核 かく 局在 きょくざい 化 か シグナル または核 かく 局在 きょくざい 化 か 配列 はいれつ (英 えい : nuclear localization signal/sequence 、略称 りゃくしょう : NLS )とは、タンパク質 たんぱくしつ を細胞 さいぼう 核 かく へ輸送 ゆそう する目印 めじるし となるアミノ酸 あみのさん 配列 はいれつ のことである。核 かく 移行 いこう シグナル とも呼 よ ばれる。一般 いっぱん 的 てき にこのシグナルはタンパク質 たんぱくしつ 表面 ひょうめん に露出 ろしゅつ しており、正 まさ に帯電 たいでん したリシン またはアルギニン からなる、1つまたは複数 ふくすう の短 みじか い配列 はいれつ によって構成 こうせい される。異 こと なる核 かく 局在 きょくざい タンパク質 たんぱくしつ が同 おな じNLSを持 も っていることもある。NLSは、核 かく 外 がい 搬出 はんしゅつ シグナル (NES)の反対 はんたい の機能 きのう を持 も つ。
classical(典型 てんけい 的 てき 、古典 こてん 的 てき ) [ 編集 へんしゅう ]
このタイプのNLSは、単 たん 節 ふし 型 がた (monopartite)と双 そう 節 ふし 型 がた (bipartite)に分類 ぶんるい される。両者 りょうしゃ の主要 しゅよう な構造 こうぞう 的 てき 差異 さい は、双 そう 節 ふし 型 がた NLSでは2つの塩基 えんき 性 せい アミノ酸 あみのさん クラスターが比較的 ひかくてき 短 みじか いスペーサー配列 はいれつ で隔 へだ てられている一方 いっぽう 、単 たん 節 ふし 型 がた は分離 ぶんり されていないという点 てん である。最初 さいしょ に発見 はっけん されたNLSはSV40ラージT抗原 こうげん (英語 えいご 版 ばん ) の PKKKRK V という配列 はいれつ (単 たん 節 ふし 型 がた )である[1] 。ヌクレオプラズミン (英語 えいご 版 ばん ) のNLSである KR PAATKKAGQAKKKK は、2つの塩基 えんき 性 せい アミノ酸 あみのさん クラスターが約 やく 10アミノ酸 あみのさん のスペーサー配列 はいれつ で隔 へだ てられた、双 そう 節 ふし 型 がた NLSの典型 てんけい 例 れい である[2] 。どちらのシグナルもインポーチンα あるふぁ (英語 えいご 版 ばん ) によって認識 にんしき される。インポーチンα あるふぁ 自体 じたい も双 そう 節 ふし 型 がた NLSを持 も っており、インポーチンβ べーた によって特異 とくい 的 てき に認識 にんしき される。実際 じっさい に核 かく への輸送 ゆそう を媒介 ばいかい しているのはインポーチンβ べーた であると考 かんが えられている。
Chelskyらは単 たん 節 ふし 型 がた NLSのコンセンサス配列 はいれつ は K-K/R-X-K/R であると提唱 ていしょう した[3] 。Chelskyらの配列 はいれつ は双 そう 節 ふし 型 がた NLSの下流 かりゅう の塩基 えんき 性 せい クラスターの一部 いちぶ である可能 かのう 性 せい もある。MakkerhらはSV40ラージT抗原 こうげん (単 たん 節 ふし 型 がた )、c-Myc (単 たん 節 ふし 型 がた )、ヌクレオプラズミン(双 そう 節 ふし 型 がた )のNLSに対 たい し変異 へんい 導入 どうにゅう による比較 ひかく 実験 じっけん を行 おこな い、これら3種類 しゅるい のNLSに共通 きょうつう したアミノ酸 あみのさん の特徴 とくちょう があることを示 しめ した。また、中性 ちゅうせい または酸性 さんせい のアミノ酸 あみのさん もNLSの輸送 ゆそう 効率 こうりつ に寄与 きよ していることが初 はじ めて示 しめ された[4] 。
Rotelloらは、SV40ラージT抗原 こうげん 、ヌクレオプラズミン(AVKRPAATKKAGQAKKKKLD)、EGL-13(MSRRRKANPTKLSENAKKLAKEVEN)、c-Myc(PAAKRVKLD)、TUSタンパク質 たんぱくしつ (KLKIKRPVK)のNLSを付加 ふか したeGFP の核 かく への輸送 ゆそう 効率 こうりつ の比較 ひかく を行 おこな い、c-MycのNLSの核 かく 局在 きょくざい 効率 こうりつ がSV40のNLSと比較 ひかく してきわめて高 たか いことを発見 はっけん した[5] 。
non-classical(非 ひ 典型 てんけい 的 てき 、非 ひ 古典 こてん 的 てき ) [ 編集 へんしゅう ]
hnRNP A1 の酸性 さんせい のM9ドメイン、酵母 こうぼ の転写 てんしゃ 抑制 よくせい 因子 いんし Matα あるふぁ 2の KIPIK 配列 はいれつ 、U snRNP に存在 そんざい する複雑 ふくざつ なシグナルなど、他 た のタイプのNLSも多 おお く存在 そんざい する。これらのNLSの大 だい 部分 ぶぶん は、インポーチンα あるふぁ 様 さま タンパク質 たんぱくしつ の介在 かいざい なしに、インポーチンβ べーた ファミリーの特異 とくい 的 てき 受容 じゅよう 体 たい によって直接 ちょくせつ 認識 にんしき されているようである[6] 。
大量 たいりょう に産 さん 生 む され輸送 ゆそう されるリボソームタンパク質 しつ には特異 とくい 的 てき なシグナルが存在 そんざい するようであり[7] [8] 、特別 とくべつ なインポーチンβ べーた 様 さま 核 かく 内 ない 輸送 ゆそう 受容 じゅよう 体 たい が伴 ともな っているようである[9] 。
近年 きんねん 、PY-NLSとして知 し られるタイプのNLSが、Leeらによって提唱 ていしょう されている[10] 。このPY-NLSモチーフは、その名前 なまえ はプロリン -チロシン のアミノ酸 あみのさん ペアが存在 そんざい することに由来 ゆらい するが、インポーチンβ べーた 2 (英語 えいご 版 ばん ) (トランスポーチン、カリオフェリンβ べーた 2としても知 し られる)に結合 けつごう し、積 つ み荷 に タンパク質 たんぱくしつ を核 かく 内 ない へ輸送 ゆそう する。インポーチンβ べーた 2へ結合 けつごう したPY-NLSの構造 こうぞう が決定 けってい され、核 かく 内 ない 輸送 ゆそう の阻害 そがい 剤 ざい が設計 せっけい されている[11] 。
細胞 さいぼう のDNA を隔離 かくり する核 かく 膜 まく の存在 そんざい は、真 ま 核 かく 細胞 さいぼう の定義 ていぎ となる特徴 とくちょう である。核 かく 膜 まく はDNAの複製 ふくせい やRNA の転写 てんしゃ といった核 かく 内 ない の過程 かてい と、細胞 さいぼう 質 しつ で行 おこな われるタンパク質 たんぱくしつ の産 さん 生 せい の過程 かてい を隔 へだ てており、核 かく 内 ない で必要 ひつよう とされるタンパク質 たんぱくしつ は何 なん らかの機構 きこう によって核 かく 内 ない へ輸送 ゆそう されなければならない。核 かく 内 ない タンパク質 たんぱくしつ が核 かく に蓄積 ちくせき する性質 せいしつ に対 たい しての最初 さいしょ の直接的 ちょくせつてき な実験 じっけん は、ジョン・ガードン によって行 おこな われた。彼 かれ は、精製 せいせい された核 かく 内 ない タンパク質 たんぱくしつ がアフリカツメガエル の卵 たまご 母 はは 細胞 さいぼう の細胞 さいぼう 質 しつ へ注入 ちゅうにゅう された後 のち 、核 かく へ蓄積 ちくせき することを示 しめ した。この実験 じっけん は、後 のち に核 かく のリプログラミング の研究 けんきゅう へとつながり、幹 みき 細胞 さいぼう 研究 けんきゅう と直接 ちょくせつ 関連 かんれん することとなる一連 いちれん の研究 けんきゅう の一部 いちぶ として行 おこな われたものであった。
卵 たまご 母 はは 細胞 さいぼう の核 かく 膜 まく には数 すう 百 ひゃく 万 まん の核 かく 膜 まく 孔 あな 複 ふく 合体 がったい が存在 そんざい し、それらは多 おお くの異 こと なる分子 ぶんし (インスリン 、ウシ血清 けっせい アルブミン 、金 きむ ナノ粒子 りゅうし )を通過 つうか させるように見 み えたため、核 かく 膜 まく 孔 あな は開 ひら いたチャネルであり、核 かく 内 ない タンパク質 たんぱくしつ は核 かく 膜 まく 孔 あな を通 とお って自由 じゆう に核 かく 内 ない に進入 しんにゅう し、DNAや核 かく 内 ない の何 なん らかの要素 ようそ に結合 けつごう することで核 かく へ蓄積 ちくせき すると考 かんが えられた。い換 いか えれば、特異 とくい 的 てき な輸送 ゆそう 機構 きこう は存在 そんざい しないと考 かんが えられていた。
この考 かんが えは、 1982年 ねん にDingwallとLaskeyによって誤 あやま りであることが示 しめ された。彼 かれ らは、典型 てんけい 的 てき な分子 ぶんし シャペロン であるヌクレオプラズミンと呼 よ ばれるタンパク質 たんぱくしつ を用 もち いて、核 かく 内 ない への進入 しんにゅう のシグナルとして機能 きのう するドメインをタンパク質 たんぱくしつ 内 ない に同定 どうてい した[12] 。この発見 はっけん によって研究 けんきゅう 分野 ぶんや は刺激 しげき を受 う け、2年 ねん 後 ご にはSV40ラージT抗原 こうげん のNLSが初 はじ めて同定 どうてい された。しかし、単純 たんじゅん にSV40のNLSとの類似 るいじ 性 せい に基 もと づいて他 た の核 かく 内 ない タンパク質 たんぱくしつ の機能 きのう 的 てき なNLSを同定 どうてい することはできなかった。実際 じっさい 、細胞 さいぼう 性 せい の(ウイルス性 せい でない)核 かく 内 ない タンパク質 たんぱくしつ でSV40のNLSに類似 るいじ した配列 はいれつ を持 も つものはわずかな割合 わりあい しか存在 そんざい しなかった。ヌクレオプラズミンの詳細 しょうさい な分析 ぶんせき により、スペーサーで隔 へだ てられた2つの塩基 えんき 性 せい アミノ酸 あみのさん からなるエレメントを持 も つ配列 はいれつ が同定 どうてい された。エレメントの1つはSV40のNLSと類似 るいじ していたが、核 かく 局在 きょくざい 性 せい でないレポータータンパク質 たんぱくしつ にそのエレメントを付加 ふか してもタンパク質 たんぱくしつ を細胞 さいぼう 核 かく へ差 さ し向 む けることはできず、核 かく への移動 いどう には双方 そうほう のエレメントが必要 ひつよう であった[13] 。この種類 しゅるい のNLSは双 そう 節 ふし 型 がた 典型 てんけい 的 てき NLSとして知 し られるようになった。現在 げんざい では、双 そう 節 ふし 型 がた NLSは細胞 さいぼう 性 せい の核 かく 内 ない タンパク質 たんぱくしつ に見 み つかるNLSの主要 しゅよう なクラスとなっており[14] 、そのシグナルがどのように受容 じゅよう 体 たい タンパク質 たんぱくしつ (インポーチンα あるふぁ )に認識 にんしき されているのかが構造 こうぞう 解析 かいせき によって明 あき らかにされている[15] (単 たん 節 ふし 型 がた NLSの一部 いちぶ についてもその構造 こうぞう 基盤 きばん が明 あき らかにされている[16] )。核 かく へのタンパク質 たんぱくしつ の輸送 ゆそう の分子 ぶんし 的 てき 詳細 しょうさい の多 おお くが現在 げんざい では知 し られており、輸送 ゆそう は2段階 だんかい の過程 かてい で行 おこな われている。核 かく 移行 いこう タンパク質 たんぱくしつ が核 かく 膜 まく 孔 あな 複 ふく 合体 がったい に結合 けつごう する過程 かてい はエネルギーを必要 ひつよう としない。その後 ご 、核 かく 移行 いこう タンパク質 たんぱくしつ が核 かく 膜 まく 孔 あな のチャネルを通 とお って核 かく 内 ない へトランスロケーションする過程 かてい はエネルギー依存 いぞん 的 てき である[17] [18] 。2つの異 こと なる段階 だんかい が存在 そんざい することが確立 かくりつ されたことによって関与 かんよ 因子 いんし の同定 どうてい のが可能 かのう なものとなり、NLSの受容 じゅよう 体 たい であるインポーチンファミリーとGTPアーゼ であるRan が同定 どうてい されるに至 いた った。
核 かく 輸送 ゆそう の機構 きこう [ 編集 へんしゅう ]
タンパク質 たんぱくしつ は核 かく 膜 まく を通 とお って核 かく へ移行 いこう する。核 かく 膜 まく は、内 うち 膜 まく と外 そと 膜 まく と呼 よ ばれる同心 どうしん 状 じょう の膜 まく から構成 こうせい されている。内 うち 膜 まく と外 そと 膜 まく は複数 ふくすう の部位 ぶい で連結 れんけつ しており、その部位 ぶい が細胞 さいぼう 質 しつ と核質 かくしつ との間 あいだ のチャネルとなっている。これらのチャネルは核 かく 膜 まく 孔 あな 複 ふく 合体 がったい で占 し められている。核 かく 膜 まく 孔 あな 複 ふく 合体 がったい は核 かく 膜 まく を越 こ える輸送 ゆそう を媒介 ばいかい する構造 こうぞう 体 たい であり、複数 ふくすう のタンパク質 たんぱくしつ から構成 こうせい される複 ふく 合体 がったい である。
NLSを持 も つタンパク質 たんぱくしつ はインポーチン に強 つよ く結合 けつごう し、共 とも に複 ふく 合体 がったい として核 かく 膜 まく 孔 あな を通過 つうか する。この時点 じてん でGTP 結合 けつごう 型 がた Ran(Ran-GTP)がインポーチン-タンパク質 たんぱくしつ 複 ふく 合体 がったい に結合 けつごう し、インポーチンのタンパク質 たんぱくしつ に対 たい する親和 しんわ 性 せい の喪失 そうしつ が引 ひ き起 お こされる。タンパク質 たんぱくしつ が解離 かいり すると、今度 こんど はRan-GTP/インポーチン複 ふく 合体 がったい が核 かく 膜 まく 孔 あな を通 とお って核 かく 外 がい へ出 で る。細胞 さいぼう 質 しつ のGTPアーゼ活性 かっせい 化 か タンパク質 たんぱくしつ がRan-GTPをGDP へ加水 かすい 分解 ぶんかい し、Ranのコンフォメーション変化 へんか が引 ひ き起 お こされインポーチンへの親和 しんわ 性 せい が低下 ていか する。インポーチンは解離 かいり し、Ran-GDPは核 かく へ送 おく り返 かえ され、そこでグアニンヌクレオチド交換 こうかん 因子 いんし によってGDPはGTPへと交換 こうかん される。
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