肌 はだ 紅 べに 蛋白 たんぱく 的 てき 立體 りったい 圖 ず 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 英語 えいご Secondary structure ）在 ざい 生物 せいぶつ 化學 かがく 結構 けっこう 生物 せいぶつ 學 がく 中 なか 是 ぜ 指 ゆび 一 いち 個 こ 生物 せいぶつ 大分 おおいた 子 こ 蛋白質 たんぱくしつ 核酸 かくさん DNA 或 ある RNA ），局部 きょくぶ 區 く 段 だん 的 てき 三 さん 通 つう 式 しき 然 しか 並 なみ 不 ふ 任 にん 何 なん 特定 とくてい 的 てき 原子 げんし 位置 いち 在 ざい 三 さん 級 きゅう 結構 けっこう 中 ちゅう
二級結構是由生物大分子在原子分辨率結構中所观察到的氫鍵 來 らい 定義 ていぎ 的 てき 蛋白質 たんぱくしつ 的 てき 主 しゅ 中 なか 氨基 之 これ 間 あいだ 的 てき 模 も 式 しき 來 らい 定義 ていぎ 与 あずか 主 しゅ 亦 また 即 そく DSSP 的 てき 定義 ていぎ [1] 核酸 かくさん 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 是 ぜ 鹼基 之 これ 間 あいだ 的 てき 來 らい 定義 ていぎ
在 ざい 二 に 特定 とくてい 的 てき 模 も 式 しき 往往 おうおう 伴 とも 随 ずい 着 ぎ 一 いち 結構 けっこう 特徵 とくちょう 但 ただし 只 ただ 考 こう 征 せい 略 りゃく 本身 ほんみ 所 しょ 定義 ていぎ 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 不 ふ 准 じゅん 例 れい 蛋白質 たんぱくしつ 的 てき 螺旋 らせん 中 ちゅう 的 てき 残 ざん 基 もと 都 と 分布 ぶんぷ 在 ざい 拉 ひしげ 氏 し 二 に 面 めん 角 かく 的 てき 特定 とくてい 區域 くいき 因 いん 螺旋 らせん 論 ろん 否 ひ 真正 しんせい 的 てき 存在 そんざい 稍 やや 微 ほろ 不 ふ 准 じゅん 定義 ていぎ 多 た 是 ぜ 應用 おうよう 曲線 きょくせん 微分 びぶん 幾何 きか 的 てき 觀念 かんねん 曲 きょく 率 りつ 扭量 。也有 やゆう 肉眼 にくがん 通 どおり 件 けん 的 てき 蛋白 たんぱく 決定 けってい 其二 そのじ 級 きゅう 結構 けっこう
對生 たいせい 物 ぶつ 大分 おおいた 子 こ 的 てき 光 ひかり 譜 ふ 來 らい 初步 しょほ 對 たい 蛋白質 たんぱくしつ 最 さい 常用 じょうよう 的 てき 方法 ほうほう 是 ぜ 圓 えん 二 に 色 しょく 性 せい 利用 りよう 長 ちょう 紫外線 しがいせん 波長 はちょう nm ）。在 ざい 的 てき 光 ひかり 吸收 きゅうしゅう 曲 きょく α あるふぁ 螺旋 らせん 結構 けっこう 会 かい 在 ざい 同 どう 小 しょう 和 わ 小 しょう 分別 ふんべつ 表示 ひょうじ 存在 そんざい 无规卷 まき 曲 きょく 和 わ β べーた 折 おり 疊 たたみ 結構 けっこう 紅 べに 外 がい 光 こう 譜 ふ 因 いん 所 しょ 造成 ぞうせい 的 てき 震盪 しんとう 光 ひかり 譜 ふ 中 なか 核 かく 共振 きょうしん 光 ひかり 的 てき 化學 かがく 位 い 移 うつり 由 ゆかり 器 き 和 わ 制 せい 的 てき 原因 げんいん
上面 うわつら 的 てき 包含 ほうがん 可 か 点 てん 蛋白 たんぱく 的 てき 交互 こうご 式 しき PCNA 为演示 しめせ PDB 1AXC )
蛋白質 たんぱくしつ 螺旋 らせん 的 てき [2]
幾何 きか 屬性 ぞくせい α あるふぁ 螺旋 らせん 310 螺旋 らせん
π ぱい 螺旋 らせん
每 まい 一 いち 圈 けん 的 てき 残 ざん 基 もと 3.6
3.0
4.4
每 まい 基 もと 的 てき 翻 こぼし 1.5 Å（0.15 nm）
2.0 Å（0.20 nm）
1.1 Å（0.11 nm）
螺旋 らせん 半径 はんけい 2.3 Å（0.23 nm）
1.9 Å（0.19 nm）
2.8 Å（0.28 nm）
間 あいだ 5.4 Å（0.54 nm）
6.0 Å（0.60 nm）
4.8 Å（0.48 nm）
氫鍵（黃色 おうしょく 點 てん 一 いち 個 こ α あるふぁ 螺旋 らせん 蛋白質 たんぱくしつ 的 てき 氫鍵 所 ところ 調節 ちょうせつ 的 てき 相互 そうご 作用 さよう 最 さい 普遍 ふへん 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう α あるふぁ 螺旋 らせん β べーた 折 おり 疊 たたみ 經 けい 計算 けいさん 後 ご 發現 はつげん 螺旋 らせん 例 れい 310 螺旋 らせん 及π ぱい 螺旋 らせん 在 ざい 能 のう 量 りょう 上 うえ 有 ゆう 著 ちょ 有利 ゆうり 的 てき 模 も 式 しき 但 ただし 螺旋 らせん 在 ざい 自然 しぜん 的 てき 蛋白質 たんぱくしつ 中 ちゅう 是 ぜ 稀有 けう 的 てき 要 よう α あるふぁ 螺旋 らせん 在 ざい 中央 ちゅうおう 進行 しんこう 不利 ふり 的 てき 骨 ほね 架 か 包裝 ほうそう 後 ご 才 ざい 可 か 在 ざい 末端 まったん 中 ちゅう 發現 はつげん 轉 てん 角 かく 鬆 す 開 ひらき 活 かつ 的 てき 環 たまき 會 かい 連結 れんけつ 更 さら 多 た 規則 きそく 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 任意 にんい 形 がた 並 なみ 非 ひ 真正 しんせい 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 但 ただし
胺基酸 さん 在 ざい 形成 けいせい 不同 ふどう 的 てき 脯氨酸 さん 及甘 あま 會 かい 在 ざい 轉 てん 角 かく 上 うえ 出現 しゅつげん 並 なみ 瓦解 がかい α あるふぁ 螺旋 らせん 骨 こつ 架 か 的 てき 規則 きそく 形態 けいたい 但 ただし 兩者 りょうしゃ 著 ちょ 不 ふ 正常 せいじょう 的 てき 形態 けいたい 能力 のうりょく 在 ざい 蛋白質 たんぱくしつ 採用 さいよう 螺旋 らせん 形態 けいたい 的 てき 酸 さん 有 ゆう 蛋氨酸 さん 、丙 へい 亮 あきら 穀 こく 賴 よりゆき 酸 さん 單 たん 字母 じぼ 編 へん 號 ごう 為 ため 相反 あいはん 大型 おおがた 的 てき 芳香 ほうこう 性 せい 殘 ざん 基 もと 色 いろ 酪氨酸 さん 及苯丙氨酸 ）及Cβ べーた 分 ぶん 枝 えだ 的 てき 酸 さん 異 い 亮 あきら 纈氨酸 さん 及蘇 そ 則 のり 採用 さいよう β べーた 折 おり 疊 たたみ 形態 けいたい 但 ただし 是 ぜ 若 わか 單 たん 序列 じょれつ 來 らい 看 み 都 と 不足 ふそく 構成 こうせい
DSSP是 ぜ 的 てき 縮寫 しゅくしゃ 三 さん 結構 けっこう 的 てき 蛋白質 たんぱくしつ 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 編 へん 號 ごう 一般 いっぱん 是 ぜ 用 よう 單一 たんいつ 英文 えいぶん 字母 じぼ 來 らい 蛋白質 たんぱくしつ 二 に 級 きゅう 結構 けっこう [3] 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 是 ぜ 根據 こんきょ 氫鍵 模 も 式 しき 來 らい 指定 してい 的 てき [4] [5]
G：3轉 てん 角 かく 螺旋 らせん 亦 また 即 そく 10 螺旋 らせん 最 さい 短長 たんちょう 度 ど 為 ため 個 こ 殘 ざん 基 もと
H：4轉 てん 角 かく 螺旋 らせん α あるふぁ 螺旋 らせん 最 さい 短長 たんちょう 度 ど 為 ため 個 こ 殘 ざん 基 もと
I：5轉 てん 角 かく 螺旋 らせん π ぱい 螺旋 らせん 最 さい 短長 たんちょう 度 ど 為 ため 個 こ 殘 ざん 基 もと
T：氫鍵轉 てん 角 かく 或 ある 個 こ 轉 てん 角 かく
E：平行 へいこう 的 てき β べーた 折 おり 疊 たたみ 或 ある 平行 へいこう 的 てき 折 おり 疊 たたみ 形態 けいたい 延伸 えんしん 最 さい 短長 たんちょう 度 ど 為 ため 個 こ 殘 ざん 基 もと
B：獨立 どくりつ β べーた 橋 はし 殘 ざん 基 もと 一對 いっつい β べーた 折 おり 疊 たたみ
S：彎曲 わんきょく 唯 ただ 一 いち 非 ひ 的 てき 指定 してい 所有 しょゆう 不 ふ 是 ぜ 以上 いじょう 形態 けいたい 的 てき 殘 ざん 基 もと 在 ざい 都 と 是 ぜ 格 かく 來 らい 指定 してい 的 てき 時 じ 則 のり 來 らい 代表 だいひょう 捲 めく 曲 きょく 或 ある 來 らい 代表 だいひょう 環 たまき 螺旋 らせん 即 そく 疊 たたみ 形態 けいたい 都 と 需要 じゅよう 一定 いってい 的 てき 長 ちょう 度 ど 是 ぜ 指 ゆび 兩個 りゃんこ 在 ざい 一 いち 級 きゅう 結構 けっこう 的 てき 殘 ざん 基 もと 必須 ひっす 形成 けいせい 相 しょう 同 どう 的 てき 模 も 式 しき 螺旋 らせん 或 ある 折 おり 疊 たたみ 的 てき 模 も 式 しき 太 ふとし 短 たん 分別 ふんべつ 或 ある 來 き 編 へん 當 とう 中 なか 亦 また 有 ゆう 蛋白質 たんぱくしつ 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 編 へん 號 ごう 但 ただし 少 しょう 使用 しよう
由 よし 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 是 ぜ 氫鍵 來 らい 定義 ていぎ 所以 ゆえん 的 てき 正確 せいかく 定義 ていぎ 十 じゅう 分 ふん 重要 じゅうよう 靜 しずか 電 でん 模型 もけい 對 たい 羰基 的 てき 碳 及氧 ，指定 してい 的 てき 電荷 でんか 分別 ふんべつ 為 ため
±
q
1
≡
0.42
e
{\displaystyle \pm q_{1}\equiv 0.42e}
而對於氨基 的 てき 氮 及氫 ，指定 してい 的 てき 電荷 でんか 則 そく 分別 ふんべつ 為 ため
±
q
2
≡
0.20
e
{\displaystyle \pm q_{2}\equiv 0.20e}
而靜電 でん 能 のう 是 ぜ
E
=
q
1
q
2
[
1
r
O
N
+
1
r
C
H
−
1
r
O
H
−
1
r
C
N
]
∗
332
k
c
a
l
/
m
o
l
{\displaystyle E=q_{1}q_{2}\left[{\frac {1}{r_{ON}}}+{\frac {1}{r_{CH}}}-{\frac {1}{r_{OH}}}-{\frac {1}{r_{CN}}}\right]*332\ \mathrm {kcal/mol} }
根據 こんきょ 少 しょう 才 ざい 會 かい 存在 そんざい 上述 じょうじゅつ 的 てき 方程式 ほうていしき 都 と 只 ただ 是 ぜ 但 ただし 都 と
蛋白質 たんぱくしつ 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 預 あずか 測 はか [ 编辑 ] 早期 そうき 蛋白質 たんぱくしつ 胺基酸 さん 形成 けいせい 螺旋 らせん 或 ある 折 おり 疊 たたみ 的 てき 傾向 けいこう 時 じ 同 どう 形成 けいせい 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 的 てき 能 のう 量 りょう 的 てき 方法 ほうほう 來 らい 使用 しよう 方法 ほうほう 在 ざい 預 あずか 測 はか 殘 ざん 基 もと 的 てき 三 さん 種 しゅ 狀態 じょうたい 螺旋 らせん 折 おり 疊 たたみ 或 ある 捲 めく 曲 きょく 可 か 約 やく 的 てき 準 じゅん 確 かく 性 せい 若 わか 使用 しよう 多重 たじゅう 序列 じょれつ 比 ひ 對 たい 可 か 準 じゅん 確 かく 性 せい 大幅 おおはば 提 ひさげ 升 ます 至 いたり 多 た 序列 じょれつ 比 ひ 對 たい 可 か 道 どう 酸 さん 在 ざい 某 ぼう 包括 ほうかつ 在 ざい 附近 ふきん 的 てき 位置 いち 一般 いっぱん 在 ざい 每 まい 一邊 いっぺん 的 てき 個 こ 殘 ざん 基 もと 演 えんじ 化 か 過程 かてい 提供 ていきょう 了 りょう 結構 けっこう 趨向 すうこう 更 さら 明確 めいかく 的 てき 圖畫 ずが 例 れい 在 ざい 蛋白質 たんぱくしつ 某 ぼう 位置 いち 的 てき 甘 あま 本身 ほんみ 已 やめ 表明 ひょうめい 那 な 是 ぜ 一 いち 個 こ 任意 にんい 形 がた 但 ただし 是 ぜ 多 た 序列 じょれつ 對比 たいひ 可 か 發現 はつげん 在 ざい 接近 せっきん 十 じゅう 億 おく 年 ねん 演 えんじ 化 か 後 ご 的 てき 蛋白質 たんぱくしつ 中 ちゅう 那 な 是 ぜ 再 さい 者 しゃ 若 わか 在 ざい 那 な 位置 いち 檢 けん 測 はか 平均 へいきん 疏水 そすい 性 せい 亦 また 會 かい 發現 はつげん 殘 ざん 基 もと 可溶性 かようせい 是 ぜ 與 あずか α あるふぁ 螺旋 らせん 一致 いっち 綜合 そうごう 來 らい 說 せつ 因 いん 素 もと 顯示 けんじ 原 ばら 先 さき 蛋白質 たんぱくしつ 是 ぜ α あるふぁ 螺旋 らせん 結構 けっこう 任意 にんい 形 がた 多種 たしゅ 方法 ほうほう 都會 とかい 結合 けつごう 已 やめ 有 ゆう 的 てき 數 すう 據 よりどころ 來 らい 組成 そせい 方法 ほうほう 有 ゆう 神經 しんけい 網 もう 路 ろ 隱 かくれ 馬 ば 爾 しか 可 か 夫 おっと 模型 もけい 支持 しじ 向 こう 量 りょう 機 き 現代 げんだい 預 あずか 測 はか 方法 ほうほう 亦 また 可 か 在 ざい 每 ごと
二級結構預測方法一直不斷地在校準，例 れい EVA 實驗 じっけん 基 もと 個 こ 星 ほし 期 き 的 てき 測 はか 試 こころみ 最 さい 準 じゅん 確 かく 的 てき 方法 ほうほう 要 よう 算 さん 是 ぜ PsiPRED （页面存 そん ，存 そん 互联网档案 あん ）、SAM [永久 えいきゅう 失效 しっこう 連結 れんけつ PORTER 、PROF 及SABLE （页面存 そん ，存 そん 互联网档案 あん ）。有 ゆう 趣 おもむき 的 てき 是 ぜ 在 ざい 種 しゅ 方法 ほうほう 中 ちゅう 共 ども 一致 いっち 並 なみ 不能 ふのう 提 ひさげ 升 ます 的 てき 準 じゅん 確 かく 性 せい 最大 さいだい 改善 かいぜん 的 てき 地方 ちほう 似 に 在 ざい β べーた 股 また 的 てき 預 あずか 測 はか 因 いん 為所 しどころ 使用 しよう 的 てき 方法 ほうほう 會 かい 忽 ゆるがせ 視 し 一 いち β べーた 股 また 段 だん 整體 せいたい 上 じょう 最高 さいこう 的 てき 預 あずか 測 はか 準 じゅん 確 かく 性 せい 只 ただ 可 か 因 いん 的 てき 標準 ひょうじゅん 方法 ほうほう 的 てき 性質 せいしつ 與 あずか 校 こう 準 じゅん 的 てき 預 あずか 測 はか 相 あい 違背 いはい
準 じゅん 確 かく 的 てき 三 さん 級 きゅう 結構 けっこう 預 あずか 測 はか 的 てき 重要 じゅうよう 原 げん 素 もと 例 れい 一 いち 個 こ 確定 かくてい 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 模 も 式 しき 鐵 てつ 還 かえ 原 げん 蛋白 たんぱく 的 てき 記號 きごう
核酸 かくさん 亦 また 有 ゆう 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 大部 おおぶ 是 ぜ 單 たん 股 また 核 かく 糖 とう 核酸 かくさん [來 らい 源 みなもと 請求 せいきゅう 分子 ぶんし 的 てき 鹼基對 たい ）及不同 どう 種類 しゅるい 的 てき 環 たまき 被 ひ 螺旋 らせん 圍繞 いじょう 的 てき 不 ふ 成 なり 對 たい 核 かく 莖 くき 環 たまき 結構 けっこう 是 ぜ 末端 まったん 為 ため 短 みじか 少 しょう 的 てき 不 ふ 成 なり 對 たい 環 たまき 莖 くき 環 たまき 結構 けっこう 非常 ひじょう 普遍 ふへん 並 なみ 建 けん 型 がた 结构模 も 体 たい ，如三 さん 葉 よう 草 そう 結構 けっこう 即 そく 轉 うたて 運 うん 中 なか 的 てき 四 よん 個 こ 螺旋 らせん 結 ゆい 點 てん 的 てき 基本 きほん 單位 たんい 結構 けっこう 在 ざい 長 ちょう 對 たい 螺旋 らせん 中 ちゅう 的 てき 短 たん 成 なり 對 たい 出 で 在 ざい 螺旋 らせん 股 また 中 ちゅう 額 がく 外 がい 插入 そうにゅう 但 ただし 相對 そうたい 股 また 中 ちゅう 沒 ぼつ 有配 ゆうはい 對 たい 的 てき 亦 また 常會 じょうかい 出現 しゅつげん 最後 さいご 偽 にせ 結 ゆい 亦 また 會 かい 出現 しゅつげん 在 ざい
由 よし 是 ぜ 確定 かくてい 在 ざい 但 ただし 是 ぜ 傳統 でんとう 的 てき 華 はな 生 せい 克 かつ 里 さと 克 かつ 對 たい 並 なみ 非 ひ 唯 ただ 一 いち 在 ざい 的 てき 配 はい 對 たい 方法 ほうほう 霍氏配 はい 對 たい 方法 ほうほう 亦 また 普遍 ふへん
DNA的 てき 双 そう 螺旋 らせん 脱 だつ 糖 とう 核酸 かくさん 的 てき 特 とく 型 がた 双 そう 螺旋 らせん 型 がた 双 そう 螺旋 らせん 型 がた 双 そう 螺旋 らせん [6] 除 じょ 了 りょう 上述 じょうじゅつ 常 つね 二 に 型 がた 型 がた 和 わ 型 がた 外 そと 内 ない 在 ざい 特殊 とくしゅ 条件下 じょうけんか 亦 また 可 か 形成 けいせい 非 ひ 二 に 曲 きょく 十字形 じゅうじがた 三 さん 螺旋 らせん 滑 すべり 和 わ 翻 こぼし 等 とう [6]
二 に 級 きゅう 結構 けっこう 預 あずか 測 はか [ 编辑 ] 生物 せいぶつ 信 しん 息 いき 學 がく 的 てき RNA 二級結構來搜尋用作RNA功 こう 能 のう 形式 けいしき 編 へん 基 もと 因 いん 組 ぐみ 來 らい 說 せつ 小 しょう 分子 ぶんし 有 ゆう 著 ちょ 由 ゆかり 小 しょう 中斷 ちゅうだん 的 てき 長 ちょう 莖 くき 環 たまき 結構 けっこう 計算 けいさん 可能 かのう 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 可 か 動態 どうたい 規 ぶんまわし 方法 ほうほう 但 ただし 是 ぜ 不能 ふのう 出 で 偽 にせ 結 ゆい 或 ある 是 ぜ 對 たい 沒 ぼつ 有 ゆう 全面 ぜんめん 網羅 もうら 的 てき 情況 じょうきょう 通用 つうよう 的 てき 方法 ほうほう 有 ゆう 隨 ずい 機 き 上下 じょうげ 文 ぶん 無關 むせき 語法 ごほう Mfold 是 ぜ
在 ざい 分子 ぶんし 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 對 たい 正常 せいじょう 功 こう 能 のう 非常 ひじょう 重要 じゅうよう 有 ゆう 時 じ 序列 じょれつ 重要 じゅうよう 助 すけ 用 よう 分析 ぶんせき 非 ひ 編 へん 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 可 か 電腦 でんのう 來 らい 提 ひさげ 升 ます 預 あずか 測 はか 準 じゅん 確 かく 性 せい [7] 他 た 生物 せいぶつ 信 しん 息 いき 學 がく 的 てき 應用 おうよう 會 かい 使用 しよう
蛋白質 たんぱくしつ RNA 二級結構都可以用在協助多重 たじゅう 序列 じょれつ 比 ひ 對 たい 比 ひ 對 たい 在 ざい 加入 かにゅう 有 ゆう 關 せき 的 てき 二 に 級 きゅう 結構 けっこう 資料 しりょう 後 ご 可 か 得 どく 更 さら 為 ため 準 じゅん 確 かく 但 ただし 有 ゆう 時 じ 對 たい 太 ふと 有用 ゆうよう 由 よし 鹼基對 たい 比 ひ 序列 じょれつ 更 さら 高度 こうど 保存 ほぞん 一 いち 不能 ふのう 比 ひ 對 たい 一 いち 級 きゅう 結構 けっこう 的 てき 蛋白質 たんぱくしつ
蛋白 たんぱく 二 に
蛋白 たんぱく 二 に
氨基酸 さん
倾向于产生 せい 螺旋 らせん 的 てき 酸 さん 倾向于产生 せい 延 のべ 展 てん 的 てき 酸 さん 倾向于产生 せい 的 てき 酸 さん 无产生 せい 任 にん 何 なん 的 てき 酸 さん
![{\displaystyle E=q_{1}q_{2}\left[{\frac {1}{r_{ON}}}+{\frac {1}{r_{CH}}}-{\frac {1}{r_{OH}}}-{\frac {1}{r_{CN}}}\right]*332\ \mathrm {kcal/mol} }](https://wikimedia.org/api/rest_v1/media/math/render/svg/a3d1e8288de134883df06a047e45cfd307537e48)
. PMID 16578412. doi:10.1073/pnas.37.11.729. (The original beta-sheet conformation article.)
