KEGG

KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes：日本語にほんごでは「京都きょうと遺伝子いでんしゲノム百科ひゃっか事典じてん」の意味いみ）は、遺伝子いでんしやタンパク質たんぱくしつ、代謝たいしゃ、シグナル伝達でんたつなどの分子ぶんし間あいだネットワークに関かんする情報じょうほうを統合とうごうしたデータベースであり、バイオインフォマティクス研究けんきゅうに利用りようされる。このデータベースは、細胞さいぼうレベルでの生命せいめいシステムの機能きのうに関かんする知識ちしきを、分子ぶんし間あいだ相互そうご作用さようネットワーク（代謝たいしゃ、シグナル伝達でんたつ、遺伝いでん情報じょうほう等とう）の二に項こう関係かんけいに基もとづいた情報じょうほうとしてデータベース化かし (PATHWAY)、これを中心ちゅうしんに据すえているのが特徴とくちょうである。さらに遺伝子いでんしカタログ情報じょうほう (GENES)、既知きちのタンパク質たんぱくしつ間あいだの配列はいれつ相あい同性どうせい情報じょうほう (SSDB)、機能きのう的てき類似るいじ性せい情報じょうほう (KO)、生体せいたい関連かんれん化学かがく物質ぶっしつに関かんする情報じょうほう (LIGAND) などに関かんする各かくデータベースを統合とうごうし、単たんなるカタログ的てきデータベースではなく、生命せいめいの設計せっけい図ずを構築こうちくするための知識ちしきベースを目指めざしている。

KEGG

内容ないよう
生物せいぶつ	全すべて
コンタクト
研究けんきゅう拠点きょてん	京都大学きょうとだいがく
研究所けんきゅうじょ	京都大学きょうとだいがく化学かがく研究所けんきゅうじょ Kanehisa Laboratories
作者さくしゃ	金きむ久實くみ
主要しゅよう引用いんよう	PMID 10592173
公開こうかい日び	1995年ねん
アクセス
ウェブサイト	www.kegg.jp
WebサービスURL	RESTはKEGG APIを参照さんしょう
ツール
ウェブ	KEGG Mapper
その他た

生物せいぶつ種しゅとしては、ヒトのほか動物どうぶつ・微生物びせいぶつを中心ちゅうしんとした各種かくしゅモデル生物せいぶつが対象たいしょうとされており、種たねによる異同いどうを調しらべたり、ネットワークの2要素ようその間あいだで可能かのうな経路けいろを計算けいさんするなどが可能かのうとなっている。

1995年ねんに京都大学きょうとだいがく化学かがく研究所けんきゅうじょの金きむ久實くみらによるプロジェクトとして発足ほっそくし、整備せいびが続つづけられ、ウェブ上うえで公開こうかいされている。

KEGG PATHWAY

KEGG PATHWAYデータベースは、KEGGのコアとなる分子ぶんし間あいだ相互そうご作用さようネットワークの配線はいせん図ず(パスウェイマップ)に関かんするデータベースである。パスウェイマップには遺伝子いでんし、化合かごう物ぶつ、化学かがく反応はんのう、疾患しっかん情報じょうほうなど KEGG の他ほかのデータベース内ないの個々ここのエントリが関連付かんれんづけられている。パスウェイマップは、下記かきに分類ぶんるいされる。

• 代謝たいしゃ
• 遺伝いでん情報処理じょうほうしょり
• 環境かんきょう情報処理じょうほうしょり
• 細胞さいぼうプロセス
• 生体せいたいシステム
• ヒト疾患しっかん
• 医薬品いやくひん開発かいはつ

購読こうどくモデル

2011年ねん7月がつ、KEGG はFTPアクセスによるフラットファイルのダウンロードに対たいして購読こうどくモデルを導入どうにゅうした。

関連かんれん項目こうもく

• バイオインフォマティクス
• システム生物せいぶつ学がく
• 代謝たいしゃマップ
• オントロジー
• 遺伝子いでんしオントロジー

外部がいぶリンク

• KEGG サイト
• ミラーサイト
  • Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（英語えいご）
  • KEGG Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（日本語にほんご）
  • PATHWAY（英語えいご）
  • KEGG API（英語えいご） - REST形式けいしきのWebインタフェース