ^ 5.0 5.1 5.2 5.3 Arnold PR, Wells AD, Li XC. Diversity and Emerging Roles of Enhancer RNA in Regulation of Gene Expression and Cell Fate.. Front Cell Dev Biol. 2019, 7: 377. PMC 6971116可免费查阅. PMID 31993419. doi:10.3389/fcell.2019.00377. 
  6. ^ 6.0 6.1 Natoli G, Andrau JC. Noncoding transcription at enhancers: general principles and functional models. Annual Review of Genetics. 2012, 46: 1–19. PMID 22905871. doi:10.1146/annurev-genet-110711-155459. 
  7. ^ Koch F, Fenouil R, Gut M, Cauchy P, Albert TK, Zacarias-Cabeza J, Spicuglia S, de la Chapelle AL, Heidemann M, Hintermair C, Eick D, Gut I, Ferrier P, Andrau JC. Transcription initiation platforms and GTF recruitment at tissue-specific enhancers and promoters. Nature Structural & Molecular Biology. July 2011, 18 (8): 956–63. PMID 21765417. doi:10.1038/nsmb.2085. 
  8. ^ Wang D, Garcia-Bassets I, Benner C, Li W, Su X, Zhou Y, Qiu J, Liu W, Kaikkonen MU, Ohgi KA, Glass CK, Rosenfeld MG, Fu XD. Reprogramming transcription by distinct classes of enhancers functionally defined by eRNA. Nature. May 2011, 474 (7351): 390–4. PMC 3117022可免费查阅. PMID 21572438. doi:10.1038/nature10006. 
  9. ^ Ren B. Transcription: Enhancers make non-coding RNA. Nature. May 2010, 465 (7295): 173–4. PMID 20463730. doi:10.1038/465173a. 
  10. ^ Obrdlik A, Kukalev A, Louvet E, Farrants AK, Caputo L, Percipalle P. The histone acetyltransferase PCAF associates with actin and hnRNP U for RNA polymerase II transcription. Molecular and Cellular Biology. October 2008, 28 (20): 6342–57. PMC 2577438可免费查阅. PMID 18710935. doi:10.1128/MCB.00766-08. 
  11. ^ Melo CA, Drost J, Wijchers PJ, van de Werken H, de Wit E, Oude Vrielink JA; et al. eRNAs are required for p53-dependent enhancer activity and gene transcription.. Mol Cell. 2013, 49 (3): 524–35. PMID 23273978. doi:10.1016/j.molcel.2012.11.021. 
  12. ^ Feng J, Bi C, Clark BS, Mady R, Shah P, Kohtz JD. The Evf-2 noncoding RNA is transcribed from the Dlx-5/6 ultraconserved region and functions as a Dlx-2 transcriptional coactivator. Genes & Development. June 2006, 20 (11): 1470–84. PMC 1475760可免费查阅. PMID 16705037. doi:10.1101/gad.1416106. 
  13. ^ Gu X, Wang L, Boldrup L, Coates PJ, Fahraeus R, Sgaramella N; et al. AP001056.1, A Prognosis-Related Enhancer RNA in Squamous Cell Carcinoma of the Head and Neck.. Cancers (Basel). 2019, 11 (3). PMC 6468641可免费查阅. PMID 30862109. doi:10.3390/cancers11030347.