ハプログループF (mtDNA)

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ハプログループF (mtDNA)（ハプログループF (ミトコンドリアDNA)、英えい: Haplogroup F (mtDNA)）とは、分子ぶんし人類じんるい学がくで用もちいられる、人類じんるいのミトコンドリアDNAハプログループ（型かた集団しゅうだん）の分類ぶんるいのうち、ハプログループNの子こ系統けいとう「R9」を祖先そせんに持もち「249d」、「6392」、「10310」などの特徴とくちょう的てき変異へんいをもつもので、サブクレードは、F1、F2、F3、F4などである[1]。

概略がいりゃく[編集へんしゅう]

起源きげん[編集へんしゅう]

この型かたの祖そ系けいの「R9」はNから分岐ぶんきした系統けいとうにあたる。

分布ぶんぷ[編集へんしゅう]

ハプログループFは、現在げんざい東南とうなんアジア最大さいだい規模きぼの人口じんこうを持もつグループである[2][3][4][5][6][7][8][9][10][11][12]。 高こう頻度ひんどで見みられる地域ちいきは、ニコバル諸島しょとう（50%）・インドのアルナーチャル・プラデーシュ州しゅう（31%）・ジャワ（28%）・小しょうスンダ列島れっとう（23%）・中国ちゅうごく大陸たいりくの長江ながえ以南いなん（特とくに雲南うんなん省しょうのラフ族ぞく77%・広州こうしゅう26%）・ベトナム（26%）・ラオス・フィリピン（29%）・台湾たいわん原住民げんじゅうみん（27%）・日本にっぽん（5.4%）などである[13]。全体ぜんたいとしてオーストロアジア系けい民族みんぞくやオーストロネシア系けい民族みんぞくで高こう頻度ひんどである。中央ちゅうおうアジアとメラネシアでは低てい頻度ひんどであり、アメリカ大陸あめりかたいりくでは検出けんしゅつされていない[14][15][16]。北きたアジアでもほとんど観察かんさつされないが、例外れいがい的てきにケット人じんにおいては23.7%の中なか頻度ひんどで観察かんさつされる[17]。

日本にっぽんでの分布ぶんぷ[編集へんしゅう]

日本にっぽん列島れっとうでは、沖縄おきなわ・宮崎みやざきをはじめ各かく府県ふけんにも分布ぶんぷし、北海道ほっかいどうにも多少たしょうその痕跡こんせきが見みられることから、縄文じょうもん時代じだいには既すでに南方みなかた諸島しょとうから北上ほくじょうしたことがうかがえ、現在げんざい、日本人にっぽんじんの約やく5.4%がこのハプログループFに属ぞくしている[18][19][20]。

日本人にっぽんじんトップアスリートの身体しんたい能力のうりょくとの関連かんれん[編集へんしゅう]

近年きんねん、日本人にっぽんじんのトップアスリートたちの身体しんたい能力のうりょくとミトコンドリアDNAの研究けんきゅうが進すすむにつれ、瞬発しゅんぱつ系けい・パワー系けいの競技きょうぎ者しゃ群ぐんにおいて、ハプログループFの頻度ひんどが高たかいことが指摘してきされている。これは、ハプログループFは、細胞さいぼう内ないのCa2+濃度のうどの調節ちょうせつや解かい糖とう系けいによるATP生成せいせい速度そくど、筋すじ収縮しゅうしゅくの速度そくどに差さがあるのではないかと指摘してきされている[21]。

系統けいとう樹じゅ[編集へんしゅう]

ハプログループFのサブクレードの系統けいとう樹じゅは、マニス・バン・オーブンとマンフレッド・カイザーの論文ろんぶんに基もとづく[22]。

ヒトのミトコンドリアDNAハプログループの系統けいとう樹じゅ

  ミトコンドリア・イブ (L)    
L0 L1 L5 L2 L6 L4 L3  
  M   N  
M7   M8   M9   D G Q N1   N2   N9   A O S X   R  
M7a C Z E I W Y R0   R9   B JT P  U
HV F J T K
H V

脚注きゃくちゅう[編集へんしゅう]

  1. ^ David Comas, Stephanie Plaza, R. Spencer Wells et al., "Admixture, migrations, and dispersals in Central Asia: evidence from maternal DNA lineages," European Journal of Human Genetics (2004) 12, 495–504. doi:10.1038/sj.ejhg.5201160
  2. ^ Starikovskaya, E. B., Sukernik, R. I., Derbeneva, O. A., Volodko, N. V., Ruiz-Pesini, E., Torroni, A., Brown, M. D., Lott, M. T., Hosseini, S. H., Huoponen, K. and Wallace, D. C. (2005), "Mitochondrial DNA Diversity in Indigenous Populations of the Southern Extent of Siberia, and the Origins of Native American Haplogroups." Annals of Human Genetics, 69: 67–89. doi: 10.1046/j.1529-8817.2003.00127.x
  3. ^ Catherine Hill, Pedro Soares, Maru Mormina et al., "Phylogeography and Ethnogenesis of Aboriginal Southeast Asians," Mol. Biol. Evol. 23(12):2480–2491. (2006) doi:10.1093/molbev/msl124
  4. ^ Catherine Hill, Pedro Soares, Maru Mormina et al., "A Mitochondrial Stratigraphy for Island Southeast Asia," Am. J. Hum. Genet. 2007;80:29–43.
  5. ^ Bo Wen, Xuanhua Xie, Song Gao et al., "Analyses of Genetic Structure of Tibeto-Burman Populations Reveals Sex-Biased Admixture in Southern Tibeto-Burmans," Am. J. Hum. Genet. 74:856–865 (2004)
  6. ^ Bo Wen, Hui Li, Song Gao et al., "Genetic Structure of Hmong-Mien Speaking Populations in East Asia as Revealed by mtDNA Lineages," Mol. Biol. Evol. 22(3):725–734. (2005) doi:10.1093/molbev/msi055
  7. ^ Derenko M, Malyarchuk B, Denisova G, Perkova M, Rogalla U, et al. (2012), "Complete Mitochondrial DNA Analysis of Eastern Eurasian Haplogroups Rarely Found in Populations of Northern Asia and Eastern Europe." PLoS ONE 7(2): e32179. doi:10.1371/journal.pone.0032179
  8. ^ Supannee Kaewsutthi, Nopasak Phasukkijwatana, Yutthana Joyjinda et al., "Mitochondrial Haplogroup Background May Influence Southeast Asian G11778A Leber Hereditary Optic Neuropathy," Investigative Ophthalmology & Visual Science, June 2011, Vol. 52, No. 7
  9. ^ Min-Sheng Peng, Huy Ho Quang, Khoa Pham Dang et al., "Tracing the Austronesian Footprint in Mainland Southeast Asia: A Perspective from Mitochondrial DNA," Mol. Biol. Evol. 27(10):2417–2430. 2010 doi:10.1093/molbev/msq131
  10. ^ Noriyuki Fuku, Kyong Soo Park, Yoshiji Yamada et al., "Mitochondrial Haplogroup N9a Confers Resistance against Type 2 Diabetes in Asians," Am. J. Hum. Genet. 2007; 80:407–415. DOI: 10.1086/512202
  11. ^ Kim W, Yoo T-K, Shin D-J, Rho H-W, Jin H-J, et al. (2008) "Mitochondrial DNA Haplogroup Analysis Reveals no Association between the Common Genetic Lineages and Prostate Cancer in the Korean Population." PLoS ONE 3(5): e2211. doi:10.1371/journal.pone.0002211
  12. ^ Kristina A. Tabbada, Jean Trejaut, Jun-Hun Loo et al., "Philippine Mitochondrial DNA Diversity: A Populated Viaduct between Taiwan and Indonesia?," Mol. Biol. Evol. 27(1):21–31. (2010) doi:10.1093/molbev/msp215
  13. ^ Derenko, Miroslava 2007 Phylogeographic Analysis of Mitochondrial DNA in Northern Asian Populations The American Journal of Human Genetics 81, 5, Nov 07, 1025–1041
  14. ^ M. A. Bermisheva, K. Tambets, R. Villems, and E. K. Khusnutdinova, "Diversity of Mitochondrial DNA Haplogroups in Ethnic Populations of the Volga–Ural Region," Molecular Biology, Vol. 36, No. 6, 2002, pp. 802–812. Translated from Molekulyarnaya Biologiya, Vol. 36, No. 6, 2002, pp. 990–1001.
  15. ^ Simona Fornarino, Maria Pala, Vincenza Battaglia et al., "Mitochondrial and Y-chromosome diversity of the Tharus (Nepal): a reservoir of genetic variation," BMC Evolutionary Biology 2009, 9:154 doi:10.1186/1471-2148-9-154
  16. ^ Ville N Pimenoff, David Comas, Jukka U Palo et al., "Northwest Siberian Khanty and Mansi in the junction of West and East Eurasian gene pools as revealed by uniparental markers," European Journal of Human Genetics (2008) 16, 1254–1264; doi:10.1038/ejhg.2008.101
  17. ^ Starikovskaya, E. B.; Sukernik, R. I.; Derbeneva, O. A.; Volodko, N. V.; Ruiz-Pesini, E.; Torroni, A.; Brown, M. D.; Lott, M. T.; Hosseini, S. H.; Huoponen, K.; Wallace, D. C. (2005). "Mitochondrial DNA Diversity in Indigenous Populations of the Southern Extent of Siberia, and the Origins of Native American Haplogroups". Annals of Human Genetics. 69: 67–89. doi:10.1046/j.1529-8817.2003.00127.x. PMC 3905771Freely accessible. PMID 15638829.
  18. ^ Sayaka Maruyama, Kiyoshi Minaguchi, and Naruya Saitou, "Sequence polymorphisms of the mitochondrial DNA control region and phylogenetic analysis of mtDNA lineages in the Japanese population," Int J Legal Med (2003) 117 : 218–225 DOI 10.1007/s00414-003-0379-2
  19. ^ Asari M et al., "Utility of haplogroup determination for forensic mtDNA analysis in the Japanese population," Leg Med (2007), doi:10.1016/j.legalmed.2007.01.007
  20. ^ Taketo Uchiyama, Rinnosuke Hisazumi, Kenshi Shimizu et al., "Mitochondrial DNA Sequence Variation and Phylogenetic Analysis in Japanese Individuals from Miyazaki Prefecture," Japanese Journal of Forensic Science and Technology 01/2007; 12(1):83-96. DOI:10.3408/jafst.12.83
  21. ^ 『日本人にっぽんじんトップアスリートの身体しんたい運動うんどう能力のうりょくを規定きていするミトコンドリア DNA 多た型がたの探索たんさく』
  22. ^ van Oven, Mannis; Manfred Kayser (13 Oct 2008). “Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation”. Human Mutation 30 (2): E386–E394. doi:10.1002/humu.20921. PMID 18853457. http://www3.interscience.wiley.com/journal/121449735/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0 2009年ねん5月がつ20日はつか閲覧えつらん。. 
  23. ^ PhyloTree.org New in Build 13 (28 Dec 2011)

関連かんれん項目こうもく[編集へんしゅう]


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