Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
LYL1
Ідентифікатори
Символи
LYL1 , bHLHa18, lymphoblastic leukemia associated hematopoiesis regulator 1, basic helix-loop-helix family member, LYL1 basic helix-loop-helix family member
Зовнішні ІД
OMIM : 151440 MGI: 96891 HomoloGene: 4078 GeneCards: LYL1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein dimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • B cell differentiation • definitive hemopoiesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • blood vessel maturation • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 19: 13.1 – 13.1 Mb
Хр. 8: 85.43 – 85.43 Mb
PubMed search
[1]
[2] Вікідані
LYL1 (англ. LYL1, basic helix-loop-helix family member ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 280 амінокислот , а молекулярна маса — 29 938[4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MCPPQAQAEV GPTMTEKAEM VCAPSPAPAP PPKPASPGPP QVEEVGHRGG
SSPPRLPPGV PVISLGHSRP PGVAMPTTEL GTLRPPLLQL STLGTAPPTL
ALHYHPHPFL NSVYIGPAGP FSIFPSSRLK RRPSHCELDL AEGHQPQKVA
RRVFTNSRER WRQQNVNGAF AELRKLLPTH PPDRKLSKNE VLRLAMKYIG
FLVRLLRDQA AALAAGPTPP GPRKRPVHRV PDDGARRGSG RRAEAAARSQ
PAPPADPDGS PGGAARPIKM EQTALSPEVR
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
Mellentin J.D., Smith S.D., Cleary M.L. (1989). lyl-1, a novel gene altered by chromosomal translocation in T cell leukemia, codes for a protein with a helix-loop-helix DNA binding motif. Cell . 58 : 77—83. PMID 2752424 DOI :10.1016/0092-8674(89)90404-2
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)
(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)
(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)
(1.4) NF-1
(1.5) RF-X
(1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1
підродина 2
підродина 3
підродина 4
підродина 5
підродина 6
підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4
(2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців
(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер
(2.5) Цинкові пальці іншого складу
(2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс
(3.2) Парний бокс
(3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль
(3.4) Фактори теплового шоку
(3.5) Триптофановий кластер
(3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR
(4.2) STAT
(4.3) p53
(4.4) MADS
(4.6) TATA
(4.7) Високомобільна група
(4.9) Grainyhead
(4.10) Домен холодового шоку
(4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y)
(0.3) Pocket домен
(0.5) AP2/EREBP-подібні
(0.6) Інші